Protein–RNA interactions for Protein: Q9UQR0

SCML2, Sex comb on midleg-like protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 700 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCML2Q9UQR0 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SCML2Q9UQR0 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SCML2Q9UQR0 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SCML2Q9UQR0 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SCML2Q9UQR0 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SCML2Q9UQR0 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SCML2Q9UQR0 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SCML2Q9UQR0 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SCML2Q9UQR0 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SCML2Q9UQR0 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SCML2Q9UQR0 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SCML2Q9UQR0 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SCML2Q9UQR0 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SCML2Q9UQR0 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
SCML2Q9UQR0 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SCML2Q9UQR0 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SCML2Q9UQR0 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SCML2Q9UQR0 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SCML2Q9UQR0 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
SCML2Q9UQR0 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SCML2Q9UQR0 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SCML2Q9UQR0 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SCML2Q9UQR0 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SCML2Q9UQR0 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SCML2Q9UQR0 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SCML2Q9UQR0 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SCML2Q9UQR0 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SCML2Q9UQR0 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SCML2Q9UQR0 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SCML2Q9UQR0 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SCML2Q9UQR0 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SCML2Q9UQR0 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SCML2Q9UQR0 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SCML2Q9UQR0 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SCML2Q9UQR0 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SCML2Q9UQR0 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SCML2Q9UQR0 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SCML2Q9UQR0 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SCML2Q9UQR0 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SCML2Q9UQR0 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
SCML2Q9UQR0 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SCML2Q9UQR0 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
SCML2Q9UQR0 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SCML2Q9UQR0 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
SCML2Q9UQR0 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
SCML2Q9UQR0 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SCML2Q9UQR0 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SCML2Q9UQR0 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
SCML2Q9UQR0 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC22.27■■□□□ 1.15
SCML2Q9UQR0 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.15
SCML2Q9UQR0 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SCML2Q9UQR0 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
SCML2Q9UQR0 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SCML2Q9UQR0 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SCML2Q9UQR0 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SCML2Q9UQR0 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SCML2Q9UQR0 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SCML2Q9UQR0 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SCML2Q9UQR0 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SCML2Q9UQR0 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SCML2Q9UQR0 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SCML2Q9UQR0 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SCML2Q9UQR0 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SCML2Q9UQR0 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SCML2Q9UQR0 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SCML2Q9UQR0 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SCML2Q9UQR0 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SCML2Q9UQR0 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SCML2Q9UQR0 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SCML2Q9UQR0 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SCML2Q9UQR0 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
SCML2Q9UQR0 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
SCML2Q9UQR0 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SCML2Q9UQR0 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SCML2Q9UQR0 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SCML2Q9UQR0 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SCML2Q9UQR0 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SCML2Q9UQR0 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SCML2Q9UQR0 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SCML2Q9UQR0 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SCML2Q9UQR0 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
SCML2Q9UQR0 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SCML2Q9UQR0 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SCML2Q9UQR0 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SCML2Q9UQR0 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SCML2Q9UQR0 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SCML2Q9UQR0 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SCML2Q9UQR0 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SCML2Q9UQR0 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SCML2Q9UQR0 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SCML2Q9UQR0 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SCML2Q9UQR0 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SCML2Q9UQR0 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SCML2Q9UQR0 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SCML2Q9UQR0 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SCML2Q9UQR0 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SCML2Q9UQR0 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SCML2Q9UQR0 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
SCML2Q9UQR0 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SCML2Q9UQR0 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.8 ms