Protein–RNA interactions for Protein: A4D1N5

Putative uncharacterized protein FLJ40288, humanhuman

Predictions only

Length 150 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
A4D1N5 AC008073.3-201ENST00000610442 2281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.36□□□□□ -0.11
A4D1N5 DPF1-203ENST00000414789 1960 ntTSL 2 BASIC14.36□□□□□ -0.11
A4D1N5 NEUROG1-201ENST00000314744 1668 ntAPPRIS P1 BASIC14.36□□□□□ -0.11
A4D1N5 PHF2-202ENST00000375376 3045 ntTSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
A4D1N5 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
A4D1N5 CHST2-201ENST00000309575 4582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
A4D1N5 ZC3H12D-201ENST00000409806 5791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
A4D1N5 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
A4D1N5 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
A4D1N5 SDHAF3-202ENST00000432641 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
A4D1N5 TMTC1-203ENST00000539277 2758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
A4D1N5 HMOX2-208ENST00000570646 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
A4D1N5 SMPDL3A-203ENST00000539041 1755 ntTSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
A4D1N5 GATAD1-201ENST00000287957 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
A4D1N5 FOXC1-201ENST00000380874 3926 ntAPPRIS P1 BASIC14.35□□□□□ -0.11
A4D1N5 COL13A1-205ENST00000398978 3093 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
A4D1N5 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC14.35□□□□□ -0.11
A4D1N5 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC14.35□□□□□ -0.11
A4D1N5 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC14.35□□□□□ -0.11
A4D1N5 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC14.35□□□□□ -0.11
A4D1N5 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC14.35□□□□□ -0.11
A4D1N5 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
A4D1N5 FAM189B-201ENST00000350210 2379 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
A4D1N5 ZNF281-202ENST00000367352 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
A4D1N5 DOK1-201ENST00000233668 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
A4D1N5 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
A4D1N5 B3GNT2-201ENST00000301998 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
A4D1N5 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC14.35□□□□□ -0.11
A4D1N5 FNBP1-203ENST00000443566 5227 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
A4D1N5 RASL12-201ENST00000220062 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
A4D1N5 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
A4D1N5 LRRC4B-202ENST00000599957 3019 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.35□□□□□ -0.11
A4D1N5 CYP2A7-202ENST00000301146 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
A4D1N5 NTRK1-201ENST00000358660 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
A4D1N5 VPS53-201ENST00000291074 2656 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
A4D1N5 BRICD5-201ENST00000328540 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
A4D1N5 WDSUB1-202ENST00000359774 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
A4D1N5 TAL1-202ENST00000371884 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
A4D1N5 GLS-202ENST00000338435 4475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
A4D1N5 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
A4D1N5 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
A4D1N5 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
A4D1N5 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
A4D1N5 PITPNC1-201ENST00000299954 6359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
A4D1N5 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
A4D1N5 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC14.34□□□□□ -0.11
A4D1N5 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC14.34□□□□□ -0.11
A4D1N5 WWC3-201ENST00000380861 6647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
A4D1N5 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
A4D1N5 HIBADH-201ENST00000265395 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
A4D1N5 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
A4D1N5 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
A4D1N5 ARNT-202ENST00000358595 4887 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
A4D1N5 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
A4D1N5 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
A4D1N5 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
A4D1N5 MRGPRF-201ENST00000309099 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
A4D1N5 NR1H2-211ENST00000599105 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
A4D1N5 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.11
A4D1N5 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.11
A4D1N5 SLC6A7-203ENST00000524041 2431 ntTSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.12
A4D1N5 HR-202ENST00000381418 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
A4D1N5 LRRC1-202ENST00000370888 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
A4D1N5 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.33□□□□□ -0.12
A4D1N5 AP005212.1-201ENST00000581547 1997 ntBASIC14.33□□□□□ -0.12
A4D1N5 CD82-201ENST00000227155 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
A4D1N5 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
A4D1N5 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC14.33□□□□□ -0.12
A4D1N5 DRD5-201ENST00000304374 2330 ntAPPRIS P1 BASIC14.33□□□□□ -0.12
A4D1N5 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
A4D1N5 SPTBN4-202ENST00000352632 8676 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.12
A4D1N5 ANKS1A-201ENST00000360359 6347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
A4D1N5 KIF16B-206ENST00000636835 5109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
A4D1N5 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC14.33□□□□□ -0.12
A4D1N5 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.12
A4D1N5 SMARCC1-201ENST00000254480 6375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
A4D1N5 PTPA-223ENST00000452489 2526 ntTSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
A4D1N5 STMN4-202ENST00000350889 2288 ntTSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
A4D1N5 PRPF39-201ENST00000355765 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
A4D1N5 MRFAP1-201ENST00000320912 2049 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.32□□□□□ -0.12
A4D1N5 CDHR5-201ENST00000349570 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
A4D1N5 TDRD10-202ENST00000368482 2331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
A4D1N5 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
A4D1N5 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.32□□□□□ -0.12
A4D1N5 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
A4D1N5 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.32□□□□□ -0.12
A4D1N5 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
A4D1N5 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.32□□□□□ -0.12
A4D1N5 BTBD11-201ENST00000280758 5767 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.32□□□□□ -0.12
A4D1N5 AC018445.3-201ENST00000624177 1945 ntBASIC14.32□□□□□ -0.12
A4D1N5 BAG3-201ENST00000369085 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
A4D1N5 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
A4D1N5 RNF38-202ENST00000350199 5104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.32□□□□□ -0.12
A4D1N5 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC14.32□□□□□ -0.12
A4D1N5 GDF7-201ENST00000272224 9749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
A4D1N5 EVX2-201ENST00000308618 4203 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.32□□□□□ -0.12
A4D1N5 FOXC2-201ENST00000320354 2478 ntAPPRIS P1 BASIC14.32□□□□□ -0.12
A4D1N5 VSX1-202ENST00000376709 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
A4D1N5 ZNF385B-204ENST00000410066 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
A4D1N5 CHRNB1-201ENST00000306071 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53 ms