Protein–RNA interactions for Protein: Q9UL12

SARDH, Sarcosine dehydrogenase, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 918 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SARDHQ9UL12 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
SARDHQ9UL12 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
SARDHQ9UL12 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
SARDHQ9UL12 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
SARDHQ9UL12 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
SARDHQ9UL12 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC21.68■■□□□ 1.06
SARDHQ9UL12 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC21.68■■□□□ 1.06
SARDHQ9UL12 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
SARDHQ9UL12 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
SARDHQ9UL12 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
SARDHQ9UL12 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
SARDHQ9UL12 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
SARDHQ9UL12 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
SARDHQ9UL12 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
SARDHQ9UL12 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
SARDHQ9UL12 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
SARDHQ9UL12 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
SARDHQ9UL12 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
SARDHQ9UL12 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
SARDHQ9UL12 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
SARDHQ9UL12 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
SARDHQ9UL12 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
SARDHQ9UL12 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
SARDHQ9UL12 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
SARDHQ9UL12 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
SARDHQ9UL12 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
SARDHQ9UL12 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
SARDHQ9UL12 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
SARDHQ9UL12 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
SARDHQ9UL12 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
SARDHQ9UL12 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
SARDHQ9UL12 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
SARDHQ9UL12 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
SARDHQ9UL12 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC21.66■■□□□ 1.06
SARDHQ9UL12 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
SARDHQ9UL12 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
SARDHQ9UL12 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
SARDHQ9UL12 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
SARDHQ9UL12 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
SARDHQ9UL12 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
SARDHQ9UL12 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
SARDHQ9UL12 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
SARDHQ9UL12 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
SARDHQ9UL12 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
SARDHQ9UL12 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
SARDHQ9UL12 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
SARDHQ9UL12 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
SARDHQ9UL12 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
SARDHQ9UL12 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
SARDHQ9UL12 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
SARDHQ9UL12 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC21.65■■□□□ 1.06
SARDHQ9UL12 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
SARDHQ9UL12 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
SARDHQ9UL12 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
SARDHQ9UL12 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
SARDHQ9UL12 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC21.64■■□□□ 1.06
SARDHQ9UL12 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
SARDHQ9UL12 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
SARDHQ9UL12 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
SARDHQ9UL12 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
SARDHQ9UL12 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
SARDHQ9UL12 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
SARDHQ9UL12 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.64■■□□□ 1.05
SARDHQ9UL12 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
SARDHQ9UL12 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
SARDHQ9UL12 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
SARDHQ9UL12 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
SARDHQ9UL12 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
SARDHQ9UL12 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
SARDHQ9UL12 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
SARDHQ9UL12 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
SARDHQ9UL12 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
SARDHQ9UL12 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
SARDHQ9UL12 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
SARDHQ9UL12 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
SARDHQ9UL12 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
SARDHQ9UL12 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SARDHQ9UL12 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SARDHQ9UL12 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SARDHQ9UL12 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
SARDHQ9UL12 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
SARDHQ9UL12 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC21.63■■□□□ 1.05
SARDHQ9UL12 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SARDHQ9UL12 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
SARDHQ9UL12 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SARDHQ9UL12 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
SARDHQ9UL12 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SARDHQ9UL12 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SARDHQ9UL12 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
SARDHQ9UL12 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
SARDHQ9UL12 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
SARDHQ9UL12 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
SARDHQ9UL12 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
SARDHQ9UL12 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
SARDHQ9UL12 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
SARDHQ9UL12 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
SARDHQ9UL12 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
SARDHQ9UL12 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
SARDHQ9UL12 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
SARDHQ9UL12 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 81.7 ms