Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPN6

SCAF8, Protein SCAF8, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,271 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCAF8Q9UPN6 AL158047.1-201ENST00000445918 881 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
SCAF8Q9UPN6 FAM47E-204ENST00000510328 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
SCAF8Q9UPN6 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
SCAF8Q9UPN6 AC106738.2-202ENST00000558156 533 ntTSL 4 BASIC25.45■■□□□ 1.66
SCAF8Q9UPN6 OR10C1-204ENST00000622521 1039 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
SCAF8Q9UPN6 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
SCAF8Q9UPN6 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
SCAF8Q9UPN6 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
SCAF8Q9UPN6 PRR7-202ENST00000502922 1345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
SCAF8Q9UPN6 LINC01191-201ENST00000412690 844 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
SCAF8Q9UPN6 AC007285.1-201ENST00000422239 893 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
SCAF8Q9UPN6 AL596275.1-201ENST00000423464 877 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
SCAF8Q9UPN6 GCSHP5-201ENST00000443090 522 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
SCAF8Q9UPN6 AP000785.1-201ENST00000527314 613 ntTSL 4 BASIC25.44■■□□□ 1.66
SCAF8Q9UPN6 FAM219B-212ENST00000565772 1249 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
SCAF8Q9UPN6 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
SCAF8Q9UPN6 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
SCAF8Q9UPN6 RNPS1-201ENST00000301730 1276 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
SCAF8Q9UPN6 AC021660.2-201ENST00000502999 388 ntTSL 3 BASIC25.43■■□□□ 1.66
SCAF8Q9UPN6 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
SCAF8Q9UPN6 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
SCAF8Q9UPN6 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
SCAF8Q9UPN6 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
SCAF8Q9UPN6 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
SCAF8Q9UPN6 TM4SF5-201ENST00000270560 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
SCAF8Q9UPN6 NUDT22-201ENST00000279206 1094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
SCAF8Q9UPN6 SLC35A2-202ENST00000376512 903 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
SCAF8Q9UPN6 ASMTL-AS1-203ENST00000425740 840 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
SCAF8Q9UPN6 RHEB-204ENST00000472642 900 ntTSL 3 BASIC25.42■■□□□ 1.66
SCAF8Q9UPN6 AC007322.4-201ENST00000509611 723 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
SCAF8Q9UPN6 SCARA5-203ENST00000518030 1074 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
SCAF8Q9UPN6 C14orf28-204ENST00000557112 1097 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
SCAF8Q9UPN6 Z92544.1-201ENST00000567091 730 ntTSL 3 BASIC25.42■■□□□ 1.66
SCAF8Q9UPN6 CIRBP-211ENST00000586773 942 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
SCAF8Q9UPN6 PLEKHJ1-205ENST00000587394 937 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
SCAF8Q9UPN6 AC003102.1-201ENST00000588279 569 ntTSL 4 BASIC25.42■■□□□ 1.66
SCAF8Q9UPN6 AC008694.1-202ENST00000636953 945 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
SCAF8Q9UPN6 MYC-209ENST00000641252 345 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
SCAF8Q9UPN6 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
SCAF8Q9UPN6 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
SCAF8Q9UPN6 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
SCAF8Q9UPN6 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
SCAF8Q9UPN6 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
SCAF8Q9UPN6 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
SCAF8Q9UPN6 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
SCAF8Q9UPN6 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC25.42■■□□□ 1.66
SCAF8Q9UPN6 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
SCAF8Q9UPN6 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
SCAF8Q9UPN6 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
SCAF8Q9UPN6 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.41■■□□□ 1.66
SCAF8Q9UPN6 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
SCAF8Q9UPN6 PSPN-201ENST00000245810 471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
SCAF8Q9UPN6 NREP-209ENST00000455559 698 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.41■■□□□ 1.66
SCAF8Q9UPN6 AL365295.1-202ENST00000456100 562 ntTSL 4 BASIC25.41■■□□□ 1.66
SCAF8Q9UPN6 ADM-205ENST00000528544 586 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
SCAF8Q9UPN6 IGFBP6-203ENST00000548547 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
SCAF8Q9UPN6 BEAN1-AS1-201ENST00000564618 533 ntTSL 4 BASIC25.41■■□□□ 1.66
SCAF8Q9UPN6 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
SCAF8Q9UPN6 AC006058.3-201ENST00000606217 1069 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
SCAF8Q9UPN6 CCDC74A-201ENST00000295171 1543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
SCAF8Q9UPN6 CCDC74B-201ENST00000310463 1549 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
SCAF8Q9UPN6 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
SCAF8Q9UPN6 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
SCAF8Q9UPN6 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
SCAF8Q9UPN6 RHBDL1-202ENST00000352681 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
SCAF8Q9UPN6 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
SCAF8Q9UPN6 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
SCAF8Q9UPN6 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
SCAF8Q9UPN6 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
SCAF8Q9UPN6 PMAIP1-201ENST00000269518 1262 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
SCAF8Q9UPN6 GCC2-AS1-201ENST00000322353 558 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
SCAF8Q9UPN6 HSD17B10-202ENST00000375298 823 ntTSL 3 BASIC25.4■■□□□ 1.66
SCAF8Q9UPN6 DGCR6L-202ENST00000405465 962 ntTSL 3 BASIC25.4■■□□□ 1.66
SCAF8Q9UPN6 AC009086.2-201ENST00000449759 610 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.4■■□□□ 1.66
SCAF8Q9UPN6 ZNF263-205ENST00000574253 1139 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
SCAF8Q9UPN6 AC069236.1-201ENST00000604339 616 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
SCAF8Q9UPN6 CD24-208ENST00000622315 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
SCAF8Q9UPN6 PTX4-203ENST00000447419 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
SCAF8Q9UPN6 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
SCAF8Q9UPN6 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
SCAF8Q9UPN6 MTHFS-201ENST00000258874 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
SCAF8Q9UPN6 CFC1-201ENST00000259216 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
SCAF8Q9UPN6 CFC1B-201ENST00000281882 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
SCAF8Q9UPN6 SEC61A2-206ENST00000379051 707 ntTSL 3 BASIC25.39■■□□□ 1.66
SCAF8Q9UPN6 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
SCAF8Q9UPN6 DNAJA4-210ENST00000489435 947 ntTSL 3 BASIC25.39■■□□□ 1.66
SCAF8Q9UPN6 CASP6-205ENST00000505486 538 ntTSL 4 BASIC25.39■■□□□ 1.66
SCAF8Q9UPN6 AC100835.1-201ENST00000565737 498 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
SCAF8Q9UPN6 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
SCAF8Q9UPN6 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
SCAF8Q9UPN6 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
SCAF8Q9UPN6 HAUS4-203ENST00000347758 1428 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
SCAF8Q9UPN6 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
SCAF8Q9UPN6 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
SCAF8Q9UPN6 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
SCAF8Q9UPN6 UPK3B-203ENST00000394849 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
SCAF8Q9UPN6 AL512625.2-201ENST00000417533 625 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
SCAF8Q9UPN6 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
SCAF8Q9UPN6 OR2A1-AS1-201ENST00000462305 773 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
SCAF8Q9UPN6 AC004889.1-204ENST00000474656 773 ntTSL 3 BASIC25.38■■□□□ 1.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.3 ms