Protein–RNA interactions for Protein: A6NFI3

ZNF316, Zinc finger protein 316, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,004 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF316A6NFI3 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.27■■■□□ 2.44
ZNF316A6NFI3 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC30.27■■■□□ 2.44
ZNF316A6NFI3 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC30.27■■■□□ 2.44
ZNF316A6NFI3 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC30.27■■■□□ 2.44
ZNF316A6NFI3 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.26■■■□□ 2.44
ZNF316A6NFI3 JAKMIP1-203ENST00000409371 2420 ntTSL 1 (best) BASIC30.26■■■□□ 2.44
ZNF316A6NFI3 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.26■■■□□ 2.44
ZNF316A6NFI3 NEU4-202ENST00000391969 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.26■■■□□ 2.43
ZNF316A6NFI3 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC30.26■■■□□ 2.43
ZNF316A6NFI3 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC30.26■■■□□ 2.43
ZNF316A6NFI3 AGAP4-207ENST00000616763 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.26■■■□□ 2.43
ZNF316A6NFI3 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC30.26■■■□□ 2.43
ZNF316A6NFI3 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.25■■■□□ 2.43
ZNF316A6NFI3 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.25■■■□□ 2.43
ZNF316A6NFI3 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.25■■■□□ 2.43
ZNF316A6NFI3 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.25■■■□□ 2.43
ZNF316A6NFI3 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.25■■■□□ 2.43
ZNF316A6NFI3 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.25■■■□□ 2.43
ZNF316A6NFI3 ZIM2-206ENST00000599935 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.25■■■□□ 2.43
ZNF316A6NFI3 SUMF2-208ENST00000434526 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.25■■■□□ 2.43
ZNF316A6NFI3 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC30.25■■■□□ 2.43
ZNF316A6NFI3 GRINA-201ENST00000313269 1968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.24■■■□□ 2.43
ZNF316A6NFI3 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.24■■■□□ 2.43
ZNF316A6NFI3 LINC01547-202ENST00000397841 2303 ntTSL 2 BASIC30.24■■■□□ 2.43
ZNF316A6NFI3 SNUPN-205ENST00000564644 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.24■■■□□ 2.43
ZNF316A6NFI3 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.24■■■□□ 2.43
ZNF316A6NFI3 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.24■■■□□ 2.43
ZNF316A6NFI3 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.24■■■□□ 2.43
ZNF316A6NFI3 PEX6-201ENST00000244546 2696 ntTSL 1 (best) BASIC30.23■■■□□ 2.43
ZNF316A6NFI3 MLST8-202ENST00000382450 1861 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC30.23■■■□□ 2.43
ZNF316A6NFI3 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.23■■■□□ 2.43
ZNF316A6NFI3 MLST8-215ENST00000564088 1861 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC30.23■■■□□ 2.43
ZNF316A6NFI3 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.23■■■□□ 2.43
ZNF316A6NFI3 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.23■■■□□ 2.43
ZNF316A6NFI3 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC30.23■■■□□ 2.43
ZNF316A6NFI3 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC30.23■■■□□ 2.43
ZNF316A6NFI3 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC30.23■■■□□ 2.43
ZNF316A6NFI3 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC30.23■■■□□ 2.43
ZNF316A6NFI3 SYT7-206ENST00000540677 2013 ntTSL 1 (best) BASIC30.23■■■□□ 2.43
ZNF316A6NFI3 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC30.23■■■□□ 2.43
ZNF316A6NFI3 CYP27A1-201ENST00000258415 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
ZNF316A6NFI3 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
ZNF316A6NFI3 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
ZNF316A6NFI3 RNF32-207ENST00000405335 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.22■■■□□ 2.43
ZNF316A6NFI3 IRX5-202ENST00000394636 2401 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC30.22■■■□□ 2.43
ZNF316A6NFI3 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.22■■■□□ 2.43
ZNF316A6NFI3 CHST1-201ENST00000308064 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
ZNF316A6NFI3 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
ZNF316A6NFI3 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.21■■■□□ 2.43
ZNF316A6NFI3 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.21■■■□□ 2.43
ZNF316A6NFI3 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.21■■■□□ 2.43
ZNF316A6NFI3 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC30.21■■■□□ 2.43
ZNF316A6NFI3 NRG2-204ENST00000358522 2559 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC30.21■■■□□ 2.43
ZNF316A6NFI3 ARFRP1-210ENST00000614942 2554 ntTSL 5 BASIC30.21■■■□□ 2.43
ZNF316A6NFI3 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.21■■■□□ 2.43
ZNF316A6NFI3 NUDT11-201ENST00000375992 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.21■■■□□ 2.43
ZNF316A6NFI3 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.21■■■□□ 2.43
ZNF316A6NFI3 LRRC4B-201ENST00000389201 2958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.21■■■□□ 2.43
ZNF316A6NFI3 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.43
ZNF316A6NFI3 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.43
ZNF316A6NFI3 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.43
ZNF316A6NFI3 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC30.2■■■□□ 2.43
ZNF316A6NFI3 FMR1-204ENST00000370471 4125 ntTSL 5 BASIC30.2■■■□□ 2.43
ZNF316A6NFI3 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC30.2■■■□□ 2.43
ZNF316A6NFI3 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC30.2■■■□□ 2.43
ZNF316A6NFI3 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.43
ZNF316A6NFI3 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.43
ZNF316A6NFI3 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.42
ZNF316A6NFI3 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.2■■■□□ 2.42
ZNF316A6NFI3 C17orf67-201ENST00000397861 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.42
ZNF316A6NFI3 PPP1R3F-201ENST00000055335 3421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.19■■■□□ 2.42
ZNF316A6NFI3 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
ZNF316A6NFI3 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
ZNF316A6NFI3 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
ZNF316A6NFI3 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC30.19■■■□□ 2.42
ZNF316A6NFI3 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.19■■■□□ 2.42
ZNF316A6NFI3 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
ZNF316A6NFI3 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC30.19■■■□□ 2.42
ZNF316A6NFI3 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
ZNF316A6NFI3 HDAC2-201ENST00000368632 2084 ntTSL 2 BASIC30.18■■■□□ 2.42
ZNF316A6NFI3 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC30.18■■■□□ 2.42
ZNF316A6NFI3 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
ZNF316A6NFI3 MARCH9-201ENST00000266643 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
ZNF316A6NFI3 IL17RC-205ENST00000413608 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
ZNF316A6NFI3 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC30.18■■■□□ 2.42
ZNF316A6NFI3 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC30.18■■■□□ 2.42
ZNF316A6NFI3 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC30.18■■■□□ 2.42
ZNF316A6NFI3 FDXR-201ENST00000293195 1875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
ZNF316A6NFI3 TBL1Y-201ENST00000346432 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
ZNF316A6NFI3 ADAM9-203ENST00000466936 2053 ntTSL 2 BASIC30.18■■■□□ 2.42
ZNF316A6NFI3 BLCAP-208ENST00000414542 2205 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.18■■■□□ 2.42
ZNF316A6NFI3 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC30.17■■■□□ 2.42
ZNF316A6NFI3 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
ZNF316A6NFI3 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC30.17■■■□□ 2.42
ZNF316A6NFI3 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
ZNF316A6NFI3 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC30.17■■■□□ 2.42
ZNF316A6NFI3 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC30.17■■■□□ 2.42
ZNF316A6NFI3 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.17■■■□□ 2.42
ZNF316A6NFI3 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC30.17■■■□□ 2.42
ZNF316A6NFI3 ME2-216ENST00000639850 2331 ntTSL 5 BASIC30.17■■■□□ 2.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 77.9 ms