Protein–RNA interactions for Protein: Q9NUW8

TDP1, Tyrosyl-DNA phosphodiesterase 1, humanhuman

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Length 608 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TDP1Q9NUW8 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TDP1Q9NUW8 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TDP1Q9NUW8 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
TDP1Q9NUW8 CAMTA1-216ENST00000557126 486 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
TDP1Q9NUW8 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
TDP1Q9NUW8 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TDP1Q9NUW8 SIRT3-202ENST00000524564 1395 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
TDP1Q9NUW8 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
TDP1Q9NUW8 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TDP1Q9NUW8 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
TDP1Q9NUW8 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
TDP1Q9NUW8 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TDP1Q9NUW8 GUSBP6-202ENST00000438529 1198 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
TDP1Q9NUW8 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
TDP1Q9NUW8 AP005205.2-201ENST00000577327 491 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
TDP1Q9NUW8 AL136982.7-201ENST00000609363 465 ntTSL 4 BASIC22.06■■□□□ 1.12
TDP1Q9NUW8 AC013268.1-206ENST00000638368 961 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
TDP1Q9NUW8 AC112229.1-201ENST00000639295 961 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
TDP1Q9NUW8 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TDP1Q9NUW8 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TDP1Q9NUW8 UNC119-202ENST00000335765 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TDP1Q9NUW8 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC22.05■■□□□ 1.12
TDP1Q9NUW8 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TDP1Q9NUW8 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TDP1Q9NUW8 NFS1-201ENST00000306750 738 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TDP1Q9NUW8 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TDP1Q9NUW8 C19orf81-201ENST00000425202 765 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
TDP1Q9NUW8 AC009086.2-201ENST00000449759 610 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
TDP1Q9NUW8 TERF1P5-201ENST00000477545 1207 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
TDP1Q9NUW8 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TDP1Q9NUW8 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
TDP1Q9NUW8 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TDP1Q9NUW8 AC074212.1-201ENST00000559756 1402 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
TDP1Q9NUW8 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
TDP1Q9NUW8 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
TDP1Q9NUW8 BMP1-204ENST00000397814 836 ntTSL 4 BASIC22.04■■□□□ 1.12
TDP1Q9NUW8 SLC29A4P1-201ENST00000398760 971 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
TDP1Q9NUW8 PACRGL-206ENST00000502374 1034 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
TDP1Q9NUW8 AF201337.1-201ENST00000520239 748 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
TDP1Q9NUW8 NCAPD3-204ENST00000526422 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
TDP1Q9NUW8 IL34-204ENST00000566361 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
TDP1Q9NUW8 AC133552.2-202ENST00000575694 574 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
TDP1Q9NUW8 ELAC1-204ENST00000591429 975 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
TDP1Q9NUW8 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
TDP1Q9NUW8 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
TDP1Q9NUW8 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
TDP1Q9NUW8 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
TDP1Q9NUW8 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
TDP1Q9NUW8 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
TDP1Q9NUW8 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TDP1Q9NUW8 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TDP1Q9NUW8 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
TDP1Q9NUW8 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TDP1Q9NUW8 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TDP1Q9NUW8 APTR-203ENST00000430801 583 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
TDP1Q9NUW8 APTR-205ENST00000447009 902 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
TDP1Q9NUW8 AL691442.1-201ENST00000505139 1042 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
TDP1Q9NUW8 SCO2-203ENST00000535425 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
TDP1Q9NUW8 SNAP23-210ENST00000564153 775 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
TDP1Q9NUW8 GGTLC3-201ENST00000619998 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
TDP1Q9NUW8 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TDP1Q9NUW8 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TDP1Q9NUW8 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TDP1Q9NUW8 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TDP1Q9NUW8 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
TDP1Q9NUW8 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
TDP1Q9NUW8 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
TDP1Q9NUW8 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
TDP1Q9NUW8 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
TDP1Q9NUW8 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
TDP1Q9NUW8 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
TDP1Q9NUW8 UBE2C-203ENST00000352551 665 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
TDP1Q9NUW8 UQCRFS1P1-201ENST00000435169 820 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
TDP1Q9NUW8 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
TDP1Q9NUW8 TP53I11-215ENST00000531928 1078 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
TDP1Q9NUW8 DHRS4-207ENST00000559632 1003 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
TDP1Q9NUW8 AC007216.1-201ENST00000570197 601 ntTSL 4 BASIC22.02■■□□□ 1.12
TDP1Q9NUW8 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
TDP1Q9NUW8 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
TDP1Q9NUW8 PFKL-212ENST00000628044 129 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
TDP1Q9NUW8 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
TDP1Q9NUW8 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
TDP1Q9NUW8 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.11
TDP1Q9NUW8 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
TDP1Q9NUW8 RAPSN-205ENST00000529341 1408 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TDP1Q9NUW8 AC105036.2-201ENST00000569468 176 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
TDP1Q9NUW8 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TDP1Q9NUW8 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
TDP1Q9NUW8 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
TDP1Q9NUW8 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
TDP1Q9NUW8 CD8B-205ENST00000393761 932 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
TDP1Q9NUW8 CD8B-206ENST00000431506 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
TDP1Q9NUW8 AC021660.2-201ENST00000502999 388 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
TDP1Q9NUW8 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
TDP1Q9NUW8 AL138781.1-201ENST00000566567 1274 ntBASIC22■■□□□ 1.11
TDP1Q9NUW8 PET100-202ENST00000594797 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
TDP1Q9NUW8 AC018730.2-201ENST00000598623 443 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
TDP1Q9NUW8 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
TDP1Q9NUW8 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
TDP1Q9NUW8 CCDC74A-201ENST00000295171 1543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
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