Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBB5

MBD2, Methyl-CpG-binding domain protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 411 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MBD2Q9UBB5 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
MBD2Q9UBB5 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
MBD2Q9UBB5 DISC1-215ENST00000602281 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
MBD2Q9UBB5 EXTL3-201ENST00000220562 6483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
MBD2Q9UBB5 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
MBD2Q9UBB5 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
MBD2Q9UBB5 DISC1-202ENST00000317586 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
MBD2Q9UBB5 MARK2-202ENST00000361128 3004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
MBD2Q9UBB5 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
MBD2Q9UBB5 B3GAT3-202ENST00000531383 2056 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
MBD2Q9UBB5 FBXL7-202ENST00000504595 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
MBD2Q9UBB5 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC17.79■□□□□ 0.44
MBD2Q9UBB5 CHST1-201ENST00000308064 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
MBD2Q9UBB5 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
MBD2Q9UBB5 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
MBD2Q9UBB5 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC17.79■□□□□ 0.44
MBD2Q9UBB5 MAP4K4-205ENST00000350878 7640 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
MBD2Q9UBB5 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
MBD2Q9UBB5 PRKAR2A-201ENST00000265563 6471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
MBD2Q9UBB5 PHF12-205ENST00000577226 7679 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
MBD2Q9UBB5 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
MBD2Q9UBB5 EDA-203ENST00000374552 5278 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
MBD2Q9UBB5 TPST2-201ENST00000338754 5697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
MBD2Q9UBB5 JAKMIP1-203ENST00000409371 2420 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
MBD2Q9UBB5 RAX-202ENST00000334889 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
MBD2Q9UBB5 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
MBD2Q9UBB5 KCTD1-202ENST00000408011 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
MBD2Q9UBB5 METRNL-203ENST00000571814 1900 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
MBD2Q9UBB5 ESR2-212ENST00000556275 2695 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
MBD2Q9UBB5 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
MBD2Q9UBB5 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
MBD2Q9UBB5 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
MBD2Q9UBB5 PAN3-201ENST00000380958 2833 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
MBD2Q9UBB5 MDGA1-203ENST00000434837 10736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
MBD2Q9UBB5 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
MBD2Q9UBB5 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
MBD2Q9UBB5 DNAAF3-207ENST00000527223 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
MBD2Q9UBB5 TMEM62-201ENST00000260403 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
MBD2Q9UBB5 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
MBD2Q9UBB5 LHX6-201ENST00000340587 3457 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
MBD2Q9UBB5 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
MBD2Q9UBB5 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
MBD2Q9UBB5 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
MBD2Q9UBB5 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
MBD2Q9UBB5 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
MBD2Q9UBB5 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
MBD2Q9UBB5 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
MBD2Q9UBB5 CCDC91-207ENST00000539107 2440 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
MBD2Q9UBB5 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
MBD2Q9UBB5 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
MBD2Q9UBB5 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
MBD2Q9UBB5 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
MBD2Q9UBB5 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
MBD2Q9UBB5 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
MBD2Q9UBB5 ZSWIM8-223ENST00000605216 6004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
MBD2Q9UBB5 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
MBD2Q9UBB5 PBX1-222ENST00000627490 1769 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
MBD2Q9UBB5 FOXD2-201ENST00000334793 4675 ntAPPRIS P1 BASIC17.77■□□□□ 0.44
MBD2Q9UBB5 WDTC1-201ENST00000319394 4819 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
MBD2Q9UBB5 HCN4-201ENST00000261917 7228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
MBD2Q9UBB5 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
MBD2Q9UBB5 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
MBD2Q9UBB5 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
MBD2Q9UBB5 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
MBD2Q9UBB5 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
MBD2Q9UBB5 FAM46B-201ENST00000289166 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
MBD2Q9UBB5 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
MBD2Q9UBB5 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
MBD2Q9UBB5 FAM129C-212ENST00000601861 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.43
MBD2Q9UBB5 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
MBD2Q9UBB5 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
MBD2Q9UBB5 CERCAM-202ENST00000372842 5201 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
MBD2Q9UBB5 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
MBD2Q9UBB5 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
MBD2Q9UBB5 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
MBD2Q9UBB5 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
MBD2Q9UBB5 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
MBD2Q9UBB5 FEM1AP1-201ENST00000431297 1995 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
MBD2Q9UBB5 EPS8L1-201ENST00000201647 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
MBD2Q9UBB5 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
MBD2Q9UBB5 AC008878.3-201ENST00000617428 4964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
MBD2Q9UBB5 OLFM1-205ENST00000371796 2492 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
MBD2Q9UBB5 PFKFB3-219ENST00000640683 2311 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
MBD2Q9UBB5 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
MBD2Q9UBB5 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
MBD2Q9UBB5 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
MBD2Q9UBB5 ATP10A-201ENST00000356865 6680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
MBD2Q9UBB5 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
MBD2Q9UBB5 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
MBD2Q9UBB5 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
MBD2Q9UBB5 NOP56-201ENST00000329276 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
MBD2Q9UBB5 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
MBD2Q9UBB5 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
MBD2Q9UBB5 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
MBD2Q9UBB5 SIMC1-203ENST00000429602 2694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
MBD2Q9UBB5 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
MBD2Q9UBB5 NDOR1-201ENST00000344894 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
MBD2Q9UBB5 ACHE-204ENST00000412389 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
MBD2Q9UBB5 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
MBD2Q9UBB5 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.6 ms