Protein–RNA interactions for Protein: Q9NYL9

TMOD3, Tropomodulin-3, humanhuman

Predictions only

Length 352 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMOD3Q9NYL9 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
TMOD3Q9NYL9 LINC02531-201ENST00000404689 593 ntTSL 5 BASIC27.71■■■□□ 2.03
TMOD3Q9NYL9 AC093827.2-201ENST00000512654 315 ntBASIC27.71■■■□□ 2.03
TMOD3Q9NYL9 DET1-205ENST00000558413 583 ntTSL 4 BASIC27.71■■■□□ 2.03
TMOD3Q9NYL9 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
TMOD3Q9NYL9 AC092118.2-201ENST00000613495 667 ntBASIC27.71■■■□□ 2.03
TMOD3Q9NYL9 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
TMOD3Q9NYL9 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC27.71■■■□□ 2.03
TMOD3Q9NYL9 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.03
TMOD3Q9NYL9 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.03
TMOD3Q9NYL9 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.7■■■□□ 2.03
TMOD3Q9NYL9 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
TMOD3Q9NYL9 AL512625.2-201ENST00000417533 625 ntBASIC27.7■■■□□ 2.02
TMOD3Q9NYL9 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
TMOD3Q9NYL9 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
TMOD3Q9NYL9 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
TMOD3Q9NYL9 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
TMOD3Q9NYL9 SDHC-201ENST00000342751 1127 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
TMOD3Q9NYL9 KRT18P29-201ENST00000397031 1267 ntBASIC27.69■■■□□ 2.02
TMOD3Q9NYL9 AP000785.1-201ENST00000527314 613 ntTSL 4 BASIC27.69■■■□□ 2.02
TMOD3Q9NYL9 AL772284.2-201ENST00000620151 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
TMOD3Q9NYL9 AL160396.2-202ENST00000636692 566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
TMOD3Q9NYL9 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
TMOD3Q9NYL9 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC27.69■■■□□ 2.02
TMOD3Q9NYL9 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
TMOD3Q9NYL9 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
TMOD3Q9NYL9 TMEM263-203ENST00000547242 811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
TMOD3Q9NYL9 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
TMOD3Q9NYL9 ACOT8-201ENST00000217455 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
TMOD3Q9NYL9 TPT1-AS1-210ENST00000520590 873 ntTSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
TMOD3Q9NYL9 COX6C-208ENST00000522940 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.67■■■□□ 2.02
TMOD3Q9NYL9 PTGER2-202ENST00000557436 643 ntTSL 3 BASIC27.67■■■□□ 2.02
TMOD3Q9NYL9 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC27.67■■■□□ 2.02
TMOD3Q9NYL9 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC27.67■■■□□ 2.02
TMOD3Q9NYL9 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
TMOD3Q9NYL9 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
TMOD3Q9NYL9 MMP23B-202ENST00000378675 1309 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
TMOD3Q9NYL9 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
TMOD3Q9NYL9 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
TMOD3Q9NYL9 RNPS1-201ENST00000301730 1276 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.66■■■□□ 2.02
TMOD3Q9NYL9 MRPL12-201ENST00000333676 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
TMOD3Q9NYL9 BX276092.2-201ENST00000417668 665 ntBASIC27.66■■■□□ 2.02
TMOD3Q9NYL9 ATPIF1-203ENST00000468425 539 ntTSL 2 BASIC27.66■■■□□ 2.02
TMOD3Q9NYL9 KHDRBS1-204ENST00000492989 1215 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
TMOD3Q9NYL9 LIMD2-206ENST00000578993 602 ntTSL 3 BASIC27.66■■■□□ 2.02
TMOD3Q9NYL9 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
TMOD3Q9NYL9 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC27.66■■■□□ 2.02
TMOD3Q9NYL9 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
TMOD3Q9NYL9 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
TMOD3Q9NYL9 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC27.66■■■□□ 2.02
TMOD3Q9NYL9 KCNQ2-201ENST00000344425 1426 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
TMOD3Q9NYL9 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
TMOD3Q9NYL9 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
TMOD3Q9NYL9 CLN3-240ENST00000631023 1586 ntTSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
TMOD3Q9NYL9 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
TMOD3Q9NYL9 GCC2-AS1-201ENST00000322353 558 ntTSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
TMOD3Q9NYL9 AL391244.2-201ENST00000428932 543 ntTSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
TMOD3Q9NYL9 ZNF346-203ENST00000503425 1191 ntTSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
TMOD3Q9NYL9 AC105001.1-201ENST00000506149 821 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
TMOD3Q9NYL9 AC106738.2-202ENST00000558156 533 ntTSL 4 BASIC27.65■■■□□ 2.02
TMOD3Q9NYL9 DHPS-223ENST00000614126 1124 ntTSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
TMOD3Q9NYL9 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
TMOD3Q9NYL9 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC27.65■■■□□ 2.02
TMOD3Q9NYL9 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
TMOD3Q9NYL9 GSEC-202ENST00000629441 1572 ntTSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
TMOD3Q9NYL9 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
TMOD3Q9NYL9 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
TMOD3Q9NYL9 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
TMOD3Q9NYL9 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.02
TMOD3Q9NYL9 PRORSD1P-201ENST00000295112 541 ntBASIC27.64■■■□□ 2.02
TMOD3Q9NYL9 POLR2J-202ENST00000393794 784 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
TMOD3Q9NYL9 LINC01191-201ENST00000412690 844 ntTSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.02
TMOD3Q9NYL9 FAM219B-212ENST00000565772 1249 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
TMOD3Q9NYL9 PRORSD1P-203ENST00000579162 626 ntTSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.02
TMOD3Q9NYL9 GPX1-204ENST00000620890 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.02
TMOD3Q9NYL9 ADD3-AS1-204ENST00000627565 388 ntTSL 3 BASIC27.64■■■□□ 2.02
TMOD3Q9NYL9 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.02
TMOD3Q9NYL9 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC27.64■■■□□ 2.02
TMOD3Q9NYL9 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
TMOD3Q9NYL9 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
TMOD3Q9NYL9 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
TMOD3Q9NYL9 AKAIN1-201ENST00000434239 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
TMOD3Q9NYL9 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
TMOD3Q9NYL9 LINC02199-202ENST00000510067 1008 ntTSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
TMOD3Q9NYL9 FGF13-208ENST00000626909 1039 ntTSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
TMOD3Q9NYL9 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
TMOD3Q9NYL9 AC083805.3-201ENST00000619560 1315 ntTSL 3 BASIC27.63■■■□□ 2.01
TMOD3Q9NYL9 HAUS4-203ENST00000347758 1428 ntTSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
TMOD3Q9NYL9 ZNF580-201ENST00000325333 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
TMOD3Q9NYL9 ASIP-201ENST00000374954 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
TMOD3Q9NYL9 ZNF580-203ENST00000545125 1025 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.62■■■□□ 2.01
TMOD3Q9NYL9 AC083880.1-201ENST00000608266 535 ntBASIC27.62■■■□□ 2.01
TMOD3Q9NYL9 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
TMOD3Q9NYL9 TMEM176B-203ENST00000434545 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
TMOD3Q9NYL9 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
TMOD3Q9NYL9 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
TMOD3Q9NYL9 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
TMOD3Q9NYL9 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
TMOD3Q9NYL9 MEA1-201ENST00000244711 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
TMOD3Q9NYL9 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.2 ms