Protein–RNA interactions for Protein: A8K830

COLCA2, Colorectal cancer-associated protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 154 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COLCA2A8K830 THOP1-202ENST00000395212 1877 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
COLCA2A8K830 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
COLCA2A8K830 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
COLCA2A8K830 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
COLCA2A8K830 EGFL7-203ENST00000371699 2125 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
COLCA2A8K830 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
COLCA2A8K830 FAM151B-201ENST00000282226 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
COLCA2A8K830 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
COLCA2A8K830 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
COLCA2A8K830 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
COLCA2A8K830 GPAA1-201ENST00000355091 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
COLCA2A8K830 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
COLCA2A8K830 FAM198A-202ENST00000430121 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
COLCA2A8K830 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
COLCA2A8K830 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
COLCA2A8K830 CCDC3-201ENST00000378825 2731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
COLCA2A8K830 HAPLN4-201ENST00000291481 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
COLCA2A8K830 CNNM3-201ENST00000305510 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
COLCA2A8K830 CEP78-201ENST00000277082 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
COLCA2A8K830 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
COLCA2A8K830 ZNF419-201ENST00000221735 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
COLCA2A8K830 SYN2-206ENST00000621198 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
COLCA2A8K830 MTSS1L-204ENST00000616026 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
COLCA2A8K830 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
COLCA2A8K830 TLK2-203ENST00000346027 3449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
COLCA2A8K830 SNAP47-202ENST00000366759 2362 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
COLCA2A8K830 SSH3-202ENST00000308298 2046 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
COLCA2A8K830 P4HB-201ENST00000331483 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
COLCA2A8K830 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
COLCA2A8K830 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
COLCA2A8K830 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
COLCA2A8K830 CTSH-201ENST00000220166 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
COLCA2A8K830 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
COLCA2A8K830 SLC16A3-201ENST00000392339 2074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
COLCA2A8K830 SLC16A3-202ENST00000392341 2086 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
COLCA2A8K830 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
COLCA2A8K830 LINC00304-201ENST00000321214 2243 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
COLCA2A8K830 COL9A3-201ENST00000343916 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
COLCA2A8K830 TM7SF3-201ENST00000343028 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
COLCA2A8K830 MAFK-201ENST00000343242 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
COLCA2A8K830 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
COLCA2A8K830 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
COLCA2A8K830 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
COLCA2A8K830 PI4KB-213ENST00000529142 2603 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
COLCA2A8K830 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
COLCA2A8K830 CHPF-201ENST00000243776 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
COLCA2A8K830 PAQR4-202ENST00000318782 2793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
COLCA2A8K830 USP39-204ENST00000409766 2033 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
COLCA2A8K830 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
COLCA2A8K830 UMOD-202ENST00000396134 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
COLCA2A8K830 TMEM44-203ENST00000381975 2197 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
COLCA2A8K830 ZNF582-202ENST00000586929 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
COLCA2A8K830 ZNF668-202ENST00000394983 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
COLCA2A8K830 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
COLCA2A8K830 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
COLCA2A8K830 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
COLCA2A8K830 ADORA2A-201ENST00000337539 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
COLCA2A8K830 INAVA-202ENST00000413687 2197 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
COLCA2A8K830 YTHDC2-207ENST00000515883 2629 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
COLCA2A8K830 ADORA2A-215ENST00000618076 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
COLCA2A8K830 FAM160A2-201ENST00000265978 3481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
COLCA2A8K830 NOC2LP1-202ENST00000452600 2235 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
COLCA2A8K830 LPAR2-202ENST00000542587 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
COLCA2A8K830 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
COLCA2A8K830 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
COLCA2A8K830 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
COLCA2A8K830 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
COLCA2A8K830 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC16.41■□□□□ 0.22
COLCA2A8K830 HLX-201ENST00000366903 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
COLCA2A8K830 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
COLCA2A8K830 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
COLCA2A8K830 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
COLCA2A8K830 FGFBP3-201ENST00000311575 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
COLCA2A8K830 TUBGCP3-202ENST00000375669 2723 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
COLCA2A8K830 VMAC-201ENST00000339485 2254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
COLCA2A8K830 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
COLCA2A8K830 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
COLCA2A8K830 PRSS12-201ENST00000296498 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
COLCA2A8K830 EDN3-204ENST00000371028 2397 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
COLCA2A8K830 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
COLCA2A8K830 FAM189B-204ENST00000368368 2609 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
COLCA2A8K830 AL139099.2-201ENST00000555043 2469 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
COLCA2A8K830 OGG1-203ENST00000302036 2220 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
COLCA2A8K830 SLC35E4-202ENST00000406566 2081 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
COLCA2A8K830 SMIM10L2A-201ENST00000417443 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
COLCA2A8K830 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
COLCA2A8K830 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
COLCA2A8K830 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
COLCA2A8K830 KSR1-205ENST00000509603 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
COLCA2A8K830 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
COLCA2A8K830 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
COLCA2A8K830 GTPBP2-202ENST00000307126 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
COLCA2A8K830 AL138752.2-201ENST00000540557 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
COLCA2A8K830 C19orf25-202ENST00000436106 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
COLCA2A8K830 FBXL22-202ENST00000534939 2443 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
COLCA2A8K830 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
COLCA2A8K830 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
COLCA2A8K830 LYSMD4-202ENST00000344791 2885 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
COLCA2A8K830 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
COLCA2A8K830 CYTH1-209ENST00000589296 2159 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21 ms