Protein–RNA interactions for Protein: Q9NZU5

LMCD1, LIM and cysteine-rich domains protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 365 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMCD1Q9NZU5 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
LMCD1Q9NZU5 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC22.89■■□□□ 1.26
LMCD1Q9NZU5 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
LMCD1Q9NZU5 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
LMCD1Q9NZU5 TPT1-AS1-210ENST00000520590 873 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
LMCD1Q9NZU5 TRIM35-203ENST00000521253 1215 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
LMCD1Q9NZU5 UNC93B6-201ENST00000525262 1143 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
LMCD1Q9NZU5 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
LMCD1Q9NZU5 AC083880.1-201ENST00000608266 535 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
LMCD1Q9NZU5 CIRBP-246ENST00000628979 1043 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
LMCD1Q9NZU5 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
LMCD1Q9NZU5 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
LMCD1Q9NZU5 GAS7-202ENST00000396115 929 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
LMCD1Q9NZU5 ASMTL-AS1-203ENST00000425740 840 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
LMCD1Q9NZU5 MMAB-206ENST00000540016 945 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
LMCD1Q9NZU5 F2RL3-202ENST00000599210 613 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
LMCD1Q9NZU5 BST1-202ENST00000382346 1993 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
LMCD1Q9NZU5 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
LMCD1Q9NZU5 NAA20-202ENST00000334982 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
LMCD1Q9NZU5 AC128676.1-201ENST00000454392 318 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
LMCD1Q9NZU5 FAM47E-204ENST00000510328 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
LMCD1Q9NZU5 AC006058.3-201ENST00000606217 1069 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
LMCD1Q9NZU5 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
LMCD1Q9NZU5 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
LMCD1Q9NZU5 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
LMCD1Q9NZU5 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
LMCD1Q9NZU5 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
LMCD1Q9NZU5 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
LMCD1Q9NZU5 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
LMCD1Q9NZU5 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
LMCD1Q9NZU5 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
LMCD1Q9NZU5 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
LMCD1Q9NZU5 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
LMCD1Q9NZU5 DNAJA4-210ENST00000489435 947 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
LMCD1Q9NZU5 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
LMCD1Q9NZU5 AP005205.2-201ENST00000577327 491 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
LMCD1Q9NZU5 MMD2-204ENST00000612910 778 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
LMCD1Q9NZU5 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
LMCD1Q9NZU5 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
LMCD1Q9NZU5 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
LMCD1Q9NZU5 STEAP1-201ENST00000297205 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
LMCD1Q9NZU5 TM4SF5-201ENST00000270560 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
LMCD1Q9NZU5 CCDC107-202ENST00000378406 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
LMCD1Q9NZU5 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
LMCD1Q9NZU5 BX276092.2-201ENST00000417668 665 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
LMCD1Q9NZU5 CCDC107-206ENST00000426546 1242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
LMCD1Q9NZU5 NREP-209ENST00000455559 698 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.85■■□□□ 1.25
LMCD1Q9NZU5 YKT6-207ENST00000496112 1270 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
LMCD1Q9NZU5 EIF3J-AS1-205ENST00000560750 1093 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
LMCD1Q9NZU5 TXNL4A-203ENST00000585474 1185 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
LMCD1Q9NZU5 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
LMCD1Q9NZU5 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
LMCD1Q9NZU5 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
LMCD1Q9NZU5 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
LMCD1Q9NZU5 RENBP-201ENST00000369997 1322 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
LMCD1Q9NZU5 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
LMCD1Q9NZU5 MTHFD1L-201ENST00000367307 1049 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
LMCD1Q9NZU5 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
LMCD1Q9NZU5 AC093787.1-201ENST00000450396 207 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
LMCD1Q9NZU5 PLEKHB1-216ENST00000543085 632 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
LMCD1Q9NZU5 C14orf144-202ENST00000555282 854 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
LMCD1Q9NZU5 ANP32AP1-202ENST00000560832 1074 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
LMCD1Q9NZU5 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
LMCD1Q9NZU5 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
LMCD1Q9NZU5 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
LMCD1Q9NZU5 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
LMCD1Q9NZU5 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
LMCD1Q9NZU5 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
LMCD1Q9NZU5 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
LMCD1Q9NZU5 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
LMCD1Q9NZU5 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
LMCD1Q9NZU5 NR5A1-202ENST00000373588 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
LMCD1Q9NZU5 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
LMCD1Q9NZU5 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
LMCD1Q9NZU5 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
LMCD1Q9NZU5 FAM167B-201ENST00000373582 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
LMCD1Q9NZU5 GTF2A2-203ENST00000396061 758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
LMCD1Q9NZU5 DHRS4-202ENST00000397074 785 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
LMCD1Q9NZU5 AC096537.1-201ENST00000437416 684 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
LMCD1Q9NZU5 SGO1-AS1-202ENST00000448208 819 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
LMCD1Q9NZU5 FMR1-AS1_2.1-201ENST00000613724 127 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
LMCD1Q9NZU5 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
LMCD1Q9NZU5 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
LMCD1Q9NZU5 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC22.83■■□□□ 1.24
LMCD1Q9NZU5 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
LMCD1Q9NZU5 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
LMCD1Q9NZU5 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
LMCD1Q9NZU5 SH3GLB2-202ENST00000372559 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
LMCD1Q9NZU5 UNC93B4-201ENST00000505679 747 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
LMCD1Q9NZU5 AC089999.2-201ENST00000552525 248 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
LMCD1Q9NZU5 PLLP-204ENST00000569059 665 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
LMCD1Q9NZU5 DEDD2-205ENST00000596251 1183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
LMCD1Q9NZU5 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
LMCD1Q9NZU5 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
LMCD1Q9NZU5 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
LMCD1Q9NZU5 KCNA2-206ENST00000638477 1524 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
LMCD1Q9NZU5 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
LMCD1Q9NZU5 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
LMCD1Q9NZU5 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
LMCD1Q9NZU5 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51 ms