Protein–RNA interactions for Protein: Q9P275

USP36, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 36, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,121 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP36Q9P275 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
USP36Q9P275 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
USP36Q9P275 AC068338.2-201ENST00000563278 1430 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
USP36Q9P275 FITM1-201ENST00000267426 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
USP36Q9P275 HIST1H2AM-201ENST00000359611 393 ntAPPRIS P1 BASIC21.33■■□□□ 1.01
USP36Q9P275 NOXO1-203ENST00000397280 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
USP36Q9P275 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
USP36Q9P275 CIRBP-214ENST00000587896 1081 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
USP36Q9P275 AC133041.1-202ENST00000642053 222 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
USP36Q9P275 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
USP36Q9P275 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
USP36Q9P275 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
USP36Q9P275 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
USP36Q9P275 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
USP36Q9P275 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
USP36Q9P275 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC21.32■■□□□ 1
USP36Q9P275 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
USP36Q9P275 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
USP36Q9P275 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
USP36Q9P275 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
USP36Q9P275 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
USP36Q9P275 DHRS4-202ENST00000397074 785 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
USP36Q9P275 BMP1-204ENST00000397814 836 ntTSL 4 BASIC21.32■■□□□ 1
USP36Q9P275 CYP2T1P-201ENST00000432607 1285 ntBASIC21.32■■□□□ 1
USP36Q9P275 TSPY20P-201ENST00000450910 630 ntBASIC21.32■■□□□ 1
USP36Q9P275 CDH18-AS1-201ENST00000513573 424 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
USP36Q9P275 SNHG6-203ENST00000520944 638 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
USP36Q9P275 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
USP36Q9P275 MYO19-221ENST00000620640 1186 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
USP36Q9P275 SLC35A3-218ENST00000639994 1114 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
USP36Q9P275 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
USP36Q9P275 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
USP36Q9P275 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
USP36Q9P275 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
USP36Q9P275 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
USP36Q9P275 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
USP36Q9P275 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
USP36Q9P275 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
USP36Q9P275 CCDC74A-201ENST00000295171 1543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
USP36Q9P275 CCDC74B-201ENST00000310463 1549 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
USP36Q9P275 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
USP36Q9P275 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
USP36Q9P275 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
USP36Q9P275 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
USP36Q9P275 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
USP36Q9P275 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
USP36Q9P275 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
USP36Q9P275 SNX24-211ENST00000513881 1563 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
USP36Q9P275 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
USP36Q9P275 BST1-202ENST00000382346 1993 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
USP36Q9P275 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
USP36Q9P275 ATG101-201ENST00000336854 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
USP36Q9P275 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
USP36Q9P275 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
USP36Q9P275 MTHFS-201ENST00000258874 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
USP36Q9P275 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
USP36Q9P275 AC021660.2-201ENST00000502999 388 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
USP36Q9P275 AC008443.6-201ENST00000512508 500 ntTSL 4 BASIC21.3■■□□□ 1
USP36Q9P275 AC098934.4-201ENST00000564127 592 ntBASIC21.3■■□□□ 1
USP36Q9P275 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
USP36Q9P275 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
USP36Q9P275 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
USP36Q9P275 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
USP36Q9P275 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
USP36Q9P275 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
USP36Q9P275 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
USP36Q9P275 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
USP36Q9P275 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
USP36Q9P275 GRTP1-203ENST00000375431 1384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
USP36Q9P275 MGST3-205ENST00000367889 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
USP36Q9P275 MCHR1-202ENST00000381433 1219 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
USP36Q9P275 BET1L-204ENST00000410108 637 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
USP36Q9P275 AC099522.1-201ENST00000505955 881 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
USP36Q9P275 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
USP36Q9P275 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
USP36Q9P275 KLHDC9-201ENST00000368011 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
USP36Q9P275 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC21.28■■□□□ 1
USP36Q9P275 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
USP36Q9P275 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
USP36Q9P275 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
USP36Q9P275 OIP5-201ENST00000220514 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
USP36Q9P275 COA6-202ENST00000366613 641 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
USP36Q9P275 FNDC11-201ENST00000370097 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
USP36Q9P275 IL15RA-208ENST00000397251 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
USP36Q9P275 AP000282.1-201ENST00000454622 682 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
USP36Q9P275 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
USP36Q9P275 SEC23A-213ENST00000557280 561 ntTSL 4 BASIC21.28■■□□□ 1
USP36Q9P275 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
USP36Q9P275 IL15RA-222ENST00000622442 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
USP36Q9P275 MARS-234ENST00000630571 216 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
USP36Q9P275 MARS-235ENST00000630803 183 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
USP36Q9P275 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
USP36Q9P275 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
USP36Q9P275 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC21.28■■□□□ 1
USP36Q9P275 UBE2E3-201ENST00000392415 1347 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
USP36Q9P275 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
USP36Q9P275 ZNF644-203ENST00000361321 1253 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
USP36Q9P275 FADS3-204ENST00000525588 1254 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
USP36Q9P275 DHRS4L2-204ENST00000537912 918 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
USP36Q9P275 PLLP-204ENST00000569059 665 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59.6 ms