Protein–RNA interactions for Protein: Q9P0J7

KCMF1, E3 ubiquitin-protein ligase KCMF1, humanhuman

Predictions only

Length 381 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCMF1Q9P0J7 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC20.22■□□□□ 0.83
KCMF1Q9P0J7 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
KCMF1Q9P0J7 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
KCMF1Q9P0J7 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
KCMF1Q9P0J7 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
KCMF1Q9P0J7 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
KCMF1Q9P0J7 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
KCMF1Q9P0J7 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
KCMF1Q9P0J7 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
KCMF1Q9P0J7 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
KCMF1Q9P0J7 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
KCMF1Q9P0J7 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC20.21■□□□□ 0.83
KCMF1Q9P0J7 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
KCMF1Q9P0J7 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
KCMF1Q9P0J7 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC20.21■□□□□ 0.83
KCMF1Q9P0J7 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
KCMF1Q9P0J7 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
KCMF1Q9P0J7 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
KCMF1Q9P0J7 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
KCMF1Q9P0J7 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.83
KCMF1Q9P0J7 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC20.2■□□□□ 0.82
KCMF1Q9P0J7 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC20.2■□□□□ 0.82
KCMF1Q9P0J7 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
KCMF1Q9P0J7 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
KCMF1Q9P0J7 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
KCMF1Q9P0J7 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
KCMF1Q9P0J7 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
KCMF1Q9P0J7 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC20.2■□□□□ 0.82
KCMF1Q9P0J7 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
KCMF1Q9P0J7 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
KCMF1Q9P0J7 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
KCMF1Q9P0J7 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
KCMF1Q9P0J7 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
KCMF1Q9P0J7 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
KCMF1Q9P0J7 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
KCMF1Q9P0J7 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC20.19■□□□□ 0.82
KCMF1Q9P0J7 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
KCMF1Q9P0J7 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
KCMF1Q9P0J7 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
KCMF1Q9P0J7 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
KCMF1Q9P0J7 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
KCMF1Q9P0J7 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
KCMF1Q9P0J7 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
KCMF1Q9P0J7 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
KCMF1Q9P0J7 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
KCMF1Q9P0J7 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
KCMF1Q9P0J7 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
KCMF1Q9P0J7 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
KCMF1Q9P0J7 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
KCMF1Q9P0J7 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
KCMF1Q9P0J7 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
KCMF1Q9P0J7 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
KCMF1Q9P0J7 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
KCMF1Q9P0J7 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
KCMF1Q9P0J7 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
KCMF1Q9P0J7 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
KCMF1Q9P0J7 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
KCMF1Q9P0J7 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
KCMF1Q9P0J7 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
KCMF1Q9P0J7 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
KCMF1Q9P0J7 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
KCMF1Q9P0J7 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
KCMF1Q9P0J7 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
KCMF1Q9P0J7 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
KCMF1Q9P0J7 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
KCMF1Q9P0J7 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
KCMF1Q9P0J7 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
KCMF1Q9P0J7 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
KCMF1Q9P0J7 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
KCMF1Q9P0J7 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
KCMF1Q9P0J7 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
KCMF1Q9P0J7 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
KCMF1Q9P0J7 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
KCMF1Q9P0J7 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
KCMF1Q9P0J7 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
KCMF1Q9P0J7 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
KCMF1Q9P0J7 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
KCMF1Q9P0J7 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
KCMF1Q9P0J7 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
KCMF1Q9P0J7 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
KCMF1Q9P0J7 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
KCMF1Q9P0J7 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
KCMF1Q9P0J7 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
KCMF1Q9P0J7 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
KCMF1Q9P0J7 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
KCMF1Q9P0J7 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
KCMF1Q9P0J7 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
KCMF1Q9P0J7 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
KCMF1Q9P0J7 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
KCMF1Q9P0J7 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
KCMF1Q9P0J7 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
KCMF1Q9P0J7 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
KCMF1Q9P0J7 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
KCMF1Q9P0J7 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
KCMF1Q9P0J7 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
KCMF1Q9P0J7 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
KCMF1Q9P0J7 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
KCMF1Q9P0J7 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
KCMF1Q9P0J7 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
KCMF1Q9P0J7 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 79.9 ms