Protein–RNA interactions for Protein: Q9UKN8

GTF3C4, General transcription factor 3C polypeptide 4, humanhuman

Predictions only

Length 822 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF3C4Q9UKN8 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC23.01■■□□□ 1.27
GTF3C4Q9UKN8 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
GTF3C4Q9UKN8 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
GTF3C4Q9UKN8 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
GTF3C4Q9UKN8 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
GTF3C4Q9UKN8 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
GTF3C4Q9UKN8 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
GTF3C4Q9UKN8 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
GTF3C4Q9UKN8 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
GTF3C4Q9UKN8 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
GTF3C4Q9UKN8 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
GTF3C4Q9UKN8 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC23■■□□□ 1.27
GTF3C4Q9UKN8 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
GTF3C4Q9UKN8 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
GTF3C4Q9UKN8 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
GTF3C4Q9UKN8 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
GTF3C4Q9UKN8 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
GTF3C4Q9UKN8 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
GTF3C4Q9UKN8 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
GTF3C4Q9UKN8 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
GTF3C4Q9UKN8 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
GTF3C4Q9UKN8 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
GTF3C4Q9UKN8 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
GTF3C4Q9UKN8 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
GTF3C4Q9UKN8 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
GTF3C4Q9UKN8 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC22.99■■□□□ 1.27
GTF3C4Q9UKN8 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
GTF3C4Q9UKN8 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
GTF3C4Q9UKN8 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
GTF3C4Q9UKN8 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
GTF3C4Q9UKN8 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
GTF3C4Q9UKN8 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
GTF3C4Q9UKN8 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
GTF3C4Q9UKN8 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
GTF3C4Q9UKN8 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
GTF3C4Q9UKN8 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
GTF3C4Q9UKN8 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
GTF3C4Q9UKN8 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
GTF3C4Q9UKN8 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
GTF3C4Q9UKN8 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
GTF3C4Q9UKN8 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
GTF3C4Q9UKN8 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
GTF3C4Q9UKN8 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC22.98■■□□□ 1.27
GTF3C4Q9UKN8 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
GTF3C4Q9UKN8 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
GTF3C4Q9UKN8 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
GTF3C4Q9UKN8 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
GTF3C4Q9UKN8 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
GTF3C4Q9UKN8 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
GTF3C4Q9UKN8 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
GTF3C4Q9UKN8 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
GTF3C4Q9UKN8 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
GTF3C4Q9UKN8 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
GTF3C4Q9UKN8 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC22.97■■□□□ 1.27
GTF3C4Q9UKN8 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
GTF3C4Q9UKN8 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
GTF3C4Q9UKN8 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
GTF3C4Q9UKN8 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
GTF3C4Q9UKN8 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
GTF3C4Q9UKN8 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
GTF3C4Q9UKN8 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
GTF3C4Q9UKN8 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
GTF3C4Q9UKN8 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
GTF3C4Q9UKN8 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC22.96■■□□□ 1.27
GTF3C4Q9UKN8 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
GTF3C4Q9UKN8 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
GTF3C4Q9UKN8 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
GTF3C4Q9UKN8 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
GTF3C4Q9UKN8 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
GTF3C4Q9UKN8 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
GTF3C4Q9UKN8 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
GTF3C4Q9UKN8 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
GTF3C4Q9UKN8 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
GTF3C4Q9UKN8 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
GTF3C4Q9UKN8 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
GTF3C4Q9UKN8 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
GTF3C4Q9UKN8 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
GTF3C4Q9UKN8 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
GTF3C4Q9UKN8 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
GTF3C4Q9UKN8 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
GTF3C4Q9UKN8 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
GTF3C4Q9UKN8 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
GTF3C4Q9UKN8 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
GTF3C4Q9UKN8 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
GTF3C4Q9UKN8 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
GTF3C4Q9UKN8 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
GTF3C4Q9UKN8 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
GTF3C4Q9UKN8 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC22.94■■□□□ 1.26
GTF3C4Q9UKN8 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
GTF3C4Q9UKN8 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
GTF3C4Q9UKN8 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
GTF3C4Q9UKN8 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
GTF3C4Q9UKN8 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
GTF3C4Q9UKN8 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
GTF3C4Q9UKN8 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
GTF3C4Q9UKN8 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC22.94■■□□□ 1.26
GTF3C4Q9UKN8 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
GTF3C4Q9UKN8 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
GTF3C4Q9UKN8 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
GTF3C4Q9UKN8 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.4 ms