Protein–RNA interactions for Protein: Q9NX04

C1orf109, Uncharacterized protein C1orf109, humanhuman

Predictions only

Length 203 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C1orf109Q9NX04 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
C1orf109Q9NX04 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
C1orf109Q9NX04 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
C1orf109Q9NX04 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
C1orf109Q9NX04 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
C1orf109Q9NX04 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
C1orf109Q9NX04 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
C1orf109Q9NX04 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
C1orf109Q9NX04 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
C1orf109Q9NX04 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
C1orf109Q9NX04 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
C1orf109Q9NX04 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
C1orf109Q9NX04 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
C1orf109Q9NX04 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
C1orf109Q9NX04 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
C1orf109Q9NX04 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
C1orf109Q9NX04 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
C1orf109Q9NX04 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
C1orf109Q9NX04 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
C1orf109Q9NX04 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
C1orf109Q9NX04 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
C1orf109Q9NX04 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
C1orf109Q9NX04 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
C1orf109Q9NX04 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
C1orf109Q9NX04 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
C1orf109Q9NX04 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
C1orf109Q9NX04 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
C1orf109Q9NX04 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
C1orf109Q9NX04 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
C1orf109Q9NX04 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
C1orf109Q9NX04 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
C1orf109Q9NX04 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
C1orf109Q9NX04 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
C1orf109Q9NX04 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
C1orf109Q9NX04 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
C1orf109Q9NX04 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
C1orf109Q9NX04 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
C1orf109Q9NX04 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
C1orf109Q9NX04 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
C1orf109Q9NX04 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
C1orf109Q9NX04 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
C1orf109Q9NX04 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
C1orf109Q9NX04 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
C1orf109Q9NX04 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
C1orf109Q9NX04 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
C1orf109Q9NX04 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
C1orf109Q9NX04 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
C1orf109Q9NX04 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
C1orf109Q9NX04 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
C1orf109Q9NX04 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
C1orf109Q9NX04 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
C1orf109Q9NX04 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
C1orf109Q9NX04 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC20.43■□□□□ 0.86
C1orf109Q9NX04 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
C1orf109Q9NX04 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
C1orf109Q9NX04 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
C1orf109Q9NX04 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
C1orf109Q9NX04 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
C1orf109Q9NX04 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
C1orf109Q9NX04 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
C1orf109Q9NX04 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
C1orf109Q9NX04 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
C1orf109Q9NX04 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
C1orf109Q9NX04 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
C1orf109Q9NX04 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
C1orf109Q9NX04 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
C1orf109Q9NX04 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC20.42■□□□□ 0.86
C1orf109Q9NX04 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
C1orf109Q9NX04 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
C1orf109Q9NX04 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
C1orf109Q9NX04 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC20.42■□□□□ 0.86
C1orf109Q9NX04 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
C1orf109Q9NX04 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
C1orf109Q9NX04 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
C1orf109Q9NX04 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
C1orf109Q9NX04 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC20.41■□□□□ 0.86
C1orf109Q9NX04 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
C1orf109Q9NX04 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC20.41■□□□□ 0.86
C1orf109Q9NX04 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC20.41■□□□□ 0.86
C1orf109Q9NX04 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
C1orf109Q9NX04 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC20.41■□□□□ 0.86
C1orf109Q9NX04 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC20.41■□□□□ 0.86
C1orf109Q9NX04 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
C1orf109Q9NX04 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC20.41■□□□□ 0.86
C1orf109Q9NX04 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
C1orf109Q9NX04 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
C1orf109Q9NX04 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
C1orf109Q9NX04 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
C1orf109Q9NX04 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
C1orf109Q9NX04 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
C1orf109Q9NX04 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
C1orf109Q9NX04 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
C1orf109Q9NX04 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
C1orf109Q9NX04 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
C1orf109Q9NX04 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
C1orf109Q9NX04 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
C1orf109Q9NX04 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
C1orf109Q9NX04 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
C1orf109Q9NX04 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC20.4■□□□□ 0.86
C1orf109Q9NX04 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.5 ms