Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5F1

PCDHB12, Protocadherin beta-12, humanhuman

Predictions only

Length 795 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCDHB12Q9Y5F1 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
PCDHB12Q9Y5F1 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
PCDHB12Q9Y5F1 MCHR1-202ENST00000381433 1219 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
PCDHB12Q9Y5F1 INTS11-205ENST00000429572 1104 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
PCDHB12Q9Y5F1 FADS3-204ENST00000525588 1254 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
PCDHB12Q9Y5F1 AC034102.6-201ENST00000550947 559 ntTSL 4 BASIC22.98■■□□□ 1.27
PCDHB12Q9Y5F1 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
PCDHB12Q9Y5F1 NDUFB10-204ENST00000569148 628 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
PCDHB12Q9Y5F1 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
PCDHB12Q9Y5F1 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
PCDHB12Q9Y5F1 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
PCDHB12Q9Y5F1 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
PCDHB12Q9Y5F1 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
PCDHB12Q9Y5F1 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
PCDHB12Q9Y5F1 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
PCDHB12Q9Y5F1 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
PCDHB12Q9Y5F1 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
PCDHB12Q9Y5F1 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
PCDHB12Q9Y5F1 AC009086.2-201ENST00000449759 610 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
PCDHB12Q9Y5F1 MIR4651-201ENST00000582622 73 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
PCDHB12Q9Y5F1 ELAC1-204ENST00000591429 975 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
PCDHB12Q9Y5F1 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
PCDHB12Q9Y5F1 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
PCDHB12Q9Y5F1 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
PCDHB12Q9Y5F1 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
PCDHB12Q9Y5F1 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
PCDHB12Q9Y5F1 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
PCDHB12Q9Y5F1 TERF1P5-201ENST00000477545 1207 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
PCDHB12Q9Y5F1 RPL29-204ENST00000479017 670 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
PCDHB12Q9Y5F1 DDN-AS1-201ENST00000547395 858 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
PCDHB12Q9Y5F1 MIR4758-201ENST00000577688 71 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
PCDHB12Q9Y5F1 CIRBP-214ENST00000587896 1081 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
PCDHB12Q9Y5F1 TBCB-214ENST00000629269 413 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
PCDHB12Q9Y5F1 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
PCDHB12Q9Y5F1 ATG101-201ENST00000336854 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
PCDHB12Q9Y5F1 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
PCDHB12Q9Y5F1 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
PCDHB12Q9Y5F1 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
PCDHB12Q9Y5F1 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
PCDHB12Q9Y5F1 COA6-202ENST00000366613 641 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
PCDHB12Q9Y5F1 MGST3-205ENST00000367889 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
PCDHB12Q9Y5F1 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
PCDHB12Q9Y5F1 C2orf82-203ENST00000409533 561 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC22.95■■□□□ 1.26
PCDHB12Q9Y5F1 BET1L-204ENST00000410108 637 ntTSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
PCDHB12Q9Y5F1 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
PCDHB12Q9Y5F1 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
PCDHB12Q9Y5F1 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
PCDHB12Q9Y5F1 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
PCDHB12Q9Y5F1 TNNI3-207ENST00000588882 669 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
PCDHB12Q9Y5F1 F2RL3-202ENST00000599210 613 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
PCDHB12Q9Y5F1 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
PCDHB12Q9Y5F1 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
PCDHB12Q9Y5F1 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
PCDHB12Q9Y5F1 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
PCDHB12Q9Y5F1 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
PCDHB12Q9Y5F1 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
PCDHB12Q9Y5F1 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
PCDHB12Q9Y5F1 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
PCDHB12Q9Y5F1 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
PCDHB12Q9Y5F1 CENPN-201ENST00000299572 1398 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
PCDHB12Q9Y5F1 MED10-201ENST00000255764 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
PCDHB12Q9Y5F1 FMR1-202ENST00000334557 1295 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
PCDHB12Q9Y5F1 AP000282.1-201ENST00000454622 682 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
PCDHB12Q9Y5F1 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
PCDHB12Q9Y5F1 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
PCDHB12Q9Y5F1 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
PCDHB12Q9Y5F1 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
PCDHB12Q9Y5F1 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
PCDHB12Q9Y5F1 RWDD4-206ENST00000512740 1393 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
PCDHB12Q9Y5F1 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
PCDHB12Q9Y5F1 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
PCDHB12Q9Y5F1 HSD17B10-202ENST00000375298 823 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
PCDHB12Q9Y5F1 PET100-202ENST00000594797 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
PCDHB12Q9Y5F1 AL136982.7-201ENST00000609363 465 ntTSL 4 BASIC22.93■■□□□ 1.26
PCDHB12Q9Y5F1 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
PCDHB12Q9Y5F1 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
PCDHB12Q9Y5F1 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
PCDHB12Q9Y5F1 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
PCDHB12Q9Y5F1 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
PCDHB12Q9Y5F1 KLHDC9-201ENST00000368011 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
PCDHB12Q9Y5F1 MTHFS-201ENST00000258874 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
PCDHB12Q9Y5F1 GUK1-201ENST00000312726 1084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
PCDHB12Q9Y5F1 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
PCDHB12Q9Y5F1 RAMP1-202ENST00000403885 650 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
PCDHB12Q9Y5F1 CCDC74B-203ENST00000409128 789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
PCDHB12Q9Y5F1 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
PCDHB12Q9Y5F1 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
PCDHB12Q9Y5F1 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
PCDHB12Q9Y5F1 IGFBP3-211ENST00000615754 792 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
PCDHB12Q9Y5F1 MYO19-221ENST00000620640 1186 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
PCDHB12Q9Y5F1 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
PCDHB12Q9Y5F1 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
PCDHB12Q9Y5F1 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
PCDHB12Q9Y5F1 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
PCDHB12Q9Y5F1 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
PCDHB12Q9Y5F1 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
PCDHB12Q9Y5F1 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
PCDHB12Q9Y5F1 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
PCDHB12Q9Y5F1 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
PCDHB12Q9Y5F1 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.7 ms