Protein–RNA interactions for Protein: Q9NUC0

SERTAD4, SERTA domain-containing protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 356 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SERTAD4Q9NUC0 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SERTAD4Q9NUC0 HR-202ENST00000381418 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SERTAD4Q9NUC0 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SERTAD4Q9NUC0 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SERTAD4Q9NUC0 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SERTAD4Q9NUC0 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
SERTAD4Q9NUC0 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SERTAD4Q9NUC0 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SERTAD4Q9NUC0 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SERTAD4Q9NUC0 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SERTAD4Q9NUC0 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SERTAD4Q9NUC0 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SERTAD4Q9NUC0 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SERTAD4Q9NUC0 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SERTAD4Q9NUC0 NAT8L-201ENST00000331662 5571 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SERTAD4Q9NUC0 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
SERTAD4Q9NUC0 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SERTAD4Q9NUC0 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SERTAD4Q9NUC0 RREB1-203ENST00000379933 5826 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SERTAD4Q9NUC0 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
SERTAD4Q9NUC0 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SERTAD4Q9NUC0 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
SERTAD4Q9NUC0 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SERTAD4Q9NUC0 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
SERTAD4Q9NUC0 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
SERTAD4Q9NUC0 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SERTAD4Q9NUC0 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SERTAD4Q9NUC0 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SERTAD4Q9NUC0 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
SERTAD4Q9NUC0 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
SERTAD4Q9NUC0 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
SERTAD4Q9NUC0 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
SERTAD4Q9NUC0 BTBD11-201ENST00000280758 5767 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
SERTAD4Q9NUC0 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SERTAD4Q9NUC0 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
SERTAD4Q9NUC0 MACROD2-201ENST00000217246 4994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
SERTAD4Q9NUC0 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
SERTAD4Q9NUC0 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
SERTAD4Q9NUC0 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
SERTAD4Q9NUC0 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
SERTAD4Q9NUC0 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
SERTAD4Q9NUC0 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
SERTAD4Q9NUC0 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
SERTAD4Q9NUC0 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
SERTAD4Q9NUC0 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
SERTAD4Q9NUC0 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
SERTAD4Q9NUC0 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
SERTAD4Q9NUC0 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
SERTAD4Q9NUC0 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
SERTAD4Q9NUC0 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
SERTAD4Q9NUC0 ADAMTS19-201ENST00000274487 5234 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
SERTAD4Q9NUC0 ZNRF1-202ENST00000335325 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
SERTAD4Q9NUC0 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
SERTAD4Q9NUC0 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC17.33■□□□□ 0.37
SERTAD4Q9NUC0 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
SERTAD4Q9NUC0 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
SERTAD4Q9NUC0 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
SERTAD4Q9NUC0 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
SERTAD4Q9NUC0 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
SERTAD4Q9NUC0 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
SERTAD4Q9NUC0 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
SERTAD4Q9NUC0 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
SERTAD4Q9NUC0 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
SERTAD4Q9NUC0 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
SERTAD4Q9NUC0 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
SERTAD4Q9NUC0 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
SERTAD4Q9NUC0 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC17.33■□□□□ 0.36
SERTAD4Q9NUC0 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
SERTAD4Q9NUC0 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
SERTAD4Q9NUC0 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
SERTAD4Q9NUC0 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
SERTAD4Q9NUC0 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
SERTAD4Q9NUC0 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
SERTAD4Q9NUC0 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
SERTAD4Q9NUC0 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
SERTAD4Q9NUC0 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
SERTAD4Q9NUC0 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
SERTAD4Q9NUC0 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
SERTAD4Q9NUC0 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
SERTAD4Q9NUC0 CDK13-202ENST00000340829 5066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
SERTAD4Q9NUC0 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
SERTAD4Q9NUC0 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
SERTAD4Q9NUC0 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
SERTAD4Q9NUC0 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
SERTAD4Q9NUC0 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
SERTAD4Q9NUC0 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
SERTAD4Q9NUC0 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
SERTAD4Q9NUC0 USP48-201ENST00000308271 4595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
SERTAD4Q9NUC0 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
SERTAD4Q9NUC0 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
SERTAD4Q9NUC0 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
SERTAD4Q9NUC0 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
SERTAD4Q9NUC0 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
SERTAD4Q9NUC0 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
SERTAD4Q9NUC0 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
SERTAD4Q9NUC0 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
SERTAD4Q9NUC0 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
SERTAD4Q9NUC0 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
SERTAD4Q9NUC0 AMIGO1-202ENST00000369864 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
SERTAD4Q9NUC0 GXYLT1-202ENST00000398675 7497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.7 ms