Protein–RNA interactions for Protein: Q9NXI6

RNF186, RING finger protein 186, humanhuman

Predictions only

Length 227 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNF186Q9NXI6 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
RNF186Q9NXI6 AC122129.2-201ENST00000583598 466 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
RNF186Q9NXI6 WDR37-206ENST00000620998 1303 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
RNF186Q9NXI6 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
RNF186Q9NXI6 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
RNF186Q9NXI6 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
RNF186Q9NXI6 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC24.73■■□□□ 1.55
RNF186Q9NXI6 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
RNF186Q9NXI6 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
RNF186Q9NXI6 PTX4-203ENST00000447419 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
RNF186Q9NXI6 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
RNF186Q9NXI6 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
RNF186Q9NXI6 CCS-208ENST00000533244 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
RNF186Q9NXI6 EEF1D-225ENST00000529272 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
RNF186Q9NXI6 IMMP2L-201ENST00000331762 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
RNF186Q9NXI6 ELAVL3-202ENST00000438662 1223 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
RNF186Q9NXI6 GCFC2-207ENST00000470503 1066 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
RNF186Q9NXI6 SFXN1-203ENST00000502393 637 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
RNF186Q9NXI6 NUBP2-206ENST00000565134 815 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
RNF186Q9NXI6 SPIB-206ENST00000596074 847 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
RNF186Q9NXI6 AC010531.6-201ENST00000602282 401 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
RNF186Q9NXI6 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
RNF186Q9NXI6 DHRS11-210ENST00000611337 1341 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
RNF186Q9NXI6 GGTLC1-201ENST00000278765 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
RNF186Q9NXI6 FAM72A-203ENST00000367129 676 ntTSL 3 BASIC24.72■■□□□ 1.55
RNF186Q9NXI6 LCN8-201ENST00000371688 867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
RNF186Q9NXI6 TSPAN14-205ENST00000372158 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
RNF186Q9NXI6 PET117-201ENST00000432901 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
RNF186Q9NXI6 FAM72A-205ENST00000468509 629 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
RNF186Q9NXI6 ABCC3-217ENST00000515707 656 ntTSL 3 BASIC24.72■■□□□ 1.55
RNF186Q9NXI6 BX088651.1-201ENST00000540551 451 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
RNF186Q9NXI6 AL162412.1-201ENST00000567129 965 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
RNF186Q9NXI6 AP2S1-207ENST00000599990 829 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
RNF186Q9NXI6 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
RNF186Q9NXI6 ATP6V0E2-211ENST00000606024 893 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
RNF186Q9NXI6 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
RNF186Q9NXI6 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
RNF186Q9NXI6 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
RNF186Q9NXI6 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
RNF186Q9NXI6 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
RNF186Q9NXI6 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
RNF186Q9NXI6 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
RNF186Q9NXI6 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
RNF186Q9NXI6 HAUS1-201ENST00000282058 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
RNF186Q9NXI6 OGG1-209ENST00000383826 1069 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
RNF186Q9NXI6 ART5-202ENST00000397067 1154 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
RNF186Q9NXI6 CCDC74B-204ENST00000409234 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
RNF186Q9NXI6 HTT-AS-201ENST00000503893 515 ntTSL 4 BASIC24.71■■□□□ 1.55
RNF186Q9NXI6 MCRIP1-206ENST00000573478 1123 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
RNF186Q9NXI6 AC013268.1-201ENST00000639717 1208 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
RNF186Q9NXI6 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
RNF186Q9NXI6 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
RNF186Q9NXI6 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
RNF186Q9NXI6 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
RNF186Q9NXI6 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
RNF186Q9NXI6 TSTD1-202ENST00000368023 574 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
RNF186Q9NXI6 LSM12P1-201ENST00000411836 588 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
RNF186Q9NXI6 AC114730.2-201ENST00000417267 668 ntTSL 3 BASIC24.7■■□□□ 1.54
RNF186Q9NXI6 GPX1-202ENST00000419783 1146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
RNF186Q9NXI6 LINC02199-202ENST00000510067 1008 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
RNF186Q9NXI6 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
RNF186Q9NXI6 FFAR3-202ENST00000594310 1182 ntAPPRIS P1 BASIC24.7■■□□□ 1.54
RNF186Q9NXI6 AL591742.1-201ENST00000604433 565 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
RNF186Q9NXI6 DHPS-223ENST00000614126 1124 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
RNF186Q9NXI6 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
RNF186Q9NXI6 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
RNF186Q9NXI6 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
RNF186Q9NXI6 RALGPS1-206ENST00000394011 819 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
RNF186Q9NXI6 MAGI2-AS3-202ENST00000422093 762 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
RNF186Q9NXI6 ABHD17AP6-201ENST00000458502 1044 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
RNF186Q9NXI6 PDCD10-202ENST00000461494 934 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.69■■□□□ 1.54
RNF186Q9NXI6 AC090527.2-201ENST00000564080 1060 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.69■■□□□ 1.54
RNF186Q9NXI6 RN7SL471P-201ENST00000580476 299 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
RNF186Q9NXI6 AQP4-AS1-204ENST00000582605 525 ntTSL 4 BASIC24.69■■□□□ 1.54
RNF186Q9NXI6 ZNF134-203ENST00000600344 483 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
RNF186Q9NXI6 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
RNF186Q9NXI6 SMARCB1-202ENST00000344921 1728 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
RNF186Q9NXI6 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
RNF186Q9NXI6 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
RNF186Q9NXI6 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
RNF186Q9NXI6 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
RNF186Q9NXI6 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
RNF186Q9NXI6 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
RNF186Q9NXI6 PTPMT1-202ENST00000326674 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
RNF186Q9NXI6 NDUFA8-201ENST00000373768 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
RNF186Q9NXI6 HP1BP3-202ENST00000375000 928 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
RNF186Q9NXI6 AC092718.1-201ENST00000501068 1088 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
RNF186Q9NXI6 SELENOS-203ENST00000526049 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
RNF186Q9NXI6 CDKN2A-213ENST00000579122 666 ntTSL 3 BASIC24.68■■□□□ 1.54
RNF186Q9NXI6 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
RNF186Q9NXI6 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
RNF186Q9NXI6 SMUG1-202ENST00000337581 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
RNF186Q9NXI6 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
RNF186Q9NXI6 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
RNF186Q9NXI6 FBL-201ENST00000221801 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
RNF186Q9NXI6 GAR1-201ENST00000226796 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
RNF186Q9NXI6 SLX1A-201ENST00000251303 1091 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
RNF186Q9NXI6 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
RNF186Q9NXI6 SLX1B-201ENST00000330181 1165 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
RNF186Q9NXI6 CYYR1-202ENST00000400043 735 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.3 ms