Protein–RNA interactions for Protein: A6NNY8

USP27X, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 27, humanhuman

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Length 438 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP27XA6NNY8 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
USP27XA6NNY8 PQLC2-201ENST00000375153 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
USP27XA6NNY8 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
USP27XA6NNY8 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
USP27XA6NNY8 ZFP69-202ENST00000372706 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
USP27XA6NNY8 ZNF771-201ENST00000319296 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
USP27XA6NNY8 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
USP27XA6NNY8 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
USP27XA6NNY8 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
USP27XA6NNY8 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
USP27XA6NNY8 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
USP27XA6NNY8 PLEKHB1-204ENST00000398494 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
USP27XA6NNY8 ASB16-201ENST00000293414 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
USP27XA6NNY8 FAM53A-202ENST00000461064 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
USP27XA6NNY8 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
USP27XA6NNY8 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
USP27XA6NNY8 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
USP27XA6NNY8 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
USP27XA6NNY8 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
USP27XA6NNY8 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
USP27XA6NNY8 AC138696.1-201ENST00000522452 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
USP27XA6NNY8 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
USP27XA6NNY8 TMEM235-202ENST00000421688 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
USP27XA6NNY8 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
USP27XA6NNY8 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
USP27XA6NNY8 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
USP27XA6NNY8 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
USP27XA6NNY8 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
USP27XA6NNY8 NR1H2-211ENST00000599105 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
USP27XA6NNY8 SLC16A5-201ENST00000329783 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
USP27XA6NNY8 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
USP27XA6NNY8 SDHAF3-202ENST00000432641 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
USP27XA6NNY8 VSX1-202ENST00000376709 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
USP27XA6NNY8 CYP1B1-207ENST00000614273 2174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
USP27XA6NNY8 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
USP27XA6NNY8 MRGPRF-201ENST00000309099 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
USP27XA6NNY8 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
USP27XA6NNY8 SLC16A3-201ENST00000392339 2074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
USP27XA6NNY8 SLC16A3-202ENST00000392341 2086 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
USP27XA6NNY8 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
USP27XA6NNY8 SLC35E4-202ENST00000406566 2081 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
USP27XA6NNY8 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
USP27XA6NNY8 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
USP27XA6NNY8 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
USP27XA6NNY8 SMOC2-206ENST00000535039 1875 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
USP27XA6NNY8 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
USP27XA6NNY8 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
USP27XA6NNY8 SPHK1-203ENST00000545180 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
USP27XA6NNY8 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC22.95■■□□□ 1.26
USP27XA6NNY8 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
USP27XA6NNY8 CPT2-203ENST00000635862 2319 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
USP27XA6NNY8 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
USP27XA6NNY8 CHST8-203ENST00000438847 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
USP27XA6NNY8 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
USP27XA6NNY8 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
USP27XA6NNY8 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
USP27XA6NNY8 AC087289.5-201ENST00000586076 3175 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
USP27XA6NNY8 ASCC1-205ENST00000394919 2683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
USP27XA6NNY8 SYT5-202ENST00000537500 2612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
USP27XA6NNY8 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
USP27XA6NNY8 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
USP27XA6NNY8 ARRDC2-201ENST00000222250 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
USP27XA6NNY8 CHD1L-201ENST00000361293 2484 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
USP27XA6NNY8 KLHL11-201ENST00000319121 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
USP27XA6NNY8 ITPKB-202ENST00000366784 3146 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
USP27XA6NNY8 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
USP27XA6NNY8 Z83844.2-201ENST00000456099 1945 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
USP27XA6NNY8 DUSP15-201ENST00000278979 1732 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
USP27XA6NNY8 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
USP27XA6NNY8 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
USP27XA6NNY8 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
USP27XA6NNY8 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
USP27XA6NNY8 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
USP27XA6NNY8 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC22.93■■□□□ 1.26
USP27XA6NNY8 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
USP27XA6NNY8 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
USP27XA6NNY8 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
USP27XA6NNY8 SUMF2-201ENST00000275607 1894 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
USP27XA6NNY8 DGKZ-203ENST00000421244 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
USP27XA6NNY8 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
USP27XA6NNY8 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
USP27XA6NNY8 DVL1-204ENST00000610709 2268 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
USP27XA6NNY8 TRPV6-209ENST00000638686 2298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
USP27XA6NNY8 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
USP27XA6NNY8 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
USP27XA6NNY8 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
USP27XA6NNY8 FUT5-202ENST00000588525 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
USP27XA6NNY8 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
USP27XA6NNY8 RGMA-210ENST00000557301 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
USP27XA6NNY8 RGS11-204ENST00000397770 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
USP27XA6NNY8 TRABD2A-201ENST00000335459 1844 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
USP27XA6NNY8 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
USP27XA6NNY8 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
USP27XA6NNY8 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
USP27XA6NNY8 PLK5-205ENST00000642079 1969 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
USP27XA6NNY8 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
USP27XA6NNY8 NKX2-1-202ENST00000498187 2338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
USP27XA6NNY8 PLEKHH3-204ENST00000591022 2983 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
USP27XA6NNY8 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
USP27XA6NNY8 BRD4-202ENST00000360016 3240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
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