Protein–RNA interactions for Protein: F8W1W9

NPIPB9, Nuclear pore complex-interacting protein family member B9, humanhuman

Predictions only

Length 429 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NPIPB9F8W1W9 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC19.52■□□□□ 0.72
NPIPB9F8W1W9 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
NPIPB9F8W1W9 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC19.52■□□□□ 0.72
NPIPB9F8W1W9 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
NPIPB9F8W1W9 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
NPIPB9F8W1W9 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC19.52■□□□□ 0.72
NPIPB9F8W1W9 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
NPIPB9F8W1W9 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
NPIPB9F8W1W9 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
NPIPB9F8W1W9 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC19.52■□□□□ 0.72
NPIPB9F8W1W9 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
NPIPB9F8W1W9 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
NPIPB9F8W1W9 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
NPIPB9F8W1W9 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.71
NPIPB9F8W1W9 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
NPIPB9F8W1W9 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
NPIPB9F8W1W9 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
NPIPB9F8W1W9 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
NPIPB9F8W1W9 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC19.51■□□□□ 0.71
NPIPB9F8W1W9 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
NPIPB9F8W1W9 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
NPIPB9F8W1W9 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC19.51■□□□□ 0.71
NPIPB9F8W1W9 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC19.51■□□□□ 0.71
NPIPB9F8W1W9 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
NPIPB9F8W1W9 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
NPIPB9F8W1W9 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
NPIPB9F8W1W9 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
NPIPB9F8W1W9 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
NPIPB9F8W1W9 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
NPIPB9F8W1W9 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
NPIPB9F8W1W9 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
NPIPB9F8W1W9 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
NPIPB9F8W1W9 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
NPIPB9F8W1W9 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
NPIPB9F8W1W9 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
NPIPB9F8W1W9 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
NPIPB9F8W1W9 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
NPIPB9F8W1W9 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
NPIPB9F8W1W9 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC19.5■□□□□ 0.71
NPIPB9F8W1W9 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC19.5■□□□□ 0.71
NPIPB9F8W1W9 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC19.5■□□□□ 0.71
NPIPB9F8W1W9 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
NPIPB9F8W1W9 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
NPIPB9F8W1W9 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
NPIPB9F8W1W9 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
NPIPB9F8W1W9 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
NPIPB9F8W1W9 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
NPIPB9F8W1W9 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
NPIPB9F8W1W9 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
NPIPB9F8W1W9 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
NPIPB9F8W1W9 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
NPIPB9F8W1W9 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
NPIPB9F8W1W9 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
NPIPB9F8W1W9 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
NPIPB9F8W1W9 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
NPIPB9F8W1W9 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
NPIPB9F8W1W9 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
NPIPB9F8W1W9 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
NPIPB9F8W1W9 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
NPIPB9F8W1W9 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
NPIPB9F8W1W9 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC19.49■□□□□ 0.71
NPIPB9F8W1W9 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
NPIPB9F8W1W9 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
NPIPB9F8W1W9 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
NPIPB9F8W1W9 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
NPIPB9F8W1W9 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
NPIPB9F8W1W9 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
NPIPB9F8W1W9 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
NPIPB9F8W1W9 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
NPIPB9F8W1W9 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
NPIPB9F8W1W9 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
NPIPB9F8W1W9 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
NPIPB9F8W1W9 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
NPIPB9F8W1W9 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
NPIPB9F8W1W9 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
NPIPB9F8W1W9 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
NPIPB9F8W1W9 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
NPIPB9F8W1W9 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
NPIPB9F8W1W9 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
NPIPB9F8W1W9 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
NPIPB9F8W1W9 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC19.48■□□□□ 0.71
NPIPB9F8W1W9 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
NPIPB9F8W1W9 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
NPIPB9F8W1W9 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
NPIPB9F8W1W9 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
NPIPB9F8W1W9 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
NPIPB9F8W1W9 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
NPIPB9F8W1W9 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
NPIPB9F8W1W9 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
NPIPB9F8W1W9 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
NPIPB9F8W1W9 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
NPIPB9F8W1W9 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC19.47■□□□□ 0.71
NPIPB9F8W1W9 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
NPIPB9F8W1W9 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
NPIPB9F8W1W9 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC19.47■□□□□ 0.71
NPIPB9F8W1W9 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC19.47■□□□□ 0.71
NPIPB9F8W1W9 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
NPIPB9F8W1W9 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
NPIPB9F8W1W9 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
NPIPB9F8W1W9 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.9 ms