Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y3E7

CHMP3, Charged multivesicular body protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 222 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHMP3Q9Y3E7 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
CHMP3Q9Y3E7 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
CHMP3Q9Y3E7 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
CHMP3Q9Y3E7 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC26.66■■□□□ 1.86
CHMP3Q9Y3E7 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
CHMP3Q9Y3E7 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
CHMP3Q9Y3E7 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
CHMP3Q9Y3E7 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
CHMP3Q9Y3E7 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
CHMP3Q9Y3E7 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
CHMP3Q9Y3E7 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
CHMP3Q9Y3E7 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
CHMP3Q9Y3E7 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
CHMP3Q9Y3E7 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC26.65■■□□□ 1.86
CHMP3Q9Y3E7 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
CHMP3Q9Y3E7 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
CHMP3Q9Y3E7 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
CHMP3Q9Y3E7 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
CHMP3Q9Y3E7 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
CHMP3Q9Y3E7 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
CHMP3Q9Y3E7 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
CHMP3Q9Y3E7 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
CHMP3Q9Y3E7 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
CHMP3Q9Y3E7 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.86
CHMP3Q9Y3E7 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
CHMP3Q9Y3E7 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.86
CHMP3Q9Y3E7 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
CHMP3Q9Y3E7 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
CHMP3Q9Y3E7 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC26.64■■□□□ 1.86
CHMP3Q9Y3E7 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC26.64■■□□□ 1.86
CHMP3Q9Y3E7 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.85
CHMP3Q9Y3E7 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.85
CHMP3Q9Y3E7 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
CHMP3Q9Y3E7 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
CHMP3Q9Y3E7 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
CHMP3Q9Y3E7 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
CHMP3Q9Y3E7 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
CHMP3Q9Y3E7 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC26.63■■□□□ 1.85
CHMP3Q9Y3E7 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
CHMP3Q9Y3E7 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
CHMP3Q9Y3E7 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC26.63■■□□□ 1.85
CHMP3Q9Y3E7 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC26.63■■□□□ 1.85
CHMP3Q9Y3E7 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
CHMP3Q9Y3E7 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
CHMP3Q9Y3E7 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
CHMP3Q9Y3E7 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
CHMP3Q9Y3E7 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
CHMP3Q9Y3E7 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
CHMP3Q9Y3E7 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
CHMP3Q9Y3E7 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
CHMP3Q9Y3E7 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
CHMP3Q9Y3E7 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
CHMP3Q9Y3E7 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC26.62■■□□□ 1.85
CHMP3Q9Y3E7 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
CHMP3Q9Y3E7 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
CHMP3Q9Y3E7 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
CHMP3Q9Y3E7 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC26.62■■□□□ 1.85
CHMP3Q9Y3E7 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
CHMP3Q9Y3E7 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC26.62■■□□□ 1.85
CHMP3Q9Y3E7 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
CHMP3Q9Y3E7 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
CHMP3Q9Y3E7 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
CHMP3Q9Y3E7 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
CHMP3Q9Y3E7 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
CHMP3Q9Y3E7 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC26.61■■□□□ 1.85
CHMP3Q9Y3E7 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC26.61■■□□□ 1.85
CHMP3Q9Y3E7 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC26.61■■□□□ 1.85
CHMP3Q9Y3E7 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC26.61■■□□□ 1.85
CHMP3Q9Y3E7 GNAO1-211ENST00000570235 568 ntTSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
CHMP3Q9Y3E7 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC26.61■■□□□ 1.85
CHMP3Q9Y3E7 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
CHMP3Q9Y3E7 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
CHMP3Q9Y3E7 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
CHMP3Q9Y3E7 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
CHMP3Q9Y3E7 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
CHMP3Q9Y3E7 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
CHMP3Q9Y3E7 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
CHMP3Q9Y3E7 LINC02091-201ENST00000576171 1185 ntTSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
CHMP3Q9Y3E7 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
CHMP3Q9Y3E7 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC26.6■■□□□ 1.85
CHMP3Q9Y3E7 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
CHMP3Q9Y3E7 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
CHMP3Q9Y3E7 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
CHMP3Q9Y3E7 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
CHMP3Q9Y3E7 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
CHMP3Q9Y3E7 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
CHMP3Q9Y3E7 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
CHMP3Q9Y3E7 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
CHMP3Q9Y3E7 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
CHMP3Q9Y3E7 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
CHMP3Q9Y3E7 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
CHMP3Q9Y3E7 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
CHMP3Q9Y3E7 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
CHMP3Q9Y3E7 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC26.59■■□□□ 1.85
CHMP3Q9Y3E7 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
CHMP3Q9Y3E7 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
CHMP3Q9Y3E7 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC26.59■■□□□ 1.85
CHMP3Q9Y3E7 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
CHMP3Q9Y3E7 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
CHMP3Q9Y3E7 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 100.5 ms