Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBT3

DKK4, Dickkopf-related protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 224 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DKK4Q9UBT3 RPS20-210ENST00000523936 899 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
DKK4Q9UBT3 AC092143.2-201ENST00000554623 985 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
DKK4Q9UBT3 AL049780.2-201ENST00000556236 367 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
DKK4Q9UBT3 BEAN1-AS1-201ENST00000564618 533 ntTSL 4 BASIC20.13■□□□□ 0.81
DKK4Q9UBT3 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
DKK4Q9UBT3 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
DKK4Q9UBT3 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
DKK4Q9UBT3 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
DKK4Q9UBT3 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
DKK4Q9UBT3 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
DKK4Q9UBT3 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
DKK4Q9UBT3 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
DKK4Q9UBT3 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
DKK4Q9UBT3 CCS-208ENST00000533244 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
DKK4Q9UBT3 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
DKK4Q9UBT3 AL360181.5-201ENST00000368554 1044 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
DKK4Q9UBT3 RHOG-202ENST00000396978 1066 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
DKK4Q9UBT3 ATPIF1-203ENST00000468425 539 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
DKK4Q9UBT3 C17orf62-230ENST00000583617 866 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
DKK4Q9UBT3 AL591742.1-201ENST00000604433 565 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
DKK4Q9UBT3 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
DKK4Q9UBT3 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
DKK4Q9UBT3 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
DKK4Q9UBT3 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
DKK4Q9UBT3 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
DKK4Q9UBT3 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
DKK4Q9UBT3 AGTRAP-203ENST00000376629 1100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
DKK4Q9UBT3 LINC02199-202ENST00000510067 1008 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
DKK4Q9UBT3 LINC01962-201ENST00000513771 411 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
DKK4Q9UBT3 RPPH1-201ENST00000516869 333 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
DKK4Q9UBT3 MAX-217ENST00000557277 728 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
DKK4Q9UBT3 AC008403.3-201ENST00000598924 454 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
DKK4Q9UBT3 AP2S1-207ENST00000599990 829 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
DKK4Q9UBT3 AC093762.2-201ENST00000641700 291 ntAPPRIS P1 BASIC20.11■□□□□ 0.81
DKK4Q9UBT3 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
DKK4Q9UBT3 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
DKK4Q9UBT3 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
DKK4Q9UBT3 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
DKK4Q9UBT3 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
DKK4Q9UBT3 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
DKK4Q9UBT3 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
DKK4Q9UBT3 AC114730.2-201ENST00000417267 668 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
DKK4Q9UBT3 ABCC3-217ENST00000515707 656 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
DKK4Q9UBT3 AC091564.5-201ENST00000526456 820 ntTSL 4 BASIC20.1■□□□□ 0.81
DKK4Q9UBT3 JPT2-204ENST00000561516 1065 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
DKK4Q9UBT3 AL354712.1-201ENST00000563570 477 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
DKK4Q9UBT3 AC010531.1-201ENST00000568879 953 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.1■□□□□ 0.81
DKK4Q9UBT3 AC004771.5-201ENST00000575985 542 ntTSL 4 BASIC20.1■□□□□ 0.81
DKK4Q9UBT3 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
DKK4Q9UBT3 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
DKK4Q9UBT3 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
DKK4Q9UBT3 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
DKK4Q9UBT3 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
DKK4Q9UBT3 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
DKK4Q9UBT3 ART5-202ENST00000397067 1154 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
DKK4Q9UBT3 GCC2-AS1-202ENST00000440975 574 ntTSL 4 BASIC20.09■□□□□ 0.81
DKK4Q9UBT3 PBX1-209ENST00000485769 834 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
DKK4Q9UBT3 SEC23A-213ENST00000557280 561 ntTSL 4 BASIC20.09■□□□□ 0.81
DKK4Q9UBT3 AC090527.2-201ENST00000564080 1060 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
DKK4Q9UBT3 AC097641.1-201ENST00000580671 588 ntTSL 4 BASIC20.09■□□□□ 0.81
DKK4Q9UBT3 PLK5-204ENST00000588430 900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
DKK4Q9UBT3 JOSD2-205ENST00000601423 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
DKK4Q9UBT3 FAM197Y4-202ENST00000622692 608 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
DKK4Q9UBT3 AC013268.1-201ENST00000639717 1208 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
DKK4Q9UBT3 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
DKK4Q9UBT3 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
DKK4Q9UBT3 R3HCC1-210ENST00000625275 1489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
DKK4Q9UBT3 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
DKK4Q9UBT3 DKK3-203ENST00000525493 1326 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
DKK4Q9UBT3 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
DKK4Q9UBT3 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
DKK4Q9UBT3 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
DKK4Q9UBT3 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
DKK4Q9UBT3 NPDC1-202ENST00000371601 1494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
DKK4Q9UBT3 HCFC1R1-202ENST00000354679 765 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
DKK4Q9UBT3 GATS-209ENST00000454084 1030 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
DKK4Q9UBT3 RBCK1-213ENST00000475269 1200 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
DKK4Q9UBT3 ASB18-201ENST00000409749 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
DKK4Q9UBT3 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
DKK4Q9UBT3 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
DKK4Q9UBT3 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
DKK4Q9UBT3 MRAP-201ENST00000303645 935 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
DKK4Q9UBT3 C10orf76-201ENST00000311122 724 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
DKK4Q9UBT3 C6orf132-202ENST00000356542 894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
DKK4Q9UBT3 NKAIN4-201ENST00000370307 793 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
DKK4Q9UBT3 ADCYAP1-202ENST00000450565 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
DKK4Q9UBT3 OR2A1-AS1-201ENST00000462305 773 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
DKK4Q9UBT3 GLYCTK-205ENST00000473032 935 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
DKK4Q9UBT3 AC004889.1-204ENST00000474656 773 ntTSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
DKK4Q9UBT3 SFXN1-203ENST00000502393 637 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
DKK4Q9UBT3 AC122129.2-201ENST00000583598 466 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
DKK4Q9UBT3 AC060766.5-201ENST00000590539 871 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
DKK4Q9UBT3 CYP2T3P-201ENST00000601990 817 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
DKK4Q9UBT3 Z99916.2-201ENST00000604037 246 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
DKK4Q9UBT3 AC000035.1-201ENST00000634116 343 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
DKK4Q9UBT3 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
DKK4Q9UBT3 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
DKK4Q9UBT3 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
DKK4Q9UBT3 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
DKK4Q9UBT3 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.9 ms