Protein–RNA interactions for Protein: B1AMM8

LINC00587, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00587, humanhuman

Predictions only

Length 73 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00587B1AMM8 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
LINC00587B1AMM8 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
LINC00587B1AMM8 RPP25-201ENST00000322177 3049 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
LINC00587B1AMM8 ACBD3-201ENST00000366812 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
LINC00587B1AMM8 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
LINC00587B1AMM8 CDC42BPB-201ENST00000361246 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
LINC00587B1AMM8 ZBP1-202ENST00000395822 2073 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
LINC00587B1AMM8 SENP6-201ENST00000327284 2700 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
LINC00587B1AMM8 SEPT2-245ENST00000616972 3446 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
LINC00587B1AMM8 LRWD1-201ENST00000292616 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
LINC00587B1AMM8 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
LINC00587B1AMM8 RGS9BP-201ENST00000334176 2894 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
LINC00587B1AMM8 AC007040.2-201ENST00000606025 4170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
LINC00587B1AMM8 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.17
LINC00587B1AMM8 SLC2A5-201ENST00000377414 2344 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
LINC00587B1AMM8 CDAN1-201ENST00000356231 4637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
LINC00587B1AMM8 PLCD1-201ENST00000334661 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
LINC00587B1AMM8 PJA1-201ENST00000361478 2755 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
LINC00587B1AMM8 ZFP92-201ENST00000338647 6105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
LINC00587B1AMM8 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
LINC00587B1AMM8 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC16.08■□□□□ 0.16
LINC00587B1AMM8 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
LINC00587B1AMM8 PTPN5-202ENST00000396166 2299 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
LINC00587B1AMM8 ERLIN1-203ENST00000421367 5792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
LINC00587B1AMM8 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
LINC00587B1AMM8 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
LINC00587B1AMM8 MAP4K4-210ENST00000425019 4403 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
LINC00587B1AMM8 EGLN2-201ENST00000303961 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
LINC00587B1AMM8 PPTC7-201ENST00000354300 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
LINC00587B1AMM8 CASR-204ENST00000638421 5088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
LINC00587B1AMM8 SAMD11-211ENST00000616125 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
LINC00587B1AMM8 GATA6-201ENST00000269216 3770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
LINC00587B1AMM8 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
LINC00587B1AMM8 CCNI2-201ENST00000378731 2355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
LINC00587B1AMM8 UBE2D2-202ENST00000398733 2702 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
LINC00587B1AMM8 MEN1-201ENST00000312049 2761 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
LINC00587B1AMM8 RAPGEF5-203ENST00000405243 2800 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
LINC00587B1AMM8 ELL2-201ENST00000237853 6046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
LINC00587B1AMM8 FGFR3-210ENST00000613647 4438 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
LINC00587B1AMM8 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
LINC00587B1AMM8 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
LINC00587B1AMM8 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
LINC00587B1AMM8 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
LINC00587B1AMM8 SUMF2-201ENST00000275607 1894 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
LINC00587B1AMM8 REM2-201ENST00000267396 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
LINC00587B1AMM8 LRRC25-202ENST00000595840 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
LINC00587B1AMM8 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
LINC00587B1AMM8 DTX2-211ENST00000446600 2281 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
LINC00587B1AMM8 P2RY6-208ENST00000540124 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
LINC00587B1AMM8 SYT3-206ENST00000600079 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
LINC00587B1AMM8 NOV-201ENST00000259526 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
LINC00587B1AMM8 B4GALT2-202ENST00000356836 2629 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
LINC00587B1AMM8 PRMT2-203ENST00000355680 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
LINC00587B1AMM8 JRK-211ENST00000615982 2823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
LINC00587B1AMM8 ZSWIM8-220ENST00000604524 5465 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
LINC00587B1AMM8 ST8SIA2-201ENST00000268164 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
LINC00587B1AMM8 AL445433.2-201ENST00000425113 2544 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
LINC00587B1AMM8 MAFF-206ENST00000538320 2458 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.06■□□□□ 0.16
LINC00587B1AMM8 CBX1-202ENST00000393408 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
LINC00587B1AMM8 SAMD11-213ENST00000618181 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
LINC00587B1AMM8 HMOX2-208ENST00000570646 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
LINC00587B1AMM8 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
LINC00587B1AMM8 NDUFAF6-203ENST00000396124 1798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
LINC00587B1AMM8 MGAT3-201ENST00000341184 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
LINC00587B1AMM8 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
LINC00587B1AMM8 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
LINC00587B1AMM8 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
LINC00587B1AMM8 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
LINC00587B1AMM8 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
LINC00587B1AMM8 MTHFD1L-211ENST00000611279 3475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
LINC00587B1AMM8 EDEM1-201ENST00000256497 6146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
LINC00587B1AMM8 EDN3-204ENST00000371028 2397 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
LINC00587B1AMM8 RTN4RL2-201ENST00000335099 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
LINC00587B1AMM8 INAVA-202ENST00000413687 2197 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
LINC00587B1AMM8 APP-202ENST00000348990 3355 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
LINC00587B1AMM8 HCN1-202ENST00000634658 4738 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
LINC00587B1AMM8 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
LINC00587B1AMM8 HMOX2-218ENST00000619913 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
LINC00587B1AMM8 CYP2A6-201ENST00000301141 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
LINC00587B1AMM8 ZNF302-214ENST00000613363 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC16.05■□□□□ 0.16
LINC00587B1AMM8 DLG3-202ENST00000374355 5074 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
LINC00587B1AMM8 SRCIN1-213ENST00000617146 7058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
LINC00587B1AMM8 FAM124A-202ENST00000322475 4761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
LINC00587B1AMM8 AL391005.1-201ENST00000623953 2435 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
LINC00587B1AMM8 AIRE-201ENST00000291582 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
LINC00587B1AMM8 CYTH1-209ENST00000589296 2159 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
LINC00587B1AMM8 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
LINC00587B1AMM8 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
LINC00587B1AMM8 RIMBP3C-201ENST00000331505 5475 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
LINC00587B1AMM8 MEN1-205ENST00000377316 2868 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
LINC00587B1AMM8 XKR8-201ENST00000373884 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
LINC00587B1AMM8 NR4A1-203ENST00000394824 2639 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
LINC00587B1AMM8 SLC43A1-201ENST00000278426 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
LINC00587B1AMM8 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
LINC00587B1AMM8 NR1H2-211ENST00000599105 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
LINC00587B1AMM8 LRP3-201ENST00000253193 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
LINC00587B1AMM8 FAM109B-201ENST00000321753 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
LINC00587B1AMM8 ZNF446-203ENST00000594369 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
LINC00587B1AMM8 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
LINC00587B1AMM8 PLEKHG5-206ENST00000377748 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.8 ms