Protein–RNA interactions for Protein: Q9NYD6

HOXC10, Homeobox protein Hox-C10, humanhuman

Predictions only

Length 342 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXC10Q9NYD6 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
HOXC10Q9NYD6 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
HOXC10Q9NYD6 ZNF644-203ENST00000361321 1253 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
HOXC10Q9NYD6 FNDC11-201ENST00000370097 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
HOXC10Q9NYD6 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
HOXC10Q9NYD6 CIRBP-214ENST00000587896 1081 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
HOXC10Q9NYD6 SLC35A3-218ENST00000639994 1114 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
HOXC10Q9NYD6 BST1-202ENST00000382346 1993 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.52
HOXC10Q9NYD6 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
HOXC10Q9NYD6 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
HOXC10Q9NYD6 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
HOXC10Q9NYD6 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
HOXC10Q9NYD6 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
HOXC10Q9NYD6 BHLHA15-201ENST00000314018 706 ntAPPRIS P1 BASIC24.57■■□□□ 1.52
HOXC10Q9NYD6 MGST3-205ENST00000367889 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
HOXC10Q9NYD6 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
HOXC10Q9NYD6 TSPY20P-201ENST00000450910 630 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
HOXC10Q9NYD6 AC021660.2-201ENST00000502999 388 ntTSL 3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
HOXC10Q9NYD6 BHLHA15-202ENST00000609256 796 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
HOXC10Q9NYD6 ATG101-201ENST00000336854 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
HOXC10Q9NYD6 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
HOXC10Q9NYD6 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
HOXC10Q9NYD6 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
HOXC10Q9NYD6 RWDD4-206ENST00000512740 1393 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
HOXC10Q9NYD6 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
HOXC10Q9NYD6 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
HOXC10Q9NYD6 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
HOXC10Q9NYD6 DHRS4-202ENST00000397074 785 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
HOXC10Q9NYD6 CDH18-AS1-201ENST00000513573 424 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
HOXC10Q9NYD6 MAGIX-202ENST00000595224 1238 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
HOXC10Q9NYD6 OR10C1-204ENST00000622521 1039 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
HOXC10Q9NYD6 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC24.56■■□□□ 1.52
HOXC10Q9NYD6 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
HOXC10Q9NYD6 KLHDC9-201ENST00000368011 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
HOXC10Q9NYD6 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
HOXC10Q9NYD6 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
HOXC10Q9NYD6 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
HOXC10Q9NYD6 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
HOXC10Q9NYD6 GRTP1-203ENST00000375431 1384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
HOXC10Q9NYD6 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
HOXC10Q9NYD6 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
HOXC10Q9NYD6 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
HOXC10Q9NYD6 IL15RA-208ENST00000397251 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
HOXC10Q9NYD6 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
HOXC10Q9NYD6 MIR4758-201ENST00000577688 71 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
HOXC10Q9NYD6 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
HOXC10Q9NYD6 IL15RA-222ENST00000622442 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
HOXC10Q9NYD6 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
HOXC10Q9NYD6 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
HOXC10Q9NYD6 UBE2E3-201ENST00000392415 1347 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.55■■□□□ 1.52
HOXC10Q9NYD6 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
HOXC10Q9NYD6 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
HOXC10Q9NYD6 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
HOXC10Q9NYD6 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
HOXC10Q9NYD6 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
HOXC10Q9NYD6 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
HOXC10Q9NYD6 AC099522.1-201ENST00000505955 881 ntTSL 3 BASIC24.54■■□□□ 1.52
HOXC10Q9NYD6 DHRS4L2-204ENST00000537912 918 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
HOXC10Q9NYD6 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
HOXC10Q9NYD6 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
HOXC10Q9NYD6 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
HOXC10Q9NYD6 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
HOXC10Q9NYD6 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
HOXC10Q9NYD6 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
HOXC10Q9NYD6 SNX24-211ENST00000513881 1563 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
HOXC10Q9NYD6 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
HOXC10Q9NYD6 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
HOXC10Q9NYD6 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
HOXC10Q9NYD6 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
HOXC10Q9NYD6 TM4SF5-201ENST00000270560 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
HOXC10Q9NYD6 AL512625.2-201ENST00000417533 625 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
HOXC10Q9NYD6 DHPS-223ENST00000614126 1124 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
HOXC10Q9NYD6 AC008694.1-202ENST00000636953 945 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
HOXC10Q9NYD6 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
HOXC10Q9NYD6 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
HOXC10Q9NYD6 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
HOXC10Q9NYD6 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC24.52■■□□□ 1.52
HOXC10Q9NYD6 MED10-201ENST00000255764 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
HOXC10Q9NYD6 COA6-202ENST00000366613 641 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
HOXC10Q9NYD6 CYP2T1P-201ENST00000432607 1285 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
HOXC10Q9NYD6 ZNF148-203ENST00000468369 1025 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
HOXC10Q9NYD6 FADS3-204ENST00000525588 1254 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
HOXC10Q9NYD6 CIRBP-211ENST00000586773 942 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
HOXC10Q9NYD6 TARDBP-228ENST00000629725 1031 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
HOXC10Q9NYD6 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
HOXC10Q9NYD6 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
HOXC10Q9NYD6 FASTK-217ENST00000540185 1609 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
HOXC10Q9NYD6 MREG-201ENST00000263268 1314 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
HOXC10Q9NYD6 STEAP1-201ENST00000297205 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
HOXC10Q9NYD6 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
HOXC10Q9NYD6 MKRN4P-201ENST00000444706 1521 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
HOXC10Q9NYD6 MIPEPP3-201ENST00000412105 444 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
HOXC10Q9NYD6 FAM47E-204ENST00000510328 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
HOXC10Q9NYD6 Z92544.1-201ENST00000567091 730 ntTSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
HOXC10Q9NYD6 PLLP-204ENST00000569059 665 ntTSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
HOXC10Q9NYD6 TNNI3-207ENST00000588882 669 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
HOXC10Q9NYD6 ABHD1-207ENST00000621324 1078 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
HOXC10Q9NYD6 GDF6-203ENST00000621429 1179 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
HOXC10Q9NYD6 MARS-234ENST00000630571 216 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
HOXC10Q9NYD6 MARS-235ENST00000630803 183 ntTSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.6 ms