Protein–RNA interactions for Protein: Q9UMY4

SNX12, Sorting nexin-12, humanhuman

Predictions only

Length 172 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX12Q9UMY4 CXCR3-201ENST00000373691 1861 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SNX12Q9UMY4 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SNX12Q9UMY4 CAV2-201ENST00000222693 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SNX12Q9UMY4 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SNX12Q9UMY4 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SNX12Q9UMY4 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SNX12Q9UMY4 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SNX12Q9UMY4 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
SNX12Q9UMY4 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
SNX12Q9UMY4 NEU4-202ENST00000391969 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SNX12Q9UMY4 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SNX12Q9UMY4 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
SNX12Q9UMY4 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
SNX12Q9UMY4 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
SNX12Q9UMY4 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
SNX12Q9UMY4 PELI3-202ENST00000349459 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SNX12Q9UMY4 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SNX12Q9UMY4 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SNX12Q9UMY4 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SNX12Q9UMY4 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SNX12Q9UMY4 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SNX12Q9UMY4 NDUFAF6-203ENST00000396124 1798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SNX12Q9UMY4 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SNX12Q9UMY4 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SNX12Q9UMY4 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SNX12Q9UMY4 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SNX12Q9UMY4 SUSD1-202ENST00000374263 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
SNX12Q9UMY4 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
SNX12Q9UMY4 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SNX12Q9UMY4 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
SNX12Q9UMY4 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
SNX12Q9UMY4 B3GAT3-202ENST00000531383 2056 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
SNX12Q9UMY4 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SNX12Q9UMY4 SMPDL3A-203ENST00000539041 1755 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
SNX12Q9UMY4 SHKBP1-225ENST00000600733 2284 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
SNX12Q9UMY4 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
SNX12Q9UMY4 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SNX12Q9UMY4 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
SNX12Q9UMY4 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
SNX12Q9UMY4 FBXL15-202ENST00000369956 2344 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SNX12Q9UMY4 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SNX12Q9UMY4 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SNX12Q9UMY4 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SNX12Q9UMY4 FDFT1-210ENST00000525954 1890 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SNX12Q9UMY4 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SNX12Q9UMY4 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SNX12Q9UMY4 PLEKHH3-201ENST00000293349 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SNX12Q9UMY4 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SNX12Q9UMY4 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SNX12Q9UMY4 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SNX12Q9UMY4 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SNX12Q9UMY4 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SNX12Q9UMY4 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SNX12Q9UMY4 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
SNX12Q9UMY4 ZIM2-206ENST00000599935 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SNX12Q9UMY4 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SNX12Q9UMY4 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SNX12Q9UMY4 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SNX12Q9UMY4 GRINA-201ENST00000313269 1968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SNX12Q9UMY4 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SNX12Q9UMY4 RNF32-207ENST00000405335 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SNX12Q9UMY4 SNUPN-205ENST00000564644 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SNX12Q9UMY4 SMIM10L2B-201ENST00000433425 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SNX12Q9UMY4 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SNX12Q9UMY4 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SNX12Q9UMY4 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SNX12Q9UMY4 TMPO-204ENST00000393053 2374 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SNX12Q9UMY4 LINC01547-202ENST00000397841 2303 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SNX12Q9UMY4 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SNX12Q9UMY4 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SNX12Q9UMY4 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SNX12Q9UMY4 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SNX12Q9UMY4 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
SNX12Q9UMY4 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SNX12Q9UMY4 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
SNX12Q9UMY4 MLST8-202ENST00000382450 1861 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SNX12Q9UMY4 MLST8-215ENST00000564088 1861 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SNX12Q9UMY4 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SNX12Q9UMY4 CYP27A1-201ENST00000258415 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SNX12Q9UMY4 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SNX12Q9UMY4 TMEM62-201ENST00000260403 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SNX12Q9UMY4 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SNX12Q9UMY4 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SNX12Q9UMY4 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SNX12Q9UMY4 SCRT1-201ENST00000569446 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SNX12Q9UMY4 FUBP3-201ENST00000319725 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SNX12Q9UMY4 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SNX12Q9UMY4 GALNT10-202ENST00000377661 3778 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SNX12Q9UMY4 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SNX12Q9UMY4 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SNX12Q9UMY4 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SNX12Q9UMY4 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SNX12Q9UMY4 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SNX12Q9UMY4 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
SNX12Q9UMY4 TUBGCP3-204ENST00000464139 2461 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SNX12Q9UMY4 FAM129C-203ENST00000449408 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SNX12Q9UMY4 JAKMIP1-203ENST00000409371 2420 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SNX12Q9UMY4 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SNX12Q9UMY4 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SNX12Q9UMY4 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18 ms