Protein–RNA interactions for Protein: J3KT08

Uncharacterized protein (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 172 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
J3KT08 CASP16P-202ENST00000575497 2161 ntTSL 2 BASIC13.17□□□□□ -0.3
J3KT08 GTF2IP1-210ENST00000622829 3605 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
J3KT08 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC13.17□□□□□ -0.3
J3KT08 CREBBP-201ENST00000262367 10803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
J3KT08 TSPAN3-201ENST00000267970 6467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
J3KT08 RUBCNL-203ENST00000378787 2731 ntTSL 2 BASIC13.17□□□□□ -0.3
J3KT08 RAB40C-203ENST00000535977 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
J3KT08 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
J3KT08 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC13.17□□□□□ -0.3
J3KT08 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.17□□□□□ -0.3
J3KT08 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
J3KT08 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
J3KT08 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
J3KT08 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC13.17□□□□□ -0.3
J3KT08 IQGAP2-201ENST00000274364 5844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
J3KT08 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
J3KT08 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
J3KT08 NF2-201ENST00000334961 2020 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
J3KT08 ENC1-201ENST00000302351 5520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
J3KT08 WNK2-201ENST00000297954 7138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
J3KT08 HEY2-201ENST00000368364 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
J3KT08 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC13.16□□□□□ -0.3
J3KT08 IL17RE-206ENST00000454190 2757 ntTSL 2 BASIC13.16□□□□□ -0.3
J3KT08 BMP2K-201ENST00000335016 3804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
J3KT08 BMP2K-208ENST00000628286 3848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
J3KT08 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
J3KT08 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.16□□□□□ -0.3
J3KT08 AL139384.1-201ENST00000612143 3047 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
J3KT08 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC13.16□□□□□ -0.3
J3KT08 ARHGEF28-212ENST00000513042 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
J3KT08 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC13.16□□□□□ -0.3
J3KT08 PPM1H-201ENST00000228705 6353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
J3KT08 CARMIL2-201ENST00000334583 4687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
J3KT08 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC13.16□□□□□ -0.3
J3KT08 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
J3KT08 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
J3KT08 ADRA1B-201ENST00000306675 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
J3KT08 DOK7-206ENST00000515886 2263 ntTSL 2 BASIC13.16□□□□□ -0.3
J3KT08 JADE2-204ENST00000402835 2797 ntTSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
J3KT08 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
J3KT08 MINK1-202ENST00000355280 4961 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
J3KT08 KIAA1147-202ENST00000536163 7296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
J3KT08 HIPK1-207ENST00000369561 3777 ntTSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
J3KT08 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
J3KT08 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
J3KT08 PKMYT1-201ENST00000262300 2171 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
J3KT08 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
J3KT08 PTPN5-202ENST00000396166 2299 ntTSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
J3KT08 IFRD1-202ENST00000403825 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
J3KT08 INPP4A-204ENST00000409540 3231 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
J3KT08 CSNK1D-203ENST00000392334 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
J3KT08 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
J3KT08 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
J3KT08 SET-201ENST00000322030 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
J3KT08 ARHGAP6-202ENST00000337414 5117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
J3KT08 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
J3KT08 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
J3KT08 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
J3KT08 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
J3KT08 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
J3KT08 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
J3KT08 PCDHGC5-202ENST00000610789 2763 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
J3KT08 MCCC1-214ENST00000610757 2410 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
J3KT08 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
J3KT08 LONP1-201ENST00000360614 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
J3KT08 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.15□□□□□ -0.3
J3KT08 NLE1-203ENST00000586869 5286 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
J3KT08 TNFSF11-203ENST00000398795 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
J3KT08 AL691447.2-201ENST00000454869 2162 ntTSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
J3KT08 AL032819.2-201ENST00000624543 2162 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
J3KT08 FAM129C-205ENST00000595684 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
J3KT08 ACYP2-203ENST00000406041 1913 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
J3KT08 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
J3KT08 DAGLB-204ENST00000436575 2385 ntTSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
J3KT08 VAV1-201ENST00000304076 2825 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
J3KT08 NEO1-202ENST00000339362 7342 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
J3KT08 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.31
J3KT08 GRK4-203ENST00000398052 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
J3KT08 PGRMC2-208ENST00000613358 3783 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
J3KT08 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.31
J3KT08 CERS5-203ENST00000422340 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
J3KT08 AC104581.1-202ENST00000635932 2618 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
J3KT08 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
J3KT08 NCAN-201ENST00000252575 6387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
J3KT08 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
J3KT08 EI24-201ENST00000278903 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
J3KT08 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
J3KT08 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
J3KT08 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
J3KT08 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
J3KT08 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
J3KT08 LSM11-201ENST00000286307 6584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
J3KT08 AHSA2-202ENST00000394457 6574 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
J3KT08 CNTNAP3-201ENST00000297668 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
J3KT08 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
J3KT08 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
J3KT08 INPP5J-207ENST00000405300 2515 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
J3KT08 MARK2-201ENST00000350490 2903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
J3KT08 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
J3KT08 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.5 ms