Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y448

KNSTRN, Small kinetochore-associated protein, humanhuman

Predictions only

Length 316 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KNSTRNQ9Y448 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
KNSTRNQ9Y448 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
KNSTRNQ9Y448 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
KNSTRNQ9Y448 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.27
KNSTRNQ9Y448 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC29.2■■■□□ 2.26
KNSTRNQ9Y448 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC29.2■■■□□ 2.26
KNSTRNQ9Y448 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
KNSTRNQ9Y448 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
KNSTRNQ9Y448 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
KNSTRNQ9Y448 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
KNSTRNQ9Y448 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
KNSTRNQ9Y448 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC29.19■■■□□ 2.26
KNSTRNQ9Y448 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
KNSTRNQ9Y448 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
KNSTRNQ9Y448 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC29.19■■■□□ 2.26
KNSTRNQ9Y448 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
KNSTRNQ9Y448 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC29.19■■■□□ 2.26
KNSTRNQ9Y448 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
KNSTRNQ9Y448 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC29.19■■■□□ 2.26
KNSTRNQ9Y448 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
KNSTRNQ9Y448 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
KNSTRNQ9Y448 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
KNSTRNQ9Y448 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC29.18■■■□□ 2.26
KNSTRNQ9Y448 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.18■■■□□ 2.26
KNSTRNQ9Y448 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC29.18■■■□□ 2.26
KNSTRNQ9Y448 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC29.18■■■□□ 2.26
KNSTRNQ9Y448 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC29.18■■■□□ 2.26
KNSTRNQ9Y448 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC29.18■■■□□ 2.26
KNSTRNQ9Y448 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
KNSTRNQ9Y448 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC29.18■■■□□ 2.26
KNSTRNQ9Y448 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.18■■■□□ 2.26
KNSTRNQ9Y448 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC29.18■■■□□ 2.26
KNSTRNQ9Y448 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
KNSTRNQ9Y448 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
KNSTRNQ9Y448 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
KNSTRNQ9Y448 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
KNSTRNQ9Y448 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC29.17■■■□□ 2.26
KNSTRNQ9Y448 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC29.17■■■□□ 2.26
KNSTRNQ9Y448 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC29.17■■■□□ 2.26
KNSTRNQ9Y448 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
KNSTRNQ9Y448 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC29.17■■■□□ 2.26
KNSTRNQ9Y448 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
KNSTRNQ9Y448 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC29.17■■■□□ 2.26
KNSTRNQ9Y448 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
KNSTRNQ9Y448 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
KNSTRNQ9Y448 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
KNSTRNQ9Y448 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
KNSTRNQ9Y448 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC29.16■■■□□ 2.26
KNSTRNQ9Y448 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC29.16■■■□□ 2.26
KNSTRNQ9Y448 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC29.16■■■□□ 2.26
KNSTRNQ9Y448 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
KNSTRNQ9Y448 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
KNSTRNQ9Y448 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
KNSTRNQ9Y448 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC29.15■■■□□ 2.26
KNSTRNQ9Y448 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
KNSTRNQ9Y448 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.15■■■□□ 2.26
KNSTRNQ9Y448 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
KNSTRNQ9Y448 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC29.15■■■□□ 2.26
KNSTRNQ9Y448 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC29.15■■■□□ 2.26
KNSTRNQ9Y448 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC29.15■■■□□ 2.26
KNSTRNQ9Y448 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC29.15■■■□□ 2.26
KNSTRNQ9Y448 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
KNSTRNQ9Y448 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.15■■■□□ 2.26
KNSTRNQ9Y448 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC29.15■■■□□ 2.26
KNSTRNQ9Y448 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
KNSTRNQ9Y448 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
KNSTRNQ9Y448 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
KNSTRNQ9Y448 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
KNSTRNQ9Y448 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
KNSTRNQ9Y448 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
KNSTRNQ9Y448 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.14■■■□□ 2.26
KNSTRNQ9Y448 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC29.14■■■□□ 2.26
KNSTRNQ9Y448 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
KNSTRNQ9Y448 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
KNSTRNQ9Y448 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
KNSTRNQ9Y448 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
KNSTRNQ9Y448 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
KNSTRNQ9Y448 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC29.13■■■□□ 2.25
KNSTRNQ9Y448 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC29.13■■■□□ 2.25
KNSTRNQ9Y448 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC29.13■■■□□ 2.25
KNSTRNQ9Y448 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
KNSTRNQ9Y448 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC29.13■■■□□ 2.25
KNSTRNQ9Y448 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC29.13■■■□□ 2.25
KNSTRNQ9Y448 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC29.13■■■□□ 2.25
KNSTRNQ9Y448 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC29.13■■■□□ 2.25
KNSTRNQ9Y448 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.12■■■□□ 2.25
KNSTRNQ9Y448 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
KNSTRNQ9Y448 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
KNSTRNQ9Y448 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
KNSTRNQ9Y448 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
KNSTRNQ9Y448 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
KNSTRNQ9Y448 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.12■■■□□ 2.25
KNSTRNQ9Y448 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC29.12■■■□□ 2.25
KNSTRNQ9Y448 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC29.12■■■□□ 2.25
KNSTRNQ9Y448 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
KNSTRNQ9Y448 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC29.12■■■□□ 2.25
KNSTRNQ9Y448 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
KNSTRNQ9Y448 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
KNSTRNQ9Y448 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
KNSTRNQ9Y448 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC29.11■■■□□ 2.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.1 ms