Protein–RNA interactions for Protein: A6NI87

CBY3, Protein chibby homolog 3, humanhuman

Predictions only

Length 242 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CBY3A6NI87 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CBY3A6NI87 TMED4-201ENST00000289577 2203 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CBY3A6NI87 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CBY3A6NI87 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CBY3A6NI87 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CBY3A6NI87 ATP6V0E2-203ENST00000456496 2722 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CBY3A6NI87 ATP6V0E2-213ENST00000615196 2727 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CBY3A6NI87 MBD3-207ENST00000590550 2782 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CBY3A6NI87 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CBY3A6NI87 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CBY3A6NI87 RAI14-201ENST00000265109 5092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CBY3A6NI87 AC007040.2-201ENST00000606025 4170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CBY3A6NI87 MTA1-201ENST00000331320 2876 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CBY3A6NI87 BRSK2-208ENST00000528841 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CBY3A6NI87 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CBY3A6NI87 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CBY3A6NI87 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CBY3A6NI87 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CBY3A6NI87 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CBY3A6NI87 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CBY3A6NI87 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CBY3A6NI87 FAM91A1-207ENST00000521166 2706 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CBY3A6NI87 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CBY3A6NI87 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CBY3A6NI87 CASR-204ENST00000638421 5088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CBY3A6NI87 GFI1-202ENST00000370332 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CBY3A6NI87 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CBY3A6NI87 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CBY3A6NI87 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CBY3A6NI87 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CBY3A6NI87 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CBY3A6NI87 FLT1-204ENST00000541932 2969 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CBY3A6NI87 MAP3K15-201ENST00000338883 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CBY3A6NI87 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CBY3A6NI87 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CBY3A6NI87 PDE1C-206ENST00000396193 5109 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CBY3A6NI87 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CBY3A6NI87 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CBY3A6NI87 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CBY3A6NI87 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CBY3A6NI87 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
CBY3A6NI87 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CBY3A6NI87 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CBY3A6NI87 TMEM255B-202ENST00000375353 6100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CBY3A6NI87 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CBY3A6NI87 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CBY3A6NI87 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CBY3A6NI87 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CBY3A6NI87 SMPD3-201ENST00000219334 5453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CBY3A6NI87 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CBY3A6NI87 BMP1-202ENST00000306385 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CBY3A6NI87 GPC5-201ENST00000377067 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CBY3A6NI87 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CBY3A6NI87 CACTIN-202ENST00000248420 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CBY3A6NI87 EIF4E3-201ENST00000295612 2764 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CBY3A6NI87 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
CBY3A6NI87 ARNT-202ENST00000358595 4887 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CBY3A6NI87 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CBY3A6NI87 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CBY3A6NI87 FBLIM1-202ENST00000375766 3695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CBY3A6NI87 AATK-203ENST00000417379 5081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CBY3A6NI87 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
CBY3A6NI87 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CBY3A6NI87 MACROD2-201ENST00000217246 4994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CBY3A6NI87 TAL1-202ENST00000371884 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CBY3A6NI87 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CBY3A6NI87 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CBY3A6NI87 RAVER2-202ENST00000371072 4362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CBY3A6NI87 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CBY3A6NI87 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CBY3A6NI87 DNAAF3-207ENST00000527223 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CBY3A6NI87 KIAA1549-201ENST00000422774 6283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CBY3A6NI87 NEU4-205ENST00000407683 2273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CBY3A6NI87 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CBY3A6NI87 AC090340.1-201ENST00000620778 4980 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
CBY3A6NI87 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CBY3A6NI87 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CBY3A6NI87 PRKAR1B-212ENST00000544935 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CBY3A6NI87 DAG1-221ENST00000541308 5676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CBY3A6NI87 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CBY3A6NI87 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CBY3A6NI87 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CBY3A6NI87 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CBY3A6NI87 PHC1-212ENST00000543824 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CBY3A6NI87 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CBY3A6NI87 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CBY3A6NI87 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
CBY3A6NI87 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
CBY3A6NI87 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CBY3A6NI87 GXYLT1-202ENST00000398675 7497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CBY3A6NI87 TCIRG1-213ENST00000532635 2457 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CBY3A6NI87 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CBY3A6NI87 NOMO1-201ENST00000287667 4355 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CBY3A6NI87 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CBY3A6NI87 MARK2-211ENST00000513765 2671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CBY3A6NI87 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CBY3A6NI87 NYAP1-202ENST00000454988 2777 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CBY3A6NI87 PRSS12-201ENST00000296498 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
CBY3A6NI87 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
CBY3A6NI87 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19 ms