Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y235

APOBEC2, C->U-editing enzyme APOBEC-2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 224 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOBEC2Q9Y235 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
APOBEC2Q9Y235 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
APOBEC2Q9Y235 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
APOBEC2Q9Y235 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
APOBEC2Q9Y235 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
APOBEC2Q9Y235 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
APOBEC2Q9Y235 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
APOBEC2Q9Y235 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
APOBEC2Q9Y235 COL15A1-205ENST00000610452 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
APOBEC2Q9Y235 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
APOBEC2Q9Y235 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
APOBEC2Q9Y235 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
APOBEC2Q9Y235 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
APOBEC2Q9Y235 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
APOBEC2Q9Y235 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
APOBEC2Q9Y235 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
APOBEC2Q9Y235 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
APOBEC2Q9Y235 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
APOBEC2Q9Y235 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
APOBEC2Q9Y235 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
APOBEC2Q9Y235 AL691442.1-201ENST00000505139 1042 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
APOBEC2Q9Y235 ASPSCR1-211ENST00000581647 720 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
APOBEC2Q9Y235 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
APOBEC2Q9Y235 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
APOBEC2Q9Y235 TMEM121B-201ENST00000331437 4954 ntAPPRIS P3 BASIC21.73■■□□□ 1.07
APOBEC2Q9Y235 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
APOBEC2Q9Y235 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
APOBEC2Q9Y235 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
APOBEC2Q9Y235 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
APOBEC2Q9Y235 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
APOBEC2Q9Y235 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
APOBEC2Q9Y235 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC21.72■■□□□ 1.07
APOBEC2Q9Y235 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
APOBEC2Q9Y235 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC21.72■■□□□ 1.07
APOBEC2Q9Y235 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
APOBEC2Q9Y235 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
APOBEC2Q9Y235 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
APOBEC2Q9Y235 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
APOBEC2Q9Y235 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
APOBEC2Q9Y235 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
APOBEC2Q9Y235 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
APOBEC2Q9Y235 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
APOBEC2Q9Y235 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
APOBEC2Q9Y235 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
APOBEC2Q9Y235 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
APOBEC2Q9Y235 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
APOBEC2Q9Y235 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
APOBEC2Q9Y235 MGEA5-205ENST00000439817 5043 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
APOBEC2Q9Y235 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
APOBEC2Q9Y235 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
APOBEC2Q9Y235 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
APOBEC2Q9Y235 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
APOBEC2Q9Y235 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC21.71■■□□□ 1.07
APOBEC2Q9Y235 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
APOBEC2Q9Y235 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
APOBEC2Q9Y235 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
APOBEC2Q9Y235 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
APOBEC2Q9Y235 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
APOBEC2Q9Y235 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
APOBEC2Q9Y235 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
APOBEC2Q9Y235 NT5C-201ENST00000245552 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
APOBEC2Q9Y235 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC21.7■■□□□ 1.06
APOBEC2Q9Y235 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
APOBEC2Q9Y235 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
APOBEC2Q9Y235 SLC25A29-212ENST00000555927 960 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
APOBEC2Q9Y235 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
APOBEC2Q9Y235 HSD17B1-202ENST00000585807 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
APOBEC2Q9Y235 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
APOBEC2Q9Y235 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
APOBEC2Q9Y235 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
APOBEC2Q9Y235 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
APOBEC2Q9Y235 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
APOBEC2Q9Y235 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
APOBEC2Q9Y235 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
APOBEC2Q9Y235 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
APOBEC2Q9Y235 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
APOBEC2Q9Y235 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
APOBEC2Q9Y235 HUNK-201ENST00000270112 7385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
APOBEC2Q9Y235 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
APOBEC2Q9Y235 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
APOBEC2Q9Y235 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
APOBEC2Q9Y235 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
APOBEC2Q9Y235 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
APOBEC2Q9Y235 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
APOBEC2Q9Y235 GXYLT1P5-201ENST00000614548 1189 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
APOBEC2Q9Y235 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
APOBEC2Q9Y235 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC21.69■■□□□ 1.06
APOBEC2Q9Y235 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
APOBEC2Q9Y235 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
APOBEC2Q9Y235 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
APOBEC2Q9Y235 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
APOBEC2Q9Y235 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
APOBEC2Q9Y235 MAP3K21-203ENST00000366624 5809 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
APOBEC2Q9Y235 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
APOBEC2Q9Y235 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
APOBEC2Q9Y235 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
APOBEC2Q9Y235 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
APOBEC2Q9Y235 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
APOBEC2Q9Y235 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
APOBEC2Q9Y235 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.9 ms