Protein–RNA interactions for Protein: Q9NZU7

CABP1, Calcium-binding protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 370 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CABP1Q9NZU7 ATG101-201ENST00000336854 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
CABP1Q9NZU7 AC068338.2-201ENST00000563278 1430 ntBASIC29.38■■■□□ 2.29
CABP1Q9NZU7 BMP1-204ENST00000397814 836 ntTSL 4 BASIC29.38■■■□□ 2.29
CABP1Q9NZU7 SLC29A4P1-201ENST00000398760 971 ntBASIC29.38■■■□□ 2.29
CABP1Q9NZU7 PET100-202ENST00000594797 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
CABP1Q9NZU7 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
CABP1Q9NZU7 BST1-202ENST00000382346 1993 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.38■■■□□ 2.29
CABP1Q9NZU7 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
CABP1Q9NZU7 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
CABP1Q9NZU7 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.37■■■□□ 2.29
CABP1Q9NZU7 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC29.37■■■□□ 2.29
CABP1Q9NZU7 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
CABP1Q9NZU7 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
CABP1Q9NZU7 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
CABP1Q9NZU7 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
CABP1Q9NZU7 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC29.37■■■□□ 2.29
CABP1Q9NZU7 KRT18P6-201ENST00000555540 1265 ntBASIC29.37■■■□□ 2.29
CABP1Q9NZU7 PFKL-212ENST00000628044 129 ntTSL 3 BASIC29.37■■■□□ 2.29
CABP1Q9NZU7 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC29.37■■■□□ 2.29
CABP1Q9NZU7 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
CABP1Q9NZU7 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.37■■■□□ 2.29
CABP1Q9NZU7 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
CABP1Q9NZU7 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.37■■■□□ 2.29
CABP1Q9NZU7 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC29.36■■■□□ 2.29
CABP1Q9NZU7 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC29.36■■■□□ 2.29
CABP1Q9NZU7 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC29.36■■■□□ 2.29
CABP1Q9NZU7 DHRS4-202ENST00000397074 785 ntTSL 5 BASIC29.36■■■□□ 2.29
CABP1Q9NZU7 GGTLC3-201ENST00000619998 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.36■■■□□ 2.29
CABP1Q9NZU7 AC013268.1-206ENST00000638368 961 ntBASIC29.36■■■□□ 2.29
CABP1Q9NZU7 AC112229.1-201ENST00000639295 961 ntBASIC29.36■■■□□ 2.29
CABP1Q9NZU7 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
CABP1Q9NZU7 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
CABP1Q9NZU7 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC29.36■■■□□ 2.29
CABP1Q9NZU7 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
CABP1Q9NZU7 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
CABP1Q9NZU7 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC29.35■■■□□ 2.29
CABP1Q9NZU7 SEC23A-213ENST00000557280 561 ntTSL 4 BASIC29.35■■■□□ 2.29
CABP1Q9NZU7 AC098934.4-201ENST00000564127 592 ntBASIC29.35■■■□□ 2.29
CABP1Q9NZU7 PLLP-204ENST00000569059 665 ntTSL 3 BASIC29.35■■■□□ 2.29
CABP1Q9NZU7 PAQR4-205ENST00000576565 842 ntTSL 2 BASIC29.35■■■□□ 2.29
CABP1Q9NZU7 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
CABP1Q9NZU7 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
CABP1Q9NZU7 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.34■■■□□ 2.29
CABP1Q9NZU7 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
CABP1Q9NZU7 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC29.34■■■□□ 2.29
CABP1Q9NZU7 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
CABP1Q9NZU7 TSPY20P-201ENST00000450910 630 ntBASIC29.34■■■□□ 2.29
CABP1Q9NZU7 SNAP23-210ENST00000564153 775 ntTSL 2 BASIC29.34■■■□□ 2.29
CABP1Q9NZU7 CIRBP-214ENST00000587896 1081 ntTSL 2 BASIC29.34■■■□□ 2.29
