Protein–RNA interactions for Protein: A6NIV6

LRRIQ4, Leucine-rich repeat and IQ domain-containing protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 560 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRIQ4A6NIV6 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
LRRIQ4A6NIV6 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
LRRIQ4A6NIV6 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
LRRIQ4A6NIV6 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
LRRIQ4A6NIV6 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
LRRIQ4A6NIV6 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
LRRIQ4A6NIV6 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
LRRIQ4A6NIV6 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
LRRIQ4A6NIV6 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
LRRIQ4A6NIV6 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
LRRIQ4A6NIV6 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
LRRIQ4A6NIV6 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC23.44■■□□□ 1.34
LRRIQ4A6NIV6 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
LRRIQ4A6NIV6 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC23.43■■□□□ 1.34
LRRIQ4A6NIV6 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
LRRIQ4A6NIV6 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
LRRIQ4A6NIV6 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
LRRIQ4A6NIV6 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC23.43■■□□□ 1.34
LRRIQ4A6NIV6 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
LRRIQ4A6NIV6 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
LRRIQ4A6NIV6 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
LRRIQ4A6NIV6 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
LRRIQ4A6NIV6 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
LRRIQ4A6NIV6 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
LRRIQ4A6NIV6 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
LRRIQ4A6NIV6 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
LRRIQ4A6NIV6 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
LRRIQ4A6NIV6 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
LRRIQ4A6NIV6 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
LRRIQ4A6NIV6 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
LRRIQ4A6NIV6 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
LRRIQ4A6NIV6 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
LRRIQ4A6NIV6 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
LRRIQ4A6NIV6 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
LRRIQ4A6NIV6 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
LRRIQ4A6NIV6 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
LRRIQ4A6NIV6 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
LRRIQ4A6NIV6 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
LRRIQ4A6NIV6 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
LRRIQ4A6NIV6 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
LRRIQ4A6NIV6 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
LRRIQ4A6NIV6 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
LRRIQ4A6NIV6 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
LRRIQ4A6NIV6 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
LRRIQ4A6NIV6 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
LRRIQ4A6NIV6 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
LRRIQ4A6NIV6 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
LRRIQ4A6NIV6 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
LRRIQ4A6NIV6 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
LRRIQ4A6NIV6 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
LRRIQ4A6NIV6 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
LRRIQ4A6NIV6 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
LRRIQ4A6NIV6 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
LRRIQ4A6NIV6 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
LRRIQ4A6NIV6 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
LRRIQ4A6NIV6 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
LRRIQ4A6NIV6 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
LRRIQ4A6NIV6 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
LRRIQ4A6NIV6 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
LRRIQ4A6NIV6 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
LRRIQ4A6NIV6 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
LRRIQ4A6NIV6 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
LRRIQ4A6NIV6 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
LRRIQ4A6NIV6 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
LRRIQ4A6NIV6 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
LRRIQ4A6NIV6 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
LRRIQ4A6NIV6 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
LRRIQ4A6NIV6 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
LRRIQ4A6NIV6 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
LRRIQ4A6NIV6 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
LRRIQ4A6NIV6 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
LRRIQ4A6NIV6 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
LRRIQ4A6NIV6 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
LRRIQ4A6NIV6 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
LRRIQ4A6NIV6 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
LRRIQ4A6NIV6 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
LRRIQ4A6NIV6 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
LRRIQ4A6NIV6 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
LRRIQ4A6NIV6 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
LRRIQ4A6NIV6 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
LRRIQ4A6NIV6 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
LRRIQ4A6NIV6 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
LRRIQ4A6NIV6 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
LRRIQ4A6NIV6 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
LRRIQ4A6NIV6 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
LRRIQ4A6NIV6 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
LRRIQ4A6NIV6 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
LRRIQ4A6NIV6 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
LRRIQ4A6NIV6 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
LRRIQ4A6NIV6 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
LRRIQ4A6NIV6 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
LRRIQ4A6NIV6 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
LRRIQ4A6NIV6 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
LRRIQ4A6NIV6 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
LRRIQ4A6NIV6 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
LRRIQ4A6NIV6 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
LRRIQ4A6NIV6 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
LRRIQ4A6NIV6 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
LRRIQ4A6NIV6 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
LRRIQ4A6NIV6 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.6 ms