Protein–RNA interactions for Protein: Q9P035

HACD3, Very-long-chain (3R)-3-hydroxyacyl-CoA dehydratase 3, humanhuman

Predictions only

Length 362 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HACD3Q9P035 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
HACD3Q9P035 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
HACD3Q9P035 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
HACD3Q9P035 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
HACD3Q9P035 CTDP1-208ENST00000613122 5866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
HACD3Q9P035 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
HACD3Q9P035 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
HACD3Q9P035 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
HACD3Q9P035 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
HACD3Q9P035 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
HACD3Q9P035 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
HACD3Q9P035 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC21.54■■□□□ 1.04
HACD3Q9P035 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
HACD3Q9P035 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
HACD3Q9P035 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
HACD3Q9P035 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
HACD3Q9P035 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
HACD3Q9P035 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
HACD3Q9P035 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
HACD3Q9P035 LAMC3-202ENST00000361069 6133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
HACD3Q9P035 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
HACD3Q9P035 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
HACD3Q9P035 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
HACD3Q9P035 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
HACD3Q9P035 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
HACD3Q9P035 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
HACD3Q9P035 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
HACD3Q9P035 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
HACD3Q9P035 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
HACD3Q9P035 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
HACD3Q9P035 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
HACD3Q9P035 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
HACD3Q9P035 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
HACD3Q9P035 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
HACD3Q9P035 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
HACD3Q9P035 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC21.53■■□□□ 1.04
HACD3Q9P035 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
HACD3Q9P035 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
HACD3Q9P035 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
HACD3Q9P035 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
HACD3Q9P035 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
HACD3Q9P035 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
HACD3Q9P035 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC21.52■■□□□ 1.04
HACD3Q9P035 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
HACD3Q9P035 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
HACD3Q9P035 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
HACD3Q9P035 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
HACD3Q9P035 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC21.52■■□□□ 1.04
HACD3Q9P035 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
HACD3Q9P035 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
HACD3Q9P035 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
HACD3Q9P035 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
HACD3Q9P035 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
HACD3Q9P035 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
HACD3Q9P035 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
HACD3Q9P035 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
HACD3Q9P035 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
HACD3Q9P035 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
HACD3Q9P035 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
HACD3Q9P035 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
HACD3Q9P035 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
HACD3Q9P035 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
HACD3Q9P035 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
HACD3Q9P035 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
HACD3Q9P035 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
HACD3Q9P035 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
HACD3Q9P035 EMILIN2-201ENST00000254528 5910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
HACD3Q9P035 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
HACD3Q9P035 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
HACD3Q9P035 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
HACD3Q9P035 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC21.5■■□□□ 1.03
HACD3Q9P035 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
HACD3Q9P035 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
HACD3Q9P035 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
HACD3Q9P035 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
HACD3Q9P035 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
HACD3Q9P035 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
HACD3Q9P035 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
HACD3Q9P035 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
HACD3Q9P035 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
HACD3Q9P035 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
HACD3Q9P035 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
HACD3Q9P035 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
HACD3Q9P035 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
HACD3Q9P035 ZNF746-203ENST00000461958 5051 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
HACD3Q9P035 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
HACD3Q9P035 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
HACD3Q9P035 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
HACD3Q9P035 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
HACD3Q9P035 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
HACD3Q9P035 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
HACD3Q9P035 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
HACD3Q9P035 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
HACD3Q9P035 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
HACD3Q9P035 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
HACD3Q9P035 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
HACD3Q9P035 TNKS2-201ENST00000371627 6157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
HACD3Q9P035 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
HACD3Q9P035 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
HACD3Q9P035 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.2 ms