Protein–RNA interactions for Protein: Q9UL41

PNMA3, Paraneoplastic antigen Ma3, humanhuman

Predictions only

Length 463 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PNMA3Q9UL41 TRIM35-203ENST00000521253 1215 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
PNMA3Q9UL41 AP000785.1-201ENST00000527314 613 ntTSL 4 BASIC24.7■■□□□ 1.54
PNMA3Q9UL41 FGF13-208ENST00000626909 1039 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
PNMA3Q9UL41 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
PNMA3Q9UL41 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
PNMA3Q9UL41 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
PNMA3Q9UL41 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
PNMA3Q9UL41 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
PNMA3Q9UL41 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
PNMA3Q9UL41 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
PNMA3Q9UL41 GCC2-AS1-201ENST00000322353 558 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
PNMA3Q9UL41 WIPF1-207ENST00000410117 777 ntTSL 3 BASIC24.69■■□□□ 1.54
PNMA3Q9UL41 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
PNMA3Q9UL41 FAM219B-212ENST00000565772 1249 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
PNMA3Q9UL41 DHPS-223ENST00000614126 1124 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
PNMA3Q9UL41 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
PNMA3Q9UL41 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
PNMA3Q9UL41 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
PNMA3Q9UL41 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
PNMA3Q9UL41 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
PNMA3Q9UL41 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
PNMA3Q9UL41 FAM229A-204ENST00000432622 699 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
PNMA3Q9UL41 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
PNMA3Q9UL41 OGFR-204ENST00000621591 1194 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
PNMA3Q9UL41 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
PNMA3Q9UL41 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
PNMA3Q9UL41 MREG-201ENST00000263268 1314 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
PNMA3Q9UL41 AK4-208ENST00000546702 1335 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
PNMA3Q9UL41 SMNDC1-201ENST00000369592 1110 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.67■■□□□ 1.54
PNMA3Q9UL41 KHDRBS1-204ENST00000492989 1215 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
PNMA3Q9UL41 ZNF346-203ENST00000503425 1191 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
PNMA3Q9UL41 PTGIR-205ENST00000597185 775 ntTSL 3 BASIC24.67■■□□□ 1.54
PNMA3Q9UL41 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
PNMA3Q9UL41 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC24.67■■□□□ 1.54
PNMA3Q9UL41 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
PNMA3Q9UL41 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
PNMA3Q9UL41 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
PNMA3Q9UL41 AC083805.3-201ENST00000619560 1315 ntTSL 3 BASIC24.66■■□□□ 1.54
PNMA3Q9UL41 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
PNMA3Q9UL41 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
PNMA3Q9UL41 SDHC-201ENST00000342751 1127 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
PNMA3Q9UL41 TPT1-AS1-210ENST00000520590 873 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
PNMA3Q9UL41 PLLP-204ENST00000569059 665 ntTSL 3 BASIC24.66■■□□□ 1.54
PNMA3Q9UL41 C19orf25-213ENST00000592872 1287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
PNMA3Q9UL41 AC016405.3-201ENST00000607710 860 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
PNMA3Q9UL41 ADD3-AS1-204ENST00000627565 388 ntTSL 3 BASIC24.66■■□□□ 1.54
PNMA3Q9UL41 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
PNMA3Q9UL41 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
PNMA3Q9UL41 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
PNMA3Q9UL41 FASTK-217ENST00000540185 1609 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
PNMA3Q9UL41 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
PNMA3Q9UL41 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
PNMA3Q9UL41 SERF1A-201ENST00000317633 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
PNMA3Q9UL41 MRPL12-201ENST00000333676 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
PNMA3Q9UL41 POLR2J-202ENST00000393794 784 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
PNMA3Q9UL41 AC093787.1-201ENST00000450396 207 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
PNMA3Q9UL41 ATPIF1-203ENST00000468425 539 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
PNMA3Q9UL41 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
PNMA3Q9UL41 GPX1-204ENST00000620890 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
PNMA3Q9UL41 CLN3-240ENST00000631023 1586 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
PNMA3Q9UL41 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
PNMA3Q9UL41 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
PNMA3Q9UL41 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
PNMA3Q9UL41 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
PNMA3Q9UL41 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
PNMA3Q9UL41 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
PNMA3Q9UL41 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
PNMA3Q9UL41 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
PNMA3Q9UL41 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
PNMA3Q9UL41 MEA1-201ENST00000244711 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
PNMA3Q9UL41 LINC01191-201ENST00000412690 844 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
PNMA3Q9UL41 AL391244.2-201ENST00000428932 543 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
PNMA3Q9UL41 AKAIN1-201ENST00000434239 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
PNMA3Q9UL41 AC105001.1-201ENST00000506149 821 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
PNMA3Q9UL41 AC011611.3-201ENST00000552367 569 ntTSL 4 BASIC24.64■■□□□ 1.54
PNMA3Q9UL41 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
PNMA3Q9UL41 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
PNMA3Q9UL41 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
PNMA3Q9UL41 MMP23B-202ENST00000378675 1309 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
PNMA3Q9UL41 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
PNMA3Q9UL41 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
PNMA3Q9UL41 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
PNMA3Q9UL41 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
PNMA3Q9UL41 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
PNMA3Q9UL41 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
PNMA3Q9UL41 ASIP-201ENST00000374954 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
PNMA3Q9UL41 AC106738.2-202ENST00000558156 533 ntTSL 4 BASIC24.63■■□□□ 1.53
PNMA3Q9UL41 AC138028.5-201ENST00000566114 558 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
PNMA3Q9UL41 GDF6-203ENST00000621429 1179 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
PNMA3Q9UL41 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
PNMA3Q9UL41 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
PNMA3Q9UL41 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
PNMA3Q9UL41 GSEC-202ENST00000629441 1572 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
PNMA3Q9UL41 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
PNMA3Q9UL41 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
PNMA3Q9UL41 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
PNMA3Q9UL41 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
PNMA3Q9UL41 RNPS1-201ENST00000301730 1276 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
PNMA3Q9UL41 TTC9B-201ENST00000311308 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
PNMA3Q9UL41 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 80.7 ms