Protein–RNA interactions for Protein: A6NCW7

USP17L4, Inactive ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 17-like protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 530 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP17L4A6NCW7 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
USP17L4A6NCW7 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
USP17L4A6NCW7 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
USP17L4A6NCW7 FASTK-217ENST00000540185 1609 ntTSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
USP17L4A6NCW7 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
USP17L4A6NCW7 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
USP17L4A6NCW7 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
USP17L4A6NCW7 PPP1CA-202ENST00000358239 1054 ntTSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
USP17L4A6NCW7 HSD17B10-202ENST00000375298 823 ntTSL 3 BASIC25.81■■□□□ 1.72
USP17L4A6NCW7 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
USP17L4A6NCW7 NAA60-204ENST00000421765 1045 ntTSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
USP17L4A6NCW7 AC069236.1-201ENST00000604339 616 ntBASIC25.81■■□□□ 1.72
USP17L4A6NCW7 AC016405.3-201ENST00000607710 860 ntBASIC25.81■■□□□ 1.72
USP17L4A6NCW7 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
USP17L4A6NCW7 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
USP17L4A6NCW7 LINC02531-201ENST00000404689 593 ntTSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
USP17L4A6NCW7 LINC01637-201ENST00000444039 684 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
USP17L4A6NCW7 AP000785.1-201ENST00000527314 613 ntTSL 4 BASIC25.8■■□□□ 1.72
USP17L4A6NCW7 AC092118.2-201ENST00000613495 667 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
USP17L4A6NCW7 ITM2C-210ENST00000620962 501 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
USP17L4A6NCW7 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
USP17L4A6NCW7 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
USP17L4A6NCW7 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
USP17L4A6NCW7 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC25.8■■□□□ 1.72
USP17L4A6NCW7 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
USP17L4A6NCW7 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
USP17L4A6NCW7 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
USP17L4A6NCW7 CAPN10-202ENST00000270364 1267 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
USP17L4A6NCW7 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
USP17L4A6NCW7 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC25.79■■□□□ 1.72
USP17L4A6NCW7 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
USP17L4A6NCW7 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
USP17L4A6NCW7 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
USP17L4A6NCW7 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
USP17L4A6NCW7 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
USP17L4A6NCW7 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
USP17L4A6NCW7 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
USP17L4A6NCW7 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
USP17L4A6NCW7 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
USP17L4A6NCW7 AL772284.2-201ENST00000620151 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
USP17L4A6NCW7 AL160396.2-202ENST00000636692 566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
USP17L4A6NCW7 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
USP17L4A6NCW7 MMP23B-202ENST00000378675 1309 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
USP17L4A6NCW7 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
USP17L4A6NCW7 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
USP17L4A6NCW7 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
USP17L4A6NCW7 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
USP17L4A6NCW7 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
USP17L4A6NCW7 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
USP17L4A6NCW7 SPDYE2-201ENST00000341656 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
USP17L4A6NCW7 SPDYE2B-202ENST00000455020 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
USP17L4A6NCW7 DET1-205ENST00000558413 583 ntTSL 4 BASIC25.77■■□□□ 1.72
USP17L4A6NCW7 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
USP17L4A6NCW7 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
USP17L4A6NCW7 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
USP17L4A6NCW7 RNPS1-201ENST00000301730 1276 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
USP17L4A6NCW7 GCC2-AS1-201ENST00000322353 558 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
USP17L4A6NCW7 KRT18P29-201ENST00000397031 1267 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
USP17L4A6NCW7 ATPIF1-203ENST00000468425 539 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
USP17L4A6NCW7 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
USP17L4A6NCW7 AC105001.1-201ENST00000506149 821 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
USP17L4A6NCW7 TPT1-AS1-210ENST00000520590 873 ntTSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
USP17L4A6NCW7 COX6C-208ENST00000522940 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.76■■□□□ 1.71
USP17L4A6NCW7 DHPS-223ENST00000614126 1124 ntTSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
USP17L4A6NCW7 CLN3-240ENST00000631023 1586 ntTSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
USP17L4A6NCW7 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
USP17L4A6NCW7 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
USP17L4A6NCW7 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
USP17L4A6NCW7 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
USP17L4A6NCW7 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC25.76■■□□□ 1.71
USP17L4A6NCW7 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
USP17L4A6NCW7 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
USP17L4A6NCW7 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
USP17L4A6NCW7 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
USP17L4A6NCW7 AC083805.3-201ENST00000619560 1315 ntTSL 3 BASIC25.75■■□□□ 1.71
USP17L4A6NCW7 SDHC-201ENST00000342751 1127 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
USP17L4A6NCW7 BX276092.2-201ENST00000417668 665 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
USP17L4A6NCW7 AL391244.2-201ENST00000428932 543 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
USP17L4A6NCW7 AC093827.2-201ENST00000512654 315 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
USP17L4A6NCW7 PTGER2-202ENST00000557436 643 ntTSL 3 BASIC25.75■■□□□ 1.71
USP17L4A6NCW7 GPX1-204ENST00000620890 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
USP17L4A6NCW7 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
USP17L4A6NCW7 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
USP17L4A6NCW7 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
USP17L4A6NCW7 GSEC-202ENST00000629441 1572 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
USP17L4A6NCW7 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
USP17L4A6NCW7 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
USP17L4A6NCW7 KCNQ2-201ENST00000344425 1426 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
USP17L4A6NCW7 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
USP17L4A6NCW7 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
USP17L4A6NCW7 ACOT8-201ENST00000217455 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
USP17L4A6NCW7 LINC01191-201ENST00000412690 844 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
USP17L4A6NCW7 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
USP17L4A6NCW7 LINC02199-202ENST00000510067 1008 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
USP17L4A6NCW7 AC106738.2-202ENST00000558156 533 ntTSL 4 BASIC25.74■■□□□ 1.71
USP17L4A6NCW7 FAM219B-212ENST00000565772 1249 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
USP17L4A6NCW7 LIMD2-206ENST00000578993 602 ntTSL 3 BASIC25.74■■□□□ 1.71
USP17L4A6NCW7 ADD3-AS1-204ENST00000627565 388 ntTSL 3 BASIC25.74■■□□□ 1.71
USP17L4A6NCW7 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
USP17L4A6NCW7 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.9 ms