Protein–RNA interactions for Protein: A4D1B5

GSAP, Gamma-secretase-activating protein, humanhuman

Predictions only

Length 854 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GSAPA4D1B5 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
GSAPA4D1B5 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
GSAPA4D1B5 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
GSAPA4D1B5 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
GSAPA4D1B5 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
GSAPA4D1B5 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC20.63■□□□□ 0.89
GSAPA4D1B5 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC20.63■□□□□ 0.89
GSAPA4D1B5 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC20.63■□□□□ 0.89
GSAPA4D1B5 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC20.63■□□□□ 0.89
GSAPA4D1B5 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC20.63■□□□□ 0.89
GSAPA4D1B5 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
GSAPA4D1B5 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
GSAPA4D1B5 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
GSAPA4D1B5 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
GSAPA4D1B5 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
GSAPA4D1B5 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
GSAPA4D1B5 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
GSAPA4D1B5 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
GSAPA4D1B5 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
GSAPA4D1B5 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC20.62■□□□□ 0.89
GSAPA4D1B5 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
GSAPA4D1B5 ARPP19-201ENST00000249822 5301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
GSAPA4D1B5 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
GSAPA4D1B5 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
GSAPA4D1B5 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
GSAPA4D1B5 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
GSAPA4D1B5 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
GSAPA4D1B5 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC20.62■□□□□ 0.89
GSAPA4D1B5 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
GSAPA4D1B5 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
GSAPA4D1B5 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
GSAPA4D1B5 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
GSAPA4D1B5 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
GSAPA4D1B5 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
GSAPA4D1B5 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
GSAPA4D1B5 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC20.61■□□□□ 0.89
GSAPA4D1B5 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC20.61■□□□□ 0.89
GSAPA4D1B5 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
GSAPA4D1B5 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
GSAPA4D1B5 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
GSAPA4D1B5 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
GSAPA4D1B5 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
GSAPA4D1B5 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
GSAPA4D1B5 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
GSAPA4D1B5 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
GSAPA4D1B5 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
GSAPA4D1B5 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
GSAPA4D1B5 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
GSAPA4D1B5 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
GSAPA4D1B5 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
GSAPA4D1B5 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
GSAPA4D1B5 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
GSAPA4D1B5 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
GSAPA4D1B5 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
GSAPA4D1B5 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
GSAPA4D1B5 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
GSAPA4D1B5 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
GSAPA4D1B5 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
GSAPA4D1B5 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
GSAPA4D1B5 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
GSAPA4D1B5 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
GSAPA4D1B5 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
GSAPA4D1B5 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
GSAPA4D1B5 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
GSAPA4D1B5 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
GSAPA4D1B5 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC20.59■□□□□ 0.89
GSAPA4D1B5 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
GSAPA4D1B5 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
GSAPA4D1B5 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
GSAPA4D1B5 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
GSAPA4D1B5 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
GSAPA4D1B5 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
GSAPA4D1B5 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
GSAPA4D1B5 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
GSAPA4D1B5 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
GSAPA4D1B5 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
GSAPA4D1B5 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
GSAPA4D1B5 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
GSAPA4D1B5 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.58■□□□□ 0.89
GSAPA4D1B5 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
GSAPA4D1B5 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
GSAPA4D1B5 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
GSAPA4D1B5 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
GSAPA4D1B5 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC20.58■□□□□ 0.89
GSAPA4D1B5 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
GSAPA4D1B5 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
GSAPA4D1B5 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.88
GSAPA4D1B5 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
GSAPA4D1B5 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
GSAPA4D1B5 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
GSAPA4D1B5 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.88
GSAPA4D1B5 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.88
GSAPA4D1B5 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
GSAPA4D1B5 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
GSAPA4D1B5 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
GSAPA4D1B5 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
GSAPA4D1B5 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
GSAPA4D1B5 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
GSAPA4D1B5 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
GSAPA4D1B5 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56 ms