Protein–RNA interactions for Protein: C9JE40

PATL2, Protein PAT1 homolog 2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 543 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PATL2C9JE40 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
PATL2C9JE40 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
PATL2C9JE40 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.44■■□□□ 1.66
PATL2C9JE40 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC25.44■■□□□ 1.66
PATL2C9JE40 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
PATL2C9JE40 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC25.44■■□□□ 1.66
PATL2C9JE40 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
PATL2C9JE40 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
PATL2C9JE40 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
PATL2C9JE40 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
PATL2C9JE40 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
PATL2C9JE40 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
PATL2C9JE40 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
PATL2C9JE40 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
PATL2C9JE40 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
PATL2C9JE40 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
PATL2C9JE40 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
PATL2C9JE40 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
PATL2C9JE40 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
PATL2C9JE40 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
PATL2C9JE40 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
PATL2C9JE40 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
PATL2C9JE40 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
PATL2C9JE40 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC25.42■■□□□ 1.66
PATL2C9JE40 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC25.42■■□□□ 1.66
PATL2C9JE40 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC25.42■■□□□ 1.66
PATL2C9JE40 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
PATL2C9JE40 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
PATL2C9JE40 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
PATL2C9JE40 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
PATL2C9JE40 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
PATL2C9JE40 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
PATL2C9JE40 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
PATL2C9JE40 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
PATL2C9JE40 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC25.41■■□□□ 1.66
PATL2C9JE40 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
PATL2C9JE40 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
PATL2C9JE40 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
PATL2C9JE40 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
PATL2C9JE40 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
PATL2C9JE40 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
PATL2C9JE40 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
PATL2C9JE40 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
PATL2C9JE40 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
PATL2C9JE40 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
PATL2C9JE40 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
PATL2C9JE40 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC25.4■■□□□ 1.66
PATL2C9JE40 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
PATL2C9JE40 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
PATL2C9JE40 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
PATL2C9JE40 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
PATL2C9JE40 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
PATL2C9JE40 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
PATL2C9JE40 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
PATL2C9JE40 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
PATL2C9JE40 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
PATL2C9JE40 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
PATL2C9JE40 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC25.39■■□□□ 1.66
PATL2C9JE40 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
PATL2C9JE40 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
PATL2C9JE40 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC25.39■■□□□ 1.66
PATL2C9JE40 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
PATL2C9JE40 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
PATL2C9JE40 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
PATL2C9JE40 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
PATL2C9JE40 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
PATL2C9JE40 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
PATL2C9JE40 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
PATL2C9JE40 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
PATL2C9JE40 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
PATL2C9JE40 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
PATL2C9JE40 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
PATL2C9JE40 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
PATL2C9JE40 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
PATL2C9JE40 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC25.38■■□□□ 1.65
PATL2C9JE40 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
PATL2C9JE40 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC25.38■■□□□ 1.65
PATL2C9JE40 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
PATL2C9JE40 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC25.38■■□□□ 1.65
PATL2C9JE40 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
PATL2C9JE40 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
PATL2C9JE40 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
PATL2C9JE40 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
PATL2C9JE40 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
PATL2C9JE40 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
PATL2C9JE40 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
PATL2C9JE40 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
PATL2C9JE40 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
PATL2C9JE40 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
PATL2C9JE40 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
PATL2C9JE40 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
PATL2C9JE40 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
PATL2C9JE40 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
PATL2C9JE40 ARID1B-220ENST00000636930 8246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
PATL2C9JE40 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
PATL2C9JE40 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
PATL2C9JE40 ESYT2-201ENST00000251527 5960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
PATL2C9JE40 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
PATL2C9JE40 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
PATL2C9JE40 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.2 ms