Protein–RNA interactions for Protein: Q9UN88

GABRQ, Gamma-aminobutyric acid receptor subunit theta, humanhuman

Predictions only

Length 632 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GABRQQ9UN88 ELOVL2-AS1-201ENST00000456190 737 ntTSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
GABRQQ9UN88 RTBDN-203ENST00000458671 1066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
GABRQQ9UN88 TMEM9B-203ENST00000528117 949 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
GABRQQ9UN88 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
GABRQQ9UN88 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
GABRQQ9UN88 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
GABRQQ9UN88 KATNAL2-208ENST00000592005 1348 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
GABRQQ9UN88 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
GABRQQ9UN88 AC010980.2-201ENST00000587099 1412 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
GABRQQ9UN88 ELF3-AS1-202ENST00000419190 788 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
GABRQQ9UN88 LTB-210ENST00000429299 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
GABRQQ9UN88 STPG4-207ENST00000445927 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
GABRQQ9UN88 OR2A1-AS1-201ENST00000462305 773 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
GABRQQ9UN88 ATPIF1-203ENST00000468425 539 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
GABRQQ9UN88 AC004889.1-204ENST00000474656 773 ntTSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
GABRQQ9UN88 AC105001.1-201ENST00000506149 821 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
GABRQQ9UN88 ISCU-212ENST00000547005 795 ntTSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
GABRQQ9UN88 AC073648.6-201ENST00000641589 218 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
GABRQQ9UN88 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
GABRQQ9UN88 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
GABRQQ9UN88 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
GABRQQ9UN88 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
GABRQQ9UN88 SYNE2-201ENST00000341472 1132 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
GABRQQ9UN88 PEX7-202ENST00000367756 680 ntTSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
GABRQQ9UN88 SGO1-AS1-202ENST00000448208 819 ntTSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
GABRQQ9UN88 AL359182.2-201ENST00000457720 606 ntTSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
GABRQQ9UN88 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
GABRQQ9UN88 PTGIR-205ENST00000597185 775 ntTSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
GABRQQ9UN88 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
GABRQQ9UN88 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
GABRQQ9UN88 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
GABRQQ9UN88 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
GABRQQ9UN88 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
GABRQQ9UN88 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
GABRQQ9UN88 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
GABRQQ9UN88 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
GABRQQ9UN88 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
GABRQQ9UN88 SYNGR1-201ENST00000216155 497 ntTSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
GABRQQ9UN88 LINC00471-201ENST00000313064 1282 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
GABRQQ9UN88 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
GABRQQ9UN88 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
GABRQQ9UN88 AC026366.1-201ENST00000488803 879 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
GABRQQ9UN88 UNC93B5-201ENST00000530315 699 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
GABRQQ9UN88 USP36-216ENST00000589424 970 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
GABRQQ9UN88 C17orf50-201ENST00000603305 569 ntTSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
GABRQQ9UN88 C17orf50-203ENST00000605587 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
GABRQQ9UN88 BX649632.1-201ENST00000610187 819 ntTSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
GABRQQ9UN88 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
GABRQQ9UN88 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
GABRQQ9UN88 ACADS-202ENST00000411593 1398 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
GABRQQ9UN88 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
GABRQQ9UN88 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
GABRQQ9UN88 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
GABRQQ9UN88 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
GABRQQ9UN88 TRPT1-201ENST00000317459 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
GABRQQ9UN88 AC008667.2-201ENST00000504413 469 ntTSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
GABRQQ9UN88 AC022167.3-201ENST00000564485 427 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
GABRQQ9UN88 AP2S1-207ENST00000599990 829 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
GABRQQ9UN88 ETHE1-205ENST00000600651 1052 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
GABRQQ9UN88 MAGIX-206ENST00000615626 1057 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
GABRQQ9UN88 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
GABRQQ9UN88 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
GABRQQ9UN88 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
GABRQQ9UN88 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
GABRQQ9UN88 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
GABRQQ9UN88 LINC02199-202ENST00000510067 1008 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
GABRQQ9UN88 AC008550.1-201ENST00000511500 884 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
GABRQQ9UN88 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
GABRQQ9UN88 AL049874.3-201ENST00000557618 868 ntTSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
GABRQQ9UN88 GPX1-204ENST00000620890 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
GABRQQ9UN88 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
GABRQQ9UN88 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
GABRQQ9UN88 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
GABRQQ9UN88 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
GABRQQ9UN88 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
GABRQQ9UN88 HAUS4-203ENST00000347758 1428 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
GABRQQ9UN88 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
GABRQQ9UN88 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
GABRQQ9UN88 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
GABRQQ9UN88 F8A2-201ENST00000369505 1116 ntAPPRIS P1 BASIC24.25■■□□□ 1.47
GABRQQ9UN88 PUSL1-201ENST00000379031 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
GABRQQ9UN88 NUDT22-204ENST00000441250 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
GABRQQ9UN88 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
GABRQQ9UN88 AC006435.1-201ENST00000571775 1065 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
GABRQQ9UN88 CD151-213ENST00000528011 1369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
GABRQQ9UN88 CTDSP2-204ENST00000548823 1368 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
GABRQQ9UN88 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
GABRQQ9UN88 NPDC1-202ENST00000371601 1494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
GABRQQ9UN88 PTX4-203ENST00000447419 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
GABRQQ9UN88 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
GABRQQ9UN88 SMARCB1-202ENST00000344921 1728 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
GABRQQ9UN88 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
GABRQQ9UN88 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
GABRQQ9UN88 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
GABRQQ9UN88 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
GABRQQ9UN88 ANKRD39-201ENST00000393537 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
GABRQQ9UN88 RHOD-202ENST00000532559 538 ntTSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
GABRQQ9UN88 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
GABRQQ9UN88 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
GABRQQ9UN88 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.4 ms