Protein–RNA interactions for Protein: Q9UKI2

CDC42EP3, Cdc42 effector protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 254 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDC42EP3Q9UKI2 SNHG6-203ENST00000520944 638 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CDC42EP3Q9UKI2 NDUFS3-207ENST00000529276 558 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
CDC42EP3Q9UKI2 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
CDC42EP3Q9UKI2 IL34-204ENST00000566361 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CDC42EP3Q9UKI2 AL138781.1-201ENST00000566567 1274 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
CDC42EP3Q9UKI2 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CDC42EP3Q9UKI2 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
CDC42EP3Q9UKI2 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CDC42EP3Q9UKI2 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC17.76■□□□□ 0.43
CDC42EP3Q9UKI2 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CDC42EP3Q9UKI2 MAP3K21-203ENST00000366624 5809 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CDC42EP3Q9UKI2 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CDC42EP3Q9UKI2 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CDC42EP3Q9UKI2 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CDC42EP3Q9UKI2 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
CDC42EP3Q9UKI2 BHLHA15-201ENST00000314018 706 ntAPPRIS P1 BASIC17.75■□□□□ 0.43
CDC42EP3Q9UKI2 LINC02531-201ENST00000404689 593 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
CDC42EP3Q9UKI2 LINC01117-201ENST00000443670 699 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
CDC42EP3Q9UKI2 NCAPD3-204ENST00000526422 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
CDC42EP3Q9UKI2 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CDC42EP3Q9UKI2 DUX4L16-201ENST00000555130 1264 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
CDC42EP3Q9UKI2 DET1-205ENST00000558413 583 ntTSL 4 BASIC17.75■□□□□ 0.43
CDC42EP3Q9UKI2 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
CDC42EP3Q9UKI2 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CDC42EP3Q9UKI2 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
CDC42EP3Q9UKI2 BHLHA15-202ENST00000609256 796 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
CDC42EP3Q9UKI2 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CDC42EP3Q9UKI2 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC17.75■□□□□ 0.43
CDC42EP3Q9UKI2 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CDC42EP3Q9UKI2 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
CDC42EP3Q9UKI2 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CDC42EP3Q9UKI2 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
CDC42EP3Q9UKI2 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
CDC42EP3Q9UKI2 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
CDC42EP3Q9UKI2 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CDC42EP3Q9UKI2 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CDC42EP3Q9UKI2 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CDC42EP3Q9UKI2 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CDC42EP3Q9UKI2 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CDC42EP3Q9UKI2 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CDC42EP3Q9UKI2 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CDC42EP3Q9UKI2 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
CDC42EP3Q9UKI2 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CDC42EP3Q9UKI2 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CDC42EP3Q9UKI2 SBK2-201ENST00000344158 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
CDC42EP3Q9UKI2 SBK2-202ENST00000413299 1085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
CDC42EP3Q9UKI2 FADS3-204ENST00000525588 1254 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
CDC42EP3Q9UKI2 AC027451.1-201ENST00000530667 553 ntTSL 4 BASIC17.74■□□□□ 0.43
CDC42EP3Q9UKI2 MIR4651-201ENST00000582622 73 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
CDC42EP3Q9UKI2 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
CDC42EP3Q9UKI2 JADE2-211ENST00000612830 1251 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CDC42EP3Q9UKI2 FGF13-208ENST00000626909 1039 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
CDC42EP3Q9UKI2 TBCB-214ENST00000629269 413 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
CDC42EP3Q9UKI2 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CDC42EP3Q9UKI2 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
CDC42EP3Q9UKI2 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CDC42EP3Q9UKI2 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CDC42EP3Q9UKI2 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CDC42EP3Q9UKI2 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CDC42EP3Q9UKI2 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
CDC42EP3Q9UKI2 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
CDC42EP3Q9UKI2 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
CDC42EP3Q9UKI2 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
CDC42EP3Q9UKI2 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
CDC42EP3Q9UKI2 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CDC42EP3Q9UKI2 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
CDC42EP3Q9UKI2 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CDC42EP3Q9UKI2 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
CDC42EP3Q9UKI2 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
CDC42EP3Q9UKI2 GUK1-201ENST00000312726 1084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CDC42EP3Q9UKI2 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CDC42EP3Q9UKI2 SPDYE2-201ENST00000341656 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CDC42EP3Q9UKI2 C2orf82-203ENST00000409533 561 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC17.73■□□□□ 0.43
CDC42EP3Q9UKI2 SPDYE2B-202ENST00000455020 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CDC42EP3Q9UKI2 AF201337.1-201ENST00000520239 748 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
CDC42EP3Q9UKI2 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
CDC42EP3Q9UKI2 CHEK2P2-202ENST00000555186 864 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
CDC42EP3Q9UKI2 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.73■□□□□ 0.43
CDC42EP3Q9UKI2 MAGIX-202ENST00000595224 1238 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
CDC42EP3Q9UKI2 TOR2A-201ENST00000336067 1370 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
CDC42EP3Q9UKI2 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
CDC42EP3Q9UKI2 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CDC42EP3Q9UKI2 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CDC42EP3Q9UKI2 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
CDC42EP3Q9UKI2 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CDC42EP3Q9UKI2 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CDC42EP3Q9UKI2 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CDC42EP3Q9UKI2 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CDC42EP3Q9UKI2 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CDC42EP3Q9UKI2 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CDC42EP3Q9UKI2 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CDC42EP3Q9UKI2 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CDC42EP3Q9UKI2 SERTAD4-AS1-201ENST00000437764 726 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CDC42EP3Q9UKI2 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CDC42EP3Q9UKI2 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CDC42EP3Q9UKI2 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CDC42EP3Q9UKI2 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CDC42EP3Q9UKI2 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CDC42EP3Q9UKI2 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CDC42EP3Q9UKI2 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.8 ms