Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBN7

HDAC6, Histone deacetylase 6, humanhuman

Predictions only

Length 1,215 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDAC6Q9UBN7 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
HDAC6Q9UBN7 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC24.12■■□□□ 1.45
HDAC6Q9UBN7 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
HDAC6Q9UBN7 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC24.12■■□□□ 1.45
HDAC6Q9UBN7 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
HDAC6Q9UBN7 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
HDAC6Q9UBN7 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
HDAC6Q9UBN7 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
HDAC6Q9UBN7 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
HDAC6Q9UBN7 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
HDAC6Q9UBN7 NT5C-201ENST00000245552 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
HDAC6Q9UBN7 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
HDAC6Q9UBN7 AC006970.2-201ENST00000450065 779 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
HDAC6Q9UBN7 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC24.11■■□□□ 1.45
HDAC6Q9UBN7 AC104771.1-201ENST00000603335 964 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
HDAC6Q9UBN7 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
HDAC6Q9UBN7 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
HDAC6Q9UBN7 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
HDAC6Q9UBN7 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
HDAC6Q9UBN7 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
HDAC6Q9UBN7 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
HDAC6Q9UBN7 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
HDAC6Q9UBN7 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
HDAC6Q9UBN7 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
HDAC6Q9UBN7 ZNF696-204ENST00000520333 605 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
HDAC6Q9UBN7 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
HDAC6Q9UBN7 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC24.1■■□□□ 1.45
HDAC6Q9UBN7 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
HDAC6Q9UBN7 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
HDAC6Q9UBN7 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
HDAC6Q9UBN7 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
HDAC6Q9UBN7 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
HDAC6Q9UBN7 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
HDAC6Q9UBN7 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
HDAC6Q9UBN7 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
HDAC6Q9UBN7 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
HDAC6Q9UBN7 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC24.09■■□□□ 1.45
HDAC6Q9UBN7 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
HDAC6Q9UBN7 METTL26-203ENST00000397664 604 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
HDAC6Q9UBN7 AL645608.9-201ENST00000442292 829 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
HDAC6Q9UBN7 SLC25A29-212ENST00000555927 960 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
HDAC6Q9UBN7 EMC9-206ENST00000560403 872 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
HDAC6Q9UBN7 AC012313.6-201ENST00000599889 790 ntTSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
HDAC6Q9UBN7 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
HDAC6Q9UBN7 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
HDAC6Q9UBN7 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
HDAC6Q9UBN7 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
HDAC6Q9UBN7 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
HDAC6Q9UBN7 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
HDAC6Q9UBN7 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
HDAC6Q9UBN7 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
HDAC6Q9UBN7 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
HDAC6Q9UBN7 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
HDAC6Q9UBN7 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
HDAC6Q9UBN7 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
HDAC6Q9UBN7 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
HDAC6Q9UBN7 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
HDAC6Q9UBN7 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
HDAC6Q9UBN7 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
HDAC6Q9UBN7 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
HDAC6Q9UBN7 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
HDAC6Q9UBN7 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
HDAC6Q9UBN7 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
HDAC6Q9UBN7 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
HDAC6Q9UBN7 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.44
HDAC6Q9UBN7 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
HDAC6Q9UBN7 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
HDAC6Q9UBN7 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
HDAC6Q9UBN7 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
HDAC6Q9UBN7 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
HDAC6Q9UBN7 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
HDAC6Q9UBN7 ZNF451-202ENST00000370702 458 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
HDAC6Q9UBN7 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
HDAC6Q9UBN7 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
HDAC6Q9UBN7 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
HDAC6Q9UBN7 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
HDAC6Q9UBN7 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
HDAC6Q9UBN7 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
HDAC6Q9UBN7 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
HDAC6Q9UBN7 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
HDAC6Q9UBN7 HRASLS-201ENST00000264735 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
HDAC6Q9UBN7 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
HDAC6Q9UBN7 PIGP-203ENST00000399098 972 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
HDAC6Q9UBN7 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
HDAC6Q9UBN7 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
HDAC6Q9UBN7 AL109923.1-201ENST00000618799 583 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
HDAC6Q9UBN7 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
HDAC6Q9UBN7 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
HDAC6Q9UBN7 TBXA2R-202ENST00000411851 1494 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
HDAC6Q9UBN7 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
HDAC6Q9UBN7 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
HDAC6Q9UBN7 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
HDAC6Q9UBN7 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
HDAC6Q9UBN7 MIR663A-201ENST00000385250 93 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
HDAC6Q9UBN7 NCF1B-203ENST00000435988 1254 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
HDAC6Q9UBN7 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
HDAC6Q9UBN7 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
HDAC6Q9UBN7 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
HDAC6Q9UBN7 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
HDAC6Q9UBN7 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.5 ms