Protein–RNA interactions for Protein: H3BQV1

Uncharacterized protein (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 296 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H3BQV1 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
H3BQV1 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
H3BQV1 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
H3BQV1 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
H3BQV1 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC24.74■■□□□ 1.55
H3BQV1 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
H3BQV1 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
H3BQV1 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
H3BQV1 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
H3BQV1 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
H3BQV1 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
H3BQV1 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
H3BQV1 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
H3BQV1 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
H3BQV1 ZNF664-207ENST00000539644 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
H3BQV1 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
H3BQV1 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
H3BQV1 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
H3BQV1 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
H3BQV1 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
H3BQV1 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
H3BQV1 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
H3BQV1 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC24.73■■□□□ 1.55
H3BQV1 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
H3BQV1 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
H3BQV1 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC24.73■■□□□ 1.55
H3BQV1 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
H3BQV1 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
H3BQV1 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
H3BQV1 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
H3BQV1 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC24.72■■□□□ 1.55
H3BQV1 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
H3BQV1 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
H3BQV1 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
H3BQV1 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
H3BQV1 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC24.72■■□□□ 1.55
H3BQV1 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
H3BQV1 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC24.72■■□□□ 1.55
H3BQV1 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
H3BQV1 SNX18-203ENST00000381410 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
H3BQV1 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
H3BQV1 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
H3BQV1 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
H3BQV1 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
H3BQV1 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
H3BQV1 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
H3BQV1 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC24.71■■□□□ 1.55
H3BQV1 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
H3BQV1 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
H3BQV1 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
H3BQV1 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
H3BQV1 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
H3BQV1 LAMC3-202ENST00000361069 6133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
H3BQV1 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
H3BQV1 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
H3BQV1 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.55
H3BQV1 BICRA-204ENST00000614245 5697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.55
H3BQV1 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC24.7■■□□□ 1.55
H3BQV1 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.55
H3BQV1 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
H3BQV1 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
H3BQV1 DENND6A-201ENST00000311128 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
H3BQV1 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
H3BQV1 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
H3BQV1 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
H3BQV1 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
H3BQV1 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC24.7■■□□□ 1.54
H3BQV1 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC24.7■■□□□ 1.54
H3BQV1 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
H3BQV1 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
H3BQV1 AFDN-202ENST00000351017 5823 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
H3BQV1 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
H3BQV1 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
H3BQV1 FGFR2-224ENST00000613048 4369 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
H3BQV1 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
H3BQV1 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
H3BQV1 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
H3BQV1 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
H3BQV1 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
H3BQV1 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
H3BQV1 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
H3BQV1 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
H3BQV1 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
H3BQV1 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
H3BQV1 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
H3BQV1 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
H3BQV1 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
H3BQV1 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
H3BQV1 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
H3BQV1 B4GALT5-201ENST00000371711 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
H3BQV1 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
H3BQV1 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
H3BQV1 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
H3BQV1 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
H3BQV1 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
H3BQV1 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
H3BQV1 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
H3BQV1 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
H3BQV1 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
H3BQV1 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.2 ms