Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y6F8

CDY1, Testis-specific chromodomain protein Y 1, humanhuman

Predictions only

Length 540 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDY1Q9Y6F8 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CDY1Q9Y6F8 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CDY1Q9Y6F8 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CDY1Q9Y6F8 KANSL1-AS1-201ENST00000398275 517 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CDY1Q9Y6F8 C19orf73-201ENST00000408991 744 ntAPPRIS P1 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CDY1Q9Y6F8 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CDY1Q9Y6F8 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CDY1Q9Y6F8 WT1-AS_3.1-201ENST00000613262 234 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
CDY1Q9Y6F8 MAZ-216ENST00000616501 991 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CDY1Q9Y6F8 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CDY1Q9Y6F8 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CDY1Q9Y6F8 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CDY1Q9Y6F8 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CDY1Q9Y6F8 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CDY1Q9Y6F8 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CDY1Q9Y6F8 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CDY1Q9Y6F8 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CDY1Q9Y6F8 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CDY1Q9Y6F8 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
CDY1Q9Y6F8 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CDY1Q9Y6F8 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CDY1Q9Y6F8 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CDY1Q9Y6F8 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CDY1Q9Y6F8 DUX4L16-201ENST00000555130 1264 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
CDY1Q9Y6F8 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CDY1Q9Y6F8 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CDY1Q9Y6F8 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CDY1Q9Y6F8 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CDY1Q9Y6F8 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CDY1Q9Y6F8 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CDY1Q9Y6F8 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CDY1Q9Y6F8 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CDY1Q9Y6F8 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CDY1Q9Y6F8 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CDY1Q9Y6F8 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CDY1Q9Y6F8 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CDY1Q9Y6F8 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CDY1Q9Y6F8 MOB2-201ENST00000329957 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CDY1Q9Y6F8 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CDY1Q9Y6F8 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CDY1Q9Y6F8 PGPEP1L-201ENST00000378919 995 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CDY1Q9Y6F8 TRNT1-207ENST00000420393 854 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CDY1Q9Y6F8 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
CDY1Q9Y6F8 BX890604.1-207ENST00000486571 904 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CDY1Q9Y6F8 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CDY1Q9Y6F8 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CDY1Q9Y6F8 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CDY1Q9Y6F8 EMC9-206ENST00000560403 872 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CDY1Q9Y6F8 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
CDY1Q9Y6F8 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CDY1Q9Y6F8 MBD3L1-202ENST00000595891 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CDY1Q9Y6F8 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CDY1Q9Y6F8 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CDY1Q9Y6F8 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CDY1Q9Y6F8 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CDY1Q9Y6F8 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CDY1Q9Y6F8 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CDY1Q9Y6F8 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
CDY1Q9Y6F8 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CDY1Q9Y6F8 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CDY1Q9Y6F8 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
CDY1Q9Y6F8 KHDC3L-201ENST00000370367 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CDY1Q9Y6F8 AL355802.2-201ENST00000402069 882 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
CDY1Q9Y6F8 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CDY1Q9Y6F8 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CDY1Q9Y6F8 ARFRP1-202ENST00000607873 1061 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CDY1Q9Y6F8 AC231657.2-201ENST00000624556 255 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
CDY1Q9Y6F8 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CDY1Q9Y6F8 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CDY1Q9Y6F8 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CDY1Q9Y6F8 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CDY1Q9Y6F8 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CDY1Q9Y6F8 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CDY1Q9Y6F8 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CDY1Q9Y6F8 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CDY1Q9Y6F8 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CDY1Q9Y6F8 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CDY1Q9Y6F8 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CDY1Q9Y6F8 AC005789.1-201ENST00000585411 297 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CDY1Q9Y6F8 AL161421.1-201ENST00000619666 1101 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CDY1Q9Y6F8 AL050303.2-201ENST00000619798 666 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
CDY1Q9Y6F8 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CDY1Q9Y6F8 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CDY1Q9Y6F8 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CDY1Q9Y6F8 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CDY1Q9Y6F8 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CDY1Q9Y6F8 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CDY1Q9Y6F8 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CDY1Q9Y6F8 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CDY1Q9Y6F8 TOR2A-201ENST00000336067 1370 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CDY1Q9Y6F8 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CDY1Q9Y6F8 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CDY1Q9Y6F8 GPX1P1-201ENST00000388829 606 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
CDY1Q9Y6F8 AC007322.1-201ENST00000426983 750 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
CDY1Q9Y6F8 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CDY1Q9Y6F8 PARD6A-203ENST00000602551 1171 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CDY1Q9Y6F8 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CDY1Q9Y6F8 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CDY1Q9Y6F8 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CDY1Q9Y6F8 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.5 ms