Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y6Z2

LINC01558, Uncharacterized protein encoded by LINC01558, humanhuman

Predictions only

Length 57 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC01558Q9Y6Z2 HEBP2-204ENST00000607197 10014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
LINC01558Q9Y6Z2 KCNMA1-278ENST00000640141 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
LINC01558Q9Y6Z2 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.14□□□□□ -0.63
LINC01558Q9Y6Z2 NOMO1-201ENST00000287667 4355 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
LINC01558Q9Y6Z2 CABIN1-202ENST00000337989 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
LINC01558Q9Y6Z2 DYNC1LI2-201ENST00000258198 4515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
LINC01558Q9Y6Z2 EHMT1-203ENST00000460843 5137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
LINC01558Q9Y6Z2 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
LINC01558Q9Y6Z2 SAMD3-202ENST00000368134 2377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.14□□□□□ -0.63
LINC01558Q9Y6Z2 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
LINC01558Q9Y6Z2 VPS53-201ENST00000291074 2656 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
LINC01558Q9Y6Z2 LAMP1-201ENST00000332556 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
LINC01558Q9Y6Z2 UHRF1-203ENST00000615884 2651 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.14□□□□□ -0.63
LINC01558Q9Y6Z2 GRIN3B-201ENST00000234389 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
LINC01558Q9Y6Z2 SLC12A4-201ENST00000316341 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
LINC01558Q9Y6Z2 LANCL3-201ENST00000378619 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
LINC01558Q9Y6Z2 MBD3-201ENST00000156825 5518 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
LINC01558Q9Y6Z2 FBLIM1-202ENST00000375766 3695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.14□□□□□ -0.63
LINC01558Q9Y6Z2 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
LINC01558Q9Y6Z2 MDFIC-201ENST00000257724 4598 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
LINC01558Q9Y6Z2 ZDHHC23-201ENST00000330212 3778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
LINC01558Q9Y6Z2 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
LINC01558Q9Y6Z2 IRGQ-205ENST00000602269 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
LINC01558Q9Y6Z2 MTSS1L-204ENST00000616026 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
LINC01558Q9Y6Z2 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
LINC01558Q9Y6Z2 HMOX2-218ENST00000619913 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
LINC01558Q9Y6Z2 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
LINC01558Q9Y6Z2 COPS7A-222ENST00000626119 1768 ntTSL 3 BASIC11.13□□□□□ -0.63
LINC01558Q9Y6Z2 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
LINC01558Q9Y6Z2 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
LINC01558Q9Y6Z2 WRNIP1-202ENST00000380769 3239 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
LINC01558Q9Y6Z2 UVSSA-207ENST00000511216 2927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
LINC01558Q9Y6Z2 GAS2L1-210ENST00000621062 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
LINC01558Q9Y6Z2 SMARCC1-201ENST00000254480 6375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
LINC01558Q9Y6Z2 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
LINC01558Q9Y6Z2 PCDHAC2-203ENST00000615316 3011 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
LINC01558Q9Y6Z2 AC005332.8-201ENST00000622750 2735 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
LINC01558Q9Y6Z2 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC11.13□□□□□ -0.63
LINC01558Q9Y6Z2 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
LINC01558Q9Y6Z2 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
LINC01558Q9Y6Z2 GNA15-201ENST00000262958 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
LINC01558Q9Y6Z2 MLXIP-201ENST00000319080 8427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
LINC01558Q9Y6Z2 TNFRSF8-202ENST00000413146 2363 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
LINC01558Q9Y6Z2 SRRM2-201ENST00000301740 9353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
LINC01558Q9Y6Z2 MCU-201ENST00000357157 2874 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
LINC01558Q9Y6Z2 KRCC1-201ENST00000347055 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
LINC01558Q9Y6Z2 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
LINC01558Q9Y6Z2 BID-205ENST00000399774 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
LINC01558Q9Y6Z2 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
