Protein–RNA interactions for Protein: Q9UHP3

USP25, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 25, humanhuman

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Length 1,055 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP25Q9UHP3 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
USP25Q9UHP3 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
USP25Q9UHP3 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
USP25Q9UHP3 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
USP25Q9UHP3 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
USP25Q9UHP3 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
USP25Q9UHP3 WEE1-202ENST00000450114 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
USP25Q9UHP3 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
USP25Q9UHP3 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
USP25Q9UHP3 DISC1-213ENST00000537876 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
USP25Q9UHP3 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
USP25Q9UHP3 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
USP25Q9UHP3 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC24.36■■□□□ 1.49
USP25Q9UHP3 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
USP25Q9UHP3 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
USP25Q9UHP3 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
USP25Q9UHP3 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
USP25Q9UHP3 ZFP64-206ENST00000371523 2234 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
USP25Q9UHP3 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
USP25Q9UHP3 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
USP25Q9UHP3 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
USP25Q9UHP3 RAVER2-201ENST00000294428 4398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
USP25Q9UHP3 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
USP25Q9UHP3 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
USP25Q9UHP3 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
USP25Q9UHP3 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
USP25Q9UHP3 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC24.35■■□□□ 1.49
USP25Q9UHP3 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
USP25Q9UHP3 BRSK2-208ENST00000528841 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
USP25Q9UHP3 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
USP25Q9UHP3 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
USP25Q9UHP3 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
USP25Q9UHP3 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
USP25Q9UHP3 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
USP25Q9UHP3 TMEM121B-201ENST00000331437 4954 ntAPPRIS P3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
USP25Q9UHP3 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
USP25Q9UHP3 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
USP25Q9UHP3 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
USP25Q9UHP3 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
USP25Q9UHP3 CACTIN-202ENST00000248420 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
USP25Q9UHP3 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
USP25Q9UHP3 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
USP25Q9UHP3 UNKL-205ENST00000397464 2180 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
USP25Q9UHP3 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
USP25Q9UHP3 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
USP25Q9UHP3 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
USP25Q9UHP3 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
USP25Q9UHP3 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
USP25Q9UHP3 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
USP25Q9UHP3 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
USP25Q9UHP3 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
USP25Q9UHP3 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
USP25Q9UHP3 SPATA5L1-201ENST00000305560 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
USP25Q9UHP3 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
USP25Q9UHP3 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
USP25Q9UHP3 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
USP25Q9UHP3 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
USP25Q9UHP3 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
USP25Q9UHP3 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
USP25Q9UHP3 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
USP25Q9UHP3 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
USP25Q9UHP3 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
USP25Q9UHP3 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
USP25Q9UHP3 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
USP25Q9UHP3 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.49
USP25Q9UHP3 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.49
USP25Q9UHP3 CHRNB2-205ENST00000637900 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
USP25Q9UHP3 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
USP25Q9UHP3 EZH2-201ENST00000320356 2639 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
USP25Q9UHP3 AGAP4-207ENST00000616763 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
USP25Q9UHP3 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC24.33■■□□□ 1.48
USP25Q9UHP3 NAB2-202ENST00000342556 2318 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.48
USP25Q9UHP3 KRT3-201ENST00000417996 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
USP25Q9UHP3 PITPNB-205ENST00000455418 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.48
USP25Q9UHP3 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
USP25Q9UHP3 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
USP25Q9UHP3 LINC01521-201ENST00000504184 1943 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
USP25Q9UHP3 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
USP25Q9UHP3 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
USP25Q9UHP3 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
USP25Q9UHP3 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
USP25Q9UHP3 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
USP25Q9UHP3 NYAP1-202ENST00000454988 2777 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
USP25Q9UHP3 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
USP25Q9UHP3 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
USP25Q9UHP3 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
USP25Q9UHP3 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
USP25Q9UHP3 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
USP25Q9UHP3 TEAD2-210ENST00000601519 2167 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
USP25Q9UHP3 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
USP25Q9UHP3 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
USP25Q9UHP3 MYL5-206ENST00000506838 2956 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
USP25Q9UHP3 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
USP25Q9UHP3 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
USP25Q9UHP3 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
USP25Q9UHP3 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
USP25Q9UHP3 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
USP25Q9UHP3 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
USP25Q9UHP3 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
USP25Q9UHP3 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
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