Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2W7

KCNIP3, Calsenilin, humanhuman

Predictions only

Length 256 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNIP3Q9Y2W7 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
KCNIP3Q9Y2W7 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
KCNIP3Q9Y2W7 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
KCNIP3Q9Y2W7 WNT10A-201ENST00000258411 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
KCNIP3Q9Y2W7 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
KCNIP3Q9Y2W7 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
KCNIP3Q9Y2W7 STARD3-202ENST00000394250 1949 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
KCNIP3Q9Y2W7 MARK3-206ENST00000440884 2643 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
KCNIP3Q9Y2W7 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
KCNIP3Q9Y2W7 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
KCNIP3Q9Y2W7 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
KCNIP3Q9Y2W7 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
KCNIP3Q9Y2W7 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
KCNIP3Q9Y2W7 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
KCNIP3Q9Y2W7 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
KCNIP3Q9Y2W7 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
KCNIP3Q9Y2W7 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
KCNIP3Q9Y2W7 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
KCNIP3Q9Y2W7 TXNDC5-201ENST00000379757 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
KCNIP3Q9Y2W7 PRKCI-201ENST00000295797 4950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
KCNIP3Q9Y2W7 TEAD2-210ENST00000601519 2167 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
KCNIP3Q9Y2W7 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.43
KCNIP3Q9Y2W7 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
KCNIP3Q9Y2W7 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
KCNIP3Q9Y2W7 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
KCNIP3Q9Y2W7 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
KCNIP3Q9Y2W7 IMPAD1-201ENST00000262644 7199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
KCNIP3Q9Y2W7 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
KCNIP3Q9Y2W7 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
KCNIP3Q9Y2W7 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
KCNIP3Q9Y2W7 FRRS1L-201ENST00000561981 8197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
KCNIP3Q9Y2W7 ANKRD9-201ENST00000286918 6727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
KCNIP3Q9Y2W7 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
KCNIP3Q9Y2W7 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
KCNIP3Q9Y2W7 PCDHAC2-201ENST00000289269 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
KCNIP3Q9Y2W7 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
KCNIP3Q9Y2W7 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
KCNIP3Q9Y2W7 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
KCNIP3Q9Y2W7 IRX5-202ENST00000394636 2401 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
KCNIP3Q9Y2W7 NFATC2IP-201ENST00000320805 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
KCNIP3Q9Y2W7 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
KCNIP3Q9Y2W7 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
KCNIP3Q9Y2W7 PCID2-203ENST00000375457 2372 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
KCNIP3Q9Y2W7 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
KCNIP3Q9Y2W7 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
KCNIP3Q9Y2W7 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
KCNIP3Q9Y2W7 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
KCNIP3Q9Y2W7 NAB2-202ENST00000342556 2318 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
KCNIP3Q9Y2W7 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
KCNIP3Q9Y2W7 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
KCNIP3Q9Y2W7 HEY2-201ENST00000368364 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
KCNIP3Q9Y2W7 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
KCNIP3Q9Y2W7 NF2-201ENST00000334961 2020 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
KCNIP3Q9Y2W7 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
KCNIP3Q9Y2W7 CEBPA-201ENST00000498907 2631 ntAPPRIS P1 BASIC17.75■□□□□ 0.43
KCNIP3Q9Y2W7 ZFP64-206ENST00000371523 2234 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
KCNIP3Q9Y2W7 ST3GAL4-209ENST00000526727 1967 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
KCNIP3Q9Y2W7 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
KCNIP3Q9Y2W7 GUCY1A3-210ENST00000513574 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
KCNIP3Q9Y2W7 CSPG5-201ENST00000264723 4080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
KCNIP3Q9Y2W7 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
KCNIP3Q9Y2W7 MARK1-202ENST00000366918 5169 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
KCNIP3Q9Y2W7 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
KCNIP3Q9Y2W7 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
KCNIP3Q9Y2W7 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
KCNIP3Q9Y2W7 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
KCNIP3Q9Y2W7 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.74■□□□□ 0.43
KCNIP3Q9Y2W7 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
KCNIP3Q9Y2W7 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
KCNIP3Q9Y2W7 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
KCNIP3Q9Y2W7 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
KCNIP3Q9Y2W7 PITPNC1-201ENST00000299954 6359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
KCNIP3Q9Y2W7 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
KCNIP3Q9Y2W7 TSHZ3-201ENST00000240587 5176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
KCNIP3Q9Y2W7 JAKMIP1-201ENST00000282924 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
KCNIP3Q9Y2W7 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC17.74■□□□□ 0.43
KCNIP3Q9Y2W7 SOX21-201ENST00000376945 2778 ntAPPRIS P1 BASIC17.74■□□□□ 0.43
KCNIP3Q9Y2W7 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
KCNIP3Q9Y2W7 WWC3-201ENST00000380861 6647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
KCNIP3Q9Y2W7 HPS6-201ENST00000299238 2649 ntAPPRIS P1 BASIC17.73■□□□□ 0.43
KCNIP3Q9Y2W7 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
KCNIP3Q9Y2W7 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
KCNIP3Q9Y2W7 EEF1D-246ENST00000532741 2387 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
KCNIP3Q9Y2W7 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
KCNIP3Q9Y2W7 WNT10B-202ENST00000403957 1817 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
KCNIP3Q9Y2W7 UNC5B-201ENST00000335350 6841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
KCNIP3Q9Y2W7 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
KCNIP3Q9Y2W7 SYT7-206ENST00000540677 2013 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
KCNIP3Q9Y2W7 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
KCNIP3Q9Y2W7 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
KCNIP3Q9Y2W7 KREMEN2-201ENST00000303746 2326 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
KCNIP3Q9Y2W7 PRMT5-204ENST00000397441 2418 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
KCNIP3Q9Y2W7 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
KCNIP3Q9Y2W7 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
KCNIP3Q9Y2W7 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC17.73■□□□□ 0.43
KCNIP3Q9Y2W7 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
KCNIP3Q9Y2W7 CHRNB2-205ENST00000637900 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
KCNIP3Q9Y2W7 UBR2-203ENST00000372903 2423 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
KCNIP3Q9Y2W7 PKD2-201ENST00000237596 5056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
KCNIP3Q9Y2W7 COL13A1-202ENST00000357811 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.9 ms