Protein–RNA interactions for Protein: A6NCE7

MAP1LC3B2, Microtubule-associated proteins 1A/1B light chain 3 beta 2, humanhuman

Predictions only

Length 125 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MAP1LC3B2A6NCE7 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
MAP1LC3B2A6NCE7 RHNO1-204ENST00000489288 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
MAP1LC3B2A6NCE7 FBXL19-207ENST00000565690 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
MAP1LC3B2A6NCE7 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
MAP1LC3B2A6NCE7 NRXN1-208ENST00000405472 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
MAP1LC3B2A6NCE7 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
MAP1LC3B2A6NCE7 APBB3-203ENST00000357560 2218 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
MAP1LC3B2A6NCE7 IGFBP3-210ENST00000613132 2412 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
MAP1LC3B2A6NCE7 PAN3-201ENST00000380958 2833 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
MAP1LC3B2A6NCE7 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
MAP1LC3B2A6NCE7 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
MAP1LC3B2A6NCE7 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
MAP1LC3B2A6NCE7 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
MAP1LC3B2A6NCE7 DENND1A-203ENST00000373624 5010 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
MAP1LC3B2A6NCE7 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
MAP1LC3B2A6NCE7 GABARAPL3-202ENST00000624044 1851 ntBASIC16.77■□□□□ 0.27
MAP1LC3B2A6NCE7 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
MAP1LC3B2A6NCE7 CSPG5-203ENST00000456150 2089 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
MAP1LC3B2A6NCE7 WNT7B-202ENST00000409496 2285 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
MAP1LC3B2A6NCE7 MSANTD1-203ENST00000507492 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
MAP1LC3B2A6NCE7 TPCN2-208ENST00000637342 2856 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
MAP1LC3B2A6NCE7 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
MAP1LC3B2A6NCE7 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
MAP1LC3B2A6NCE7 TDRP-203ENST00000523656 2622 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
MAP1LC3B2A6NCE7 NRXN1-226ENST00000626899 2543 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
MAP1LC3B2A6NCE7 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
MAP1LC3B2A6NCE7 SAE1-203ENST00000413379 2313 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
MAP1LC3B2A6NCE7 Z83844.2-201ENST00000456099 1945 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
MAP1LC3B2A6NCE7 NPLOC4-201ENST00000331134 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
MAP1LC3B2A6NCE7 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
MAP1LC3B2A6NCE7 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
MAP1LC3B2A6NCE7 NYX-202ENST00000378220 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
MAP1LC3B2A6NCE7 TPBGL-201ENST00000562197 2793 ntAPPRIS P1 BASIC16.76■□□□□ 0.27
MAP1LC3B2A6NCE7 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
MAP1LC3B2A6NCE7 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
MAP1LC3B2A6NCE7 CCDC47-202ENST00000403162 2195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
MAP1LC3B2A6NCE7 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
MAP1LC3B2A6NCE7 LGI2-201ENST00000382114 6428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
MAP1LC3B2A6NCE7 IL17RC-205ENST00000413608 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
MAP1LC3B2A6NCE7 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
MAP1LC3B2A6NCE7 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
MAP1LC3B2A6NCE7 PCDHA13-203ENST00000617769 2427 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
MAP1LC3B2A6NCE7 YIPF2-201ENST00000253031 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
MAP1LC3B2A6NCE7 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
MAP1LC3B2A6NCE7 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
MAP1LC3B2A6NCE7 HMGA1-205ENST00000447654 2159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
MAP1LC3B2A6NCE7 NFATC1-201ENST00000253506 4642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
MAP1LC3B2A6NCE7 KLC1-208ENST00000452929 2453 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
MAP1LC3B2A6NCE7 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
MAP1LC3B2A6NCE7 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
MAP1LC3B2A6NCE7 SPNS2-201ENST00000329078 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
MAP1LC3B2A6NCE7 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
MAP1LC3B2A6NCE7 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
MAP1LC3B2A6NCE7 ERLIN1-203ENST00000421367 5792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
MAP1LC3B2A6NCE7 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
MAP1LC3B2A6NCE7 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC16.75■□□□□ 0.27
MAP1LC3B2A6NCE7 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
MAP1LC3B2A6NCE7 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
MAP1LC3B2A6NCE7 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
MAP1LC3B2A6NCE7 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
MAP1LC3B2A6NCE7 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
MAP1LC3B2A6NCE7 FDFT1-210ENST00000525954 1890 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
MAP1LC3B2A6NCE7 GNA14-201ENST00000341700 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
MAP1LC3B2A6NCE7 LONRF3-202ENST00000371628 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
MAP1LC3B2A6NCE7 TRMT2A-201ENST00000252136 2964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
MAP1LC3B2A6NCE7 BAALC-203ENST00000309982 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
MAP1LC3B2A6NCE7 YTHDF3-213ENST00000621820 2363 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
MAP1LC3B2A6NCE7 SDHAF3-202ENST00000432641 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
MAP1LC3B2A6NCE7 ADAP1-218ENST00000617043 1946 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
MAP1LC3B2A6NCE7 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
MAP1LC3B2A6NCE7 SHANK3-203ENST00000445220 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
MAP1LC3B2A6NCE7 CNOT6-201ENST00000261951 6176 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
MAP1LC3B2A6NCE7 CRHR1-203ENST00000339069 2490 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
MAP1LC3B2A6NCE7 AL445183.2-201ENST00000439621 1871 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
MAP1LC3B2A6NCE7 HAND2-AS1-237ENST00000616485 2420 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
MAP1LC3B2A6NCE7 DVL1-204ENST00000610709 2268 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
MAP1LC3B2A6NCE7 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
MAP1LC3B2A6NCE7 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
MAP1LC3B2A6NCE7 GPR35-201ENST00000319838 2249 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
MAP1LC3B2A6NCE7 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
MAP1LC3B2A6NCE7 GOLGA3-203ENST00000456883 5496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
MAP1LC3B2A6NCE7 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
MAP1LC3B2A6NCE7 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
MAP1LC3B2A6NCE7 LGI3-202ENST00000424267 3114 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
MAP1LC3B2A6NCE7 MARK2-203ENST00000377810 4560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
MAP1LC3B2A6NCE7 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
MAP1LC3B2A6NCE7 TXNRD2-203ENST00000400519 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
MAP1LC3B2A6NCE7 TPD52-209ENST00000518937 2856 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
MAP1LC3B2A6NCE7 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
MAP1LC3B2A6NCE7 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
MAP1LC3B2A6NCE7 CDC14B-203ENST00000375242 2965 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
MAP1LC3B2A6NCE7 RASGRP2-211ENST00000394432 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
MAP1LC3B2A6NCE7 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
MAP1LC3B2A6NCE7 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
MAP1LC3B2A6NCE7 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
MAP1LC3B2A6NCE7 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC16.73■□□□□ 0.27
MAP1LC3B2A6NCE7 SOX2-201ENST00000325404 2513 ntAPPRIS P1 BASIC16.73■□□□□ 0.27
MAP1LC3B2A6NCE7 BHLHE22-201ENST00000321870 3262 ntAPPRIS P1 BASIC16.73■□□□□ 0.27
MAP1LC3B2A6NCE7 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
MAP1LC3B2A6NCE7 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.8 ms