Protein–RNA interactions for Protein: Q9UHM6

OPN4, Melanopsin, humanhuman

Predictions only

Length 478 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OPN4Q9UHM6 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
OPN4Q9UHM6 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
OPN4Q9UHM6 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
OPN4Q9UHM6 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
OPN4Q9UHM6 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
OPN4Q9UHM6 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
OPN4Q9UHM6 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
OPN4Q9UHM6 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
OPN4Q9UHM6 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
OPN4Q9UHM6 ARPP19-201ENST00000249822 5301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
OPN4Q9UHM6 LINC01521-201ENST00000504184 1943 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
OPN4Q9UHM6 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
OPN4Q9UHM6 ARHGAP11A-205ENST00000563864 2279 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
OPN4Q9UHM6 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
OPN4Q9UHM6 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
OPN4Q9UHM6 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
OPN4Q9UHM6 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
OPN4Q9UHM6 GALNT10-202ENST00000377661 3778 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
OPN4Q9UHM6 GUCY1A3-210ENST00000513574 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
OPN4Q9UHM6 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
OPN4Q9UHM6 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
OPN4Q9UHM6 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
OPN4Q9UHM6 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
OPN4Q9UHM6 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
OPN4Q9UHM6 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
OPN4Q9UHM6 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
OPN4Q9UHM6 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
OPN4Q9UHM6 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
OPN4Q9UHM6 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
OPN4Q9UHM6 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
OPN4Q9UHM6 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
OPN4Q9UHM6 TBL1Y-201ENST00000346432 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
OPN4Q9UHM6 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
OPN4Q9UHM6 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
OPN4Q9UHM6 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
OPN4Q9UHM6 IQCJ-SCHIP1-204ENST00000485419 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
OPN4Q9UHM6 NSMF-201ENST00000265663 2981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
OPN4Q9UHM6 NSMF-206ENST00000371475 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
OPN4Q9UHM6 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
OPN4Q9UHM6 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
OPN4Q9UHM6 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
OPN4Q9UHM6 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
OPN4Q9UHM6 TEAD2-210ENST00000601519 2167 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
OPN4Q9UHM6 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
OPN4Q9UHM6 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
OPN4Q9UHM6 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
OPN4Q9UHM6 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
OPN4Q9UHM6 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
OPN4Q9UHM6 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
OPN4Q9UHM6 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
OPN4Q9UHM6 KCNMB4-201ENST00000258111 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
OPN4Q9UHM6 C7orf43-201ENST00000316937 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
OPN4Q9UHM6 SOCS2-206ENST00000549122 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
OPN4Q9UHM6 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
OPN4Q9UHM6 CEBPA-201ENST00000498907 2631 ntAPPRIS P1 BASIC18.42■□□□□ 0.54
OPN4Q9UHM6 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
OPN4Q9UHM6 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
OPN4Q9UHM6 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
OPN4Q9UHM6 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
OPN4Q9UHM6 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
OPN4Q9UHM6 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
OPN4Q9UHM6 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC18.42■□□□□ 0.54
OPN4Q9UHM6 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
OPN4Q9UHM6 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
OPN4Q9UHM6 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
OPN4Q9UHM6 NPNT-204ENST00000453617 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
OPN4Q9UHM6 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
OPN4Q9UHM6 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
OPN4Q9UHM6 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
OPN4Q9UHM6 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
OPN4Q9UHM6 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
OPN4Q9UHM6 MATR3-206ENST00000503811 2518 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
OPN4Q9UHM6 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
OPN4Q9UHM6 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
OPN4Q9UHM6 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
OPN4Q9UHM6 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
OPN4Q9UHM6 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
OPN4Q9UHM6 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
OPN4Q9UHM6 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
OPN4Q9UHM6 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
OPN4Q9UHM6 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC18.41■□□□□ 0.54
OPN4Q9UHM6 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
OPN4Q9UHM6 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
OPN4Q9UHM6 SPATA5L1-201ENST00000305560 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
OPN4Q9UHM6 PRMT8-202ENST00000382622 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
OPN4Q9UHM6 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
OPN4Q9UHM6 NYAP1-202ENST00000454988 2777 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
OPN4Q9UHM6 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
OPN4Q9UHM6 NKX1-2-201ENST00000451024 3364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
OPN4Q9UHM6 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
OPN4Q9UHM6 FYN-204ENST00000368678 2573 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
OPN4Q9UHM6 PHLDA3-202ENST00000367311 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
OPN4Q9UHM6 HEY2-201ENST00000368364 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
OPN4Q9UHM6 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
OPN4Q9UHM6 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
OPN4Q9UHM6 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
OPN4Q9UHM6 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
OPN4Q9UHM6 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
OPN4Q9UHM6 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
OPN4Q9UHM6 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.3 ms