Protein–RNA interactions for Protein: B4DEV8

Proteasome subunit alpha type, humanhuman

Predictions only

Length 164 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
B4DEV8 PRSS12-201ENST00000296498 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
B4DEV8 NAT8L-201ENST00000331662 5571 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
B4DEV8 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
B4DEV8 SPTBN4-202ENST00000352632 8676 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
B4DEV8 DOK1-201ENST00000233668 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
B4DEV8 BRICD5-201ENST00000328540 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
B4DEV8 DLG3-202ENST00000374355 5074 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
B4DEV8 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
B4DEV8 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
B4DEV8 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
B4DEV8 SRSF4-201ENST00000373795 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
B4DEV8 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC16.61■□□□□ 0.25
B4DEV8 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
B4DEV8 GTF3C5-202ENST00000372097 2406 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
B4DEV8 TMEM235-201ENST00000374946 2409 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
B4DEV8 AFG3L1P-217ENST00000557444 2447 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
B4DEV8 AL035252.2-201ENST00000454676 3168 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
B4DEV8 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
B4DEV8 RBM45-207ENST00000616198 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
B4DEV8 ZNF276-208ENST00000568064 2203 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
B4DEV8 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
B4DEV8 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
B4DEV8 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
B4DEV8 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
B4DEV8 PRDM8-202ENST00000415738 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
B4DEV8 PIF1-202ENST00000333425 2278 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
B4DEV8 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
B4DEV8 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
B4DEV8 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
B4DEV8 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
B4DEV8 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
B4DEV8 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
B4DEV8 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
B4DEV8 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
B4DEV8 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
B4DEV8 NFIB-207ENST00000397579 3129 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
B4DEV8 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
B4DEV8 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
B4DEV8 IL17RC-205ENST00000413608 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
B4DEV8 CD82-201ENST00000227155 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
B4DEV8 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC16.59■□□□□ 0.25
B4DEV8 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
B4DEV8 DMRT2-205ENST00000382255 2367 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
B4DEV8 SMPDL3A-203ENST00000539041 1755 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
B4DEV8 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
B4DEV8 RETREG2-203ENST00000430297 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
B4DEV8 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
B4DEV8 CDK13-202ENST00000340829 5066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
B4DEV8 AP005212.1-201ENST00000581547 1997 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
B4DEV8 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
B4DEV8 HMOX2-208ENST00000570646 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
B4DEV8 TRPC1-203ENST00000476941 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
B4DEV8 BIN2-210ENST00000615107 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
B4DEV8 IL1R1-205ENST00000410023 5143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
B4DEV8 CRHR1-203ENST00000339069 2490 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
B4DEV8 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
B4DEV8 HNRNPA3-204ENST00000435711 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
B4DEV8 NR1D2-201ENST00000312521 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
B4DEV8 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
B4DEV8 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
B4DEV8 FOLH1-203ENST00000343844 2258 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
B4DEV8 RGS11-204ENST00000397770 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
B4DEV8 SET-201ENST00000322030 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
B4DEV8 MARK2-208ENST00000508192 2924 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
B4DEV8 MAPKAPK2-202ENST00000367103 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
B4DEV8 SCARF2-202ENST00000622235 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
B4DEV8 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
B4DEV8 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
B4DEV8 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
B4DEV8 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
B4DEV8 ASPG-201ENST00000546892 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
B4DEV8 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
B4DEV8 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
B4DEV8 ISCA1-203ENST00000375991 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
B4DEV8 SMPD1-201ENST00000342245 2452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
B4DEV8 DSCAM-201ENST00000400454 8552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
B4DEV8 BHLHE22-201ENST00000321870 3262 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
B4DEV8 ME2-218ENST00000640965 2476 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
B4DEV8 CYB561-213ENST00000581573 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
B4DEV8 SCUBE1-201ENST00000290460 2258 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
B4DEV8 TCAIM-203ENST00000396078 2178 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
B4DEV8 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
B4DEV8 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
B4DEV8 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
B4DEV8 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
B4DEV8 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
B4DEV8 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
B4DEV8 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
B4DEV8 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
B4DEV8 DRD5-201ENST00000304374 2330 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
B4DEV8 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
B4DEV8 ERLIN1-203ENST00000421367 5792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
B4DEV8 RNPEPL1-201ENST00000270357 5658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
B4DEV8 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
B4DEV8 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
B4DEV8 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
B4DEV8 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
B4DEV8 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
B4DEV8 PLCD1-201ENST00000334661 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
B4DEV8 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.8 ms