Protein–RNA interactions for Protein: C9JCN9

HSBP1L1, Heat shock factor-binding protein 1-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 74 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HSBP1L1C9JCN9 ZNF554-201ENST00000317243 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
HSBP1L1C9JCN9 PTDSS1-202ENST00000517309 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
HSBP1L1C9JCN9 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
HSBP1L1C9JCN9 SGSM2-202ENST00000426855 4734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
HSBP1L1C9JCN9 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
HSBP1L1C9JCN9 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
HSBP1L1C9JCN9 PCDH7-206ENST00000543491 4457 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
HSBP1L1C9JCN9 FAM206A-201ENST00000322940 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
HSBP1L1C9JCN9 PLCH2-203ENST00000378486 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
HSBP1L1C9JCN9 PLCH2-204ENST00000419816 4837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
HSBP1L1C9JCN9 IRX4-208ENST00000622814 2398 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
HSBP1L1C9JCN9 NDOR1-201ENST00000344894 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
HSBP1L1C9JCN9 NFATC4-231ENST00000557451 5613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
HSBP1L1C9JCN9 MARK2-208ENST00000508192 2924 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
HSBP1L1C9JCN9 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
HSBP1L1C9JCN9 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
HSBP1L1C9JCN9 RAB5A-201ENST00000273047 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
HSBP1L1C9JCN9 ITGAV-202ENST00000374907 6903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
HSBP1L1C9JCN9 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
HSBP1L1C9JCN9 EIF4E3-201ENST00000295612 2764 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
HSBP1L1C9JCN9 RASA4B-201ENST00000306682 2589 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
HSBP1L1C9JCN9 BAG3-201ENST00000369085 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
HSBP1L1C9JCN9 PRDM1-202ENST00000369091 2612 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
HSBP1L1C9JCN9 MARK2-209ENST00000509502 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
HSBP1L1C9JCN9 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC15.61■□□□□ 0.09
HSBP1L1C9JCN9 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
HSBP1L1C9JCN9 SEPT8-216ENST00000620483 4335 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
HSBP1L1C9JCN9 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
HSBP1L1C9JCN9 DUSP4-201ENST00000240100 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
HSBP1L1C9JCN9 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
HSBP1L1C9JCN9 YAP1-209ENST00000537274 5350 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
HSBP1L1C9JCN9 WNT7B-202ENST00000409496 2285 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
HSBP1L1C9JCN9 FOXO3-201ENST00000343882 7308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
HSBP1L1C9JCN9 TINCR-201ENST00000448587 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
HSBP1L1C9JCN9 SOX2-201ENST00000325404 2513 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
HSBP1L1C9JCN9 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
HSBP1L1C9JCN9 MYO1B-202ENST00000339514 5026 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
HSBP1L1C9JCN9 LRCH4-201ENST00000310300 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
HSBP1L1C9JCN9 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
HSBP1L1C9JCN9 NR6A1-202ENST00000373584 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
HSBP1L1C9JCN9 OPRK1-205ENST00000612786 5196 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
HSBP1L1C9JCN9 SIMC1-203ENST00000429602 2694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
HSBP1L1C9JCN9 BRPF1-203ENST00000424362 4712 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
HSBP1L1C9JCN9 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
HSBP1L1C9JCN9 ARNTL-203ENST00000403290 2746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
HSBP1L1C9JCN9 ACVR1B-201ENST00000257963 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
HSBP1L1C9JCN9 IRF7-205ENST00000397574 1968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
HSBP1L1C9JCN9 ATPAF1-214ENST00000576409 4158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
HSBP1L1C9JCN9 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
HSBP1L1C9JCN9 CCDC127-201ENST00000296824 9342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
HSBP1L1C9JCN9 IGSF9B-206ENST00000533871 5050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
HSBP1L1C9JCN9 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
HSBP1L1C9JCN9 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
HSBP1L1C9JCN9 TMPO-204ENST00000393053 2374 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
HSBP1L1C9JCN9 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
HSBP1L1C9JCN9 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
HSBP1L1C9JCN9 LINC01979-201ENST00000576738 5271 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
HSBP1L1C9JCN9 ITGBL1-202ENST00000376180 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
HSBP1L1C9JCN9 RECK-201ENST00000377966 4888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
HSBP1L1C9JCN9 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
HSBP1L1C9JCN9 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
HSBP1L1C9JCN9 PTPN12-201ENST00000248594 3406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
HSBP1L1C9JCN9 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
HSBP1L1C9JCN9 BRD4-202ENST00000360016 3240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
HSBP1L1C9JCN9 UTP4-201ENST00000314423 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
HSBP1L1C9JCN9 LMLN-204ENST00000420910 2423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
HSBP1L1C9JCN9 NFATC2-206ENST00000609943 5690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
HSBP1L1C9JCN9 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
HSBP1L1C9JCN9 KMT5A-202ENST00000402868 3140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
HSBP1L1C9JCN9 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
HSBP1L1C9JCN9 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
HSBP1L1C9JCN9 PELI2-201ENST00000267460 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
HSBP1L1C9JCN9 BLCAP-208ENST00000414542 2205 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
HSBP1L1C9JCN9 ARHGEF19-201ENST00000270747 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
HSBP1L1C9JCN9 LRRC4B-202ENST00000599957 3019 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
HSBP1L1C9JCN9 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
HSBP1L1C9JCN9 LANCL3-201ENST00000378619 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
HSBP1L1C9JCN9 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
HSBP1L1C9JCN9 RGMB-207ENST00000513185 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
HSBP1L1C9JCN9 FST-201ENST00000256759 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
HSBP1L1C9JCN9 MLLT1-201ENST00000252674 4507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
HSBP1L1C9JCN9 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
HSBP1L1C9JCN9 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
HSBP1L1C9JCN9 GLCCI1-201ENST00000223145 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
HSBP1L1C9JCN9 KIAA1147-202ENST00000536163 7296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
HSBP1L1C9JCN9 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
HSBP1L1C9JCN9 FOXP4-205ENST00000409208 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
HSBP1L1C9JCN9 TP53BP2-201ENST00000343537 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
HSBP1L1C9JCN9 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
HSBP1L1C9JCN9 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC15.58■□□□□ 0.09
HSBP1L1C9JCN9 RUVBL2-206ENST00000595090 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
HSBP1L1C9JCN9 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
HSBP1L1C9JCN9 HSD17B12-201ENST00000278353 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
HSBP1L1C9JCN9 STARD3-201ENST00000336308 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
HSBP1L1C9JCN9 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
HSBP1L1C9JCN9 SLC6A9-201ENST00000357730 2168 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
HSBP1L1C9JCN9 SPG7-202ENST00000341316 2288 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
HSBP1L1C9JCN9 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
HSBP1L1C9JCN9 USP48-204ENST00000400301 4309 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
HSBP1L1C9JCN9 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.2 ms