Protein–RNA interactions for Protein: Q9UL42

PNMA2, Paraneoplastic antigen Ma2, humanhuman

Predictions only

Length 364 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PNMA2Q9UL42 BX890604.1-207ENST00000486571 904 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
PNMA2Q9UL42 HMX1-202ENST00000506970 651 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
PNMA2Q9UL42 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
PNMA2Q9UL42 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
PNMA2Q9UL42 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
PNMA2Q9UL42 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
PNMA2Q9UL42 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
PNMA2Q9UL42 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
PNMA2Q9UL42 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
PNMA2Q9UL42 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
PNMA2Q9UL42 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
PNMA2Q9UL42 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
PNMA2Q9UL42 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
PNMA2Q9UL42 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
PNMA2Q9UL42 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
PNMA2Q9UL42 HAGH-203ENST00000455446 1276 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
PNMA2Q9UL42 PPP1R14BP3-201ENST00000509033 445 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
PNMA2Q9UL42 LINC02091-201ENST00000576171 1185 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
PNMA2Q9UL42 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.47■■□□□ 1.51
PNMA2Q9UL42 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
PNMA2Q9UL42 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
PNMA2Q9UL42 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
PNMA2Q9UL42 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
PNMA2Q9UL42 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
PNMA2Q9UL42 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
PNMA2Q9UL42 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
PNMA2Q9UL42 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
PNMA2Q9UL42 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
PNMA2Q9UL42 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
PNMA2Q9UL42 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
PNMA2Q9UL42 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
PNMA2Q9UL42 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
PNMA2Q9UL42 UCHL5-204ENST00000367451 1346 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
PNMA2Q9UL42 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
PNMA2Q9UL42 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
PNMA2Q9UL42 AC009086.2-201ENST00000449759 610 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
PNMA2Q9UL42 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
PNMA2Q9UL42 DUX4L16-201ENST00000555130 1264 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
PNMA2Q9UL42 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC24.46■■□□□ 1.51
PNMA2Q9UL42 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
PNMA2Q9UL42 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
PNMA2Q9UL42 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
PNMA2Q9UL42 TBXA2R-202ENST00000411851 1494 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.51
PNMA2Q9UL42 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
PNMA2Q9UL42 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
PNMA2Q9UL42 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
PNMA2Q9UL42 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
PNMA2Q9UL42 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
PNMA2Q9UL42 MOB2-201ENST00000329957 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
PNMA2Q9UL42 AL645608.9-201ENST00000442292 829 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
PNMA2Q9UL42 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
PNMA2Q9UL42 SLC25A29-212ENST00000555927 960 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
PNMA2Q9UL42 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.5
PNMA2Q9UL42 AL161421.1-201ENST00000619666 1101 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
PNMA2Q9UL42 PARP1-210ENST00000629232 477 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
PNMA2Q9UL42 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
PNMA2Q9UL42 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
PNMA2Q9UL42 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
PNMA2Q9UL42 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
PNMA2Q9UL42 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
PNMA2Q9UL42 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
PNMA2Q9UL42 AC007322.1-201ENST00000426983 750 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
PNMA2Q9UL42 FNDC5-207ENST00000640867 639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
PNMA2Q9UL42 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
PNMA2Q9UL42 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
PNMA2Q9UL42 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
PNMA2Q9UL42 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
PNMA2Q9UL42 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
PNMA2Q9UL42 GPR137-201ENST00000313074 1485 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
PNMA2Q9UL42 GPR137-203ENST00000411458 1495 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
PNMA2Q9UL42 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
PNMA2Q9UL42 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
PNMA2Q9UL42 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
PNMA2Q9UL42 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
PNMA2Q9UL42 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
PNMA2Q9UL42 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
PNMA2Q9UL42 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
PNMA2Q9UL42 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
PNMA2Q9UL42 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
PNMA2Q9UL42 DCXR-201ENST00000306869 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
PNMA2Q9UL42 ZNF451-202ENST00000370702 458 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
PNMA2Q9UL42 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
PNMA2Q9UL42 CROCCP5-201ENST00000436658 830 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
PNMA2Q9UL42 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
PNMA2Q9UL42 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
PNMA2Q9UL42 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
PNMA2Q9UL42 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
PNMA2Q9UL42 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
PNMA2Q9UL42 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
PNMA2Q9UL42 NCF1B-203ENST00000435988 1254 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
PNMA2Q9UL42 COL19A1-203ENST00000478620 589 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
PNMA2Q9UL42 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
PNMA2Q9UL42 GNAO1-211ENST00000570235 568 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
PNMA2Q9UL42 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
PNMA2Q9UL42 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
PNMA2Q9UL42 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
PNMA2Q9UL42 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
PNMA2Q9UL42 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
PNMA2Q9UL42 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
PNMA2Q9UL42 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.6 ms