LINC01558Q9Y6Z2 GXYLT1-202ENST00000398675 7497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
LINC01558Q9Y6Z2 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
LINC01558Q9Y6Z2 COL5A3-201ENST00000264828 6174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
LINC01558Q9Y6Z2 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.12□□□□□ -0.63
LINC01558Q9Y6Z2 CDK11B-201ENST00000340677 2534 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
LINC01558Q9Y6Z2 LPAR2-202ENST00000542587 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.12□□□□□ -0.63
LINC01558Q9Y6Z2 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
LINC01558Q9Y6Z2 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
LINC01558Q9Y6Z2 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
LINC01558Q9Y6Z2 TM7SF3-201ENST00000343028 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
LINC01558Q9Y6Z2 RAC1-201ENST00000348035 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
LINC01558Q9Y6Z2 RNF38-202ENST00000350199 5104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
LINC01558Q9Y6Z2 PRODH-215ENST00000610940 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
LINC01558Q9Y6Z2 NLRP6-201ENST00000312165 2679 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
LINC01558Q9Y6Z2 COL16A1-203ENST00000373672 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
LINC01558Q9Y6Z2 BCL7A-203ENST00000538010 6247 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
LINC01558Q9Y6Z2 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
LINC01558Q9Y6Z2 NHLH2-201ENST00000320238 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
LINC01558Q9Y6Z2 FRRS1L-201ENST00000561981 8197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
LINC01558Q9Y6Z2 EHMT1-236ENST00000637161 5049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
LINC01558Q9Y6Z2 RASL12-201ENST00000220062 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
LINC01558Q9Y6Z2 ZNF419-201ENST00000221735 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
LINC01558Q9Y6Z2 FBXL20-202ENST00000394294 2309 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
LINC01558Q9Y6Z2 RUSC2-202ENST00000455600 5636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
LINC01558Q9Y6Z2 CDK17-203ENST00000543119 2442 ntTSL 2 BASIC11.11□□□□□ -0.63
LINC01558Q9Y6Z2 ASPRV1-201ENST00000320256 2177 ntAPPRIS P1 BASIC11.11□□□□□ -0.63
LINC01558Q9Y6Z2 CCT5-205ENST00000506600 1939 ntTSL 2 BASIC11.11□□□□□ -0.63
LINC01558Q9Y6Z2 STIM2-211ENST00000639195 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
LINC01558Q9Y6Z2 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
LINC01558Q9Y6Z2 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
LINC01558Q9Y6Z2 NEUROG1-201ENST00000314744 1668 ntAPPRIS P1 BASIC11.11□□□□□ -0.63
LINC01558Q9Y6Z2 PKD2-201ENST00000237596 5056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
LINC01558Q9Y6Z2 KCTD18-201ENST00000359878 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
LINC01558Q9Y6Z2 ZNF598-204ENST00000563630 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
LINC01558Q9Y6Z2 PTRH1-204ENST00000419060 2692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.11□□□□□ -0.63
LINC01558Q9Y6Z2 TFEB-211ENST00000420312 1996 ntTSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
LINC01558Q9Y6Z2 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.11□□□□□ -0.63
LINC01558Q9Y6Z2 KLHL2-201ENST00000226725 3134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
LINC01558Q9Y6Z2 ZSCAN1-201ENST00000282326 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.11□□□□□ -0.63
LINC01558Q9Y6Z2 KCTD12-201ENST00000377474 6225 ntAPPRIS P1 BASIC11.11□□□□□ -0.63
LINC01558Q9Y6Z2 DGKZ-203ENST00000421244 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
LINC01558Q9Y6Z2 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC11.11□□□□□ -0.63
LINC01558Q9Y6Z2 FGFR1-206ENST00000397091 5702 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
LINC01558Q9Y6Z2 VSX1-202ENST00000376709 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
LINC01558Q9Y6Z2 SPAG9-202ENST00000357122 4761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
LINC01558Q9Y6Z2 ZNF211-204ENST00000347302 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
LINC01558Q9Y6Z2 SEMA6B-202ENST00000586965 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
LINC01558Q9Y6Z2 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
LINC01558Q9Y6Z2 CDHR1-201ENST00000332904 2694 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
LINC01558Q9Y6Z2 CARMIL2-201ENST00000334583 4687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
LINC01558Q9Y6Z2 THTPA-202ENST00000404535 1779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.4 ms