CABP1Q9NZU7 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.34■■■□□ 2.29
CABP1Q9NZU7 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
CABP1Q9NZU7 BID-202ENST00000342111 854 ntTSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
CABP1Q9NZU7 FAM160B1-201ENST00000369246 666 ntTSL 2 BASIC29.33■■■□□ 2.29
CABP1Q9NZU7 AC069152.1-201ENST00000438030 544 ntBASIC29.33■■■□□ 2.29
CABP1Q9NZU7 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC29.33■■■□□ 2.29
CABP1Q9NZU7 AC008443.6-201ENST00000512508 500 ntTSL 4 BASIC29.33■■■□□ 2.29
CABP1Q9NZU7 MYO19-221ENST00000620640 1186 ntTSL 2 BASIC29.33■■■□□ 2.29
CABP1Q9NZU7 GDF6-203ENST00000621429 1179 ntTSL 5 BASIC29.33■■■□□ 2.29
CABP1Q9NZU7 UBXN2B-206ENST00000638450 591 ntTSL 5 BASIC29.33■■■□□ 2.29
CABP1Q9NZU7 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC29.33■■■□□ 2.29
CABP1Q9NZU7 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC29.33■■■□□ 2.29
CABP1Q9NZU7 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
CABP1Q9NZU7 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
CABP1Q9NZU7 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
CABP1Q9NZU7 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC29.33■■■□□ 2.29
CABP1Q9NZU7 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
CABP1Q9NZU7 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.32■■■□□ 2.28
CABP1Q9NZU7 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC29.32■■■□□ 2.28
CABP1Q9NZU7 AC021660.2-201ENST00000502999 388 ntTSL 3 BASIC29.32■■■□□ 2.28
CABP1Q9NZU7 SLC35A3-218ENST00000639994 1114 ntTSL 5 BASIC29.32■■■□□ 2.28
CABP1Q9NZU7 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC29.32■■■□□ 2.28
CABP1Q9NZU7 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
CABP1Q9NZU7 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC29.31■■■□□ 2.28
CABP1Q9NZU7 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.31■■■□□ 2.28
CABP1Q9NZU7 TMEM191A-211ENST00000637163 1067 ntBASIC29.31■■■□□ 2.28
CABP1Q9NZU7 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
CABP1Q9NZU7 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.31■■■□□ 2.28
CABP1Q9NZU7 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
CABP1Q9NZU7 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
CABP1Q9NZU7 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
CABP1Q9NZU7 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
CABP1Q9NZU7 OIP5-201ENST00000220514 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
CABP1Q9NZU7 IL15RA-208ENST00000397251 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
CABP1Q9NZU7 CYP2T1P-201ENST00000432607 1285 ntBASIC29.3■■■□□ 2.28
CABP1Q9NZU7 IGFBP3-211ENST00000615754 792 ntTSL 5 BASIC29.3■■■□□ 2.28
CABP1Q9NZU7 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
CABP1Q9NZU7 IL15RA-222ENST00000622442 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
CABP1Q9NZU7 MARS-234ENST00000630571 216 ntTSL 5 BASIC29.3■■■□□ 2.28
CABP1Q9NZU7 MARS-235ENST00000630803 183 ntTSL 3 BASIC29.3■■■□□ 2.28
CABP1Q9NZU7 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
CABP1Q9NZU7 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
CABP1Q9NZU7 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
CABP1Q9NZU7 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
CABP1Q9NZU7 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
CABP1Q9NZU7 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.29■■■□□ 2.28
CABP1Q9NZU7 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
CABP1Q9NZU7 ZNF644-203ENST00000361321 1253 ntTSL 2 BASIC29.29■■■□□ 2.28
CABP1Q9NZU7 AC073210.2-201ENST00000430369 194 ntBASIC29.29■■■□□ 2.28
CABP1Q9NZU7 AC009086.2-201ENST00000449759 610 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.29■■■□□ 2.28
CABP1Q9NZU7 AC007322.4-201ENST00000509611 723 ntBASIC29.29■■■□□ 2.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22 ms