Protein–RNA interactions for Protein: A2RU37

C9orf170, Uncharacterized protein C9orf170, humanhuman

Predictions only

Length 121 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf170A2RU37 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
C9orf170A2RU37 CCDC47-202ENST00000403162 2195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
C9orf170A2RU37 GFER-201ENST00000248114 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
C9orf170A2RU37 RNF38-204ENST00000357058 5254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
C9orf170A2RU37 CRHR1-203ENST00000339069 2490 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
C9orf170A2RU37 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
C9orf170A2RU37 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
C9orf170A2RU37 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
C9orf170A2RU37 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC17.69■□□□□ 0.42
C9orf170A2RU37 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
C9orf170A2RU37 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
C9orf170A2RU37 PMPCB-202ENST00000428154 1714 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
C9orf170A2RU37 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
C9orf170A2RU37 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
C9orf170A2RU37 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
C9orf170A2RU37 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
C9orf170A2RU37 RASGRP2-211ENST00000394432 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
C9orf170A2RU37 AP003356.1-202ENST00000517910 2770 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
C9orf170A2RU37 SOX2-201ENST00000325404 2513 ntAPPRIS P1 BASIC17.68■□□□□ 0.42
C9orf170A2RU37 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
C9orf170A2RU37 NYX-202ENST00000378220 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
C9orf170A2RU37 MSANTD1-203ENST00000507492 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
C9orf170A2RU37 RAB11FIP4-211ENST00000621161 8628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
C9orf170A2RU37 DIAPH1-203ENST00000389057 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
C9orf170A2RU37 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
C9orf170A2RU37 TSNAXIP1-202ENST00000415766 2338 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
C9orf170A2RU37 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
C9orf170A2RU37 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
C9orf170A2RU37 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
C9orf170A2RU37 YTHDF3-213ENST00000621820 2363 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
C9orf170A2RU37 FDFT1-226ENST00000623368 2368 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
C9orf170A2RU37 REM2-201ENST00000267396 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
C9orf170A2RU37 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
C9orf170A2RU37 ARID4B-203ENST00000366603 5946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
C9orf170A2RU37 PHOSPHO1-201ENST00000310544 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
C9orf170A2RU37 TDRP-203ENST00000523656 2622 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
C9orf170A2RU37 TMPRSS5-212ENST00000545579 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
C9orf170A2RU37 TAF15-215ENST00000605844 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
C9orf170A2RU37 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
C9orf170A2RU37 BRICD5-201ENST00000328540 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
C9orf170A2RU37 Z83844.2-201ENST00000456099 1945 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
C9orf170A2RU37 PLCD1-201ENST00000334661 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
C9orf170A2RU37 WNT10B-201ENST00000301061 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
C9orf170A2RU37 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
C9orf170A2RU37 EBF1-202ENST00000380654 2345 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
C9orf170A2RU37 UBE2B-201ENST00000265339 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
C9orf170A2RU37 IL17RC-202ENST00000383812 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
C9orf170A2RU37 IL17RC-203ENST00000403601 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
C9orf170A2RU37 GPR35-201ENST00000319838 2249 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
C9orf170A2RU37 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
C9orf170A2RU37 LYN-202ENST00000519728 2297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
C9orf170A2RU37 PAN3-201ENST00000380958 2833 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
C9orf170A2RU37 NRXN1-226ENST00000626899 2543 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
C9orf170A2RU37 LONRF3-202ENST00000371628 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
C9orf170A2RU37 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
C9orf170A2RU37 AC073314.1-201ENST00000568729 2216 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
C9orf170A2RU37 PGAM5-203ENST00000498926 2834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
C9orf170A2RU37 INSM2-201ENST00000307169 3013 ntAPPRIS P1 BASIC17.66■□□□□ 0.42
C9orf170A2RU37 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
C9orf170A2RU37 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
C9orf170A2RU37 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
C9orf170A2RU37 DVL1-204ENST00000610709 2268 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
C9orf170A2RU37 KLF16-201ENST00000250916 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
C9orf170A2RU37 RMND5A-201ENST00000283632 6301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
C9orf170A2RU37 MSLN-205ENST00000563941 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
C9orf170A2RU37 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
C9orf170A2RU37 NEURL4-203ENST00000570460 4890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
C9orf170A2RU37 KCNH2-201ENST00000262186 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
C9orf170A2RU37 AFG3L1P-217ENST00000557444 2447 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
C9orf170A2RU37 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
C9orf170A2RU37 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
C9orf170A2RU37 NR1H2-211ENST00000599105 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
C9orf170A2RU37 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC17.65■□□□□ 0.42
C9orf170A2RU37 OSR2-203ENST00000457907 2126 ntTSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
C9orf170A2RU37 ENGASE-205ENST00000579016 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
C9orf170A2RU37 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
C9orf170A2RU37 DUSP15-201ENST00000278979 1732 ntTSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
C9orf170A2RU37 FAM151B-201ENST00000282226 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
C9orf170A2RU37 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
C9orf170A2RU37 BYSL-201ENST00000230340 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
C9orf170A2RU37 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
C9orf170A2RU37 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
C9orf170A2RU37 ADAM9-203ENST00000466936 2053 ntTSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
C9orf170A2RU37 PITX2-201ENST00000306732 2320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
C9orf170A2RU37 C19orf66-201ENST00000253110 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
C9orf170A2RU37 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
C9orf170A2RU37 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
C9orf170A2RU37 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
C9orf170A2RU37 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
C9orf170A2RU37 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
C9orf170A2RU37 TRIM58-201ENST00000366481 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
C9orf170A2RU37 BACE2-201ENST00000328735 2824 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
C9orf170A2RU37 BCR-202ENST00000359540 4708 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
C9orf170A2RU37 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
C9orf170A2RU37 C16orf70-201ENST00000219139 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
C9orf170A2RU37 FAM110D-201ENST00000374268 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
C9orf170A2RU37 ZNF510-203ENST00000375231 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
C9orf170A2RU37 FEZF1-203ENST00000442488 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
C9orf170A2RU37 NRP2-206ENST00000417189 2386 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
C9orf170A2RU37 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.3 ms