Protein–RNA interactions for Protein: Q9NSD9

FARSB, Phenylalanine--tRNA ligase beta subunit, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 589 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FARSBQ9NSD9 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
FARSBQ9NSD9 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
FARSBQ9NSD9 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
FARSBQ9NSD9 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC20.59■□□□□ 0.89
FARSBQ9NSD9 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
FARSBQ9NSD9 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
FARSBQ9NSD9 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
FARSBQ9NSD9 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
FARSBQ9NSD9 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
FARSBQ9NSD9 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
FARSBQ9NSD9 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
FARSBQ9NSD9 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
FARSBQ9NSD9 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
FARSBQ9NSD9 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
FARSBQ9NSD9 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
FARSBQ9NSD9 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
FARSBQ9NSD9 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
FARSBQ9NSD9 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
FARSBQ9NSD9 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
FARSBQ9NSD9 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
FARSBQ9NSD9 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
FARSBQ9NSD9 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC20.58■□□□□ 0.89
FARSBQ9NSD9 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
FARSBQ9NSD9 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
FARSBQ9NSD9 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.88
FARSBQ9NSD9 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
FARSBQ9NSD9 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC20.58■□□□□ 0.88
FARSBQ9NSD9 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.88
FARSBQ9NSD9 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
FARSBQ9NSD9 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
FARSBQ9NSD9 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
FARSBQ9NSD9 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
FARSBQ9NSD9 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
FARSBQ9NSD9 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
FARSBQ9NSD9 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
FARSBQ9NSD9 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
FARSBQ9NSD9 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
FARSBQ9NSD9 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC20.57■□□□□ 0.88
FARSBQ9NSD9 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
FARSBQ9NSD9 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
FARSBQ9NSD9 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
FARSBQ9NSD9 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
FARSBQ9NSD9 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
FARSBQ9NSD9 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
FARSBQ9NSD9 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
FARSBQ9NSD9 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
FARSBQ9NSD9 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
FARSBQ9NSD9 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
FARSBQ9NSD9 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
FARSBQ9NSD9 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
FARSBQ9NSD9 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
FARSBQ9NSD9 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
FARSBQ9NSD9 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
FARSBQ9NSD9 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
FARSBQ9NSD9 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
FARSBQ9NSD9 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
FARSBQ9NSD9 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
FARSBQ9NSD9 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.56■□□□□ 0.88
FARSBQ9NSD9 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
FARSBQ9NSD9 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
FARSBQ9NSD9 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
FARSBQ9NSD9 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
FARSBQ9NSD9 NR5A1-202ENST00000373588 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
FARSBQ9NSD9 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
FARSBQ9NSD9 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
FARSBQ9NSD9 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
FARSBQ9NSD9 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
FARSBQ9NSD9 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
FARSBQ9NSD9 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC20.55■□□□□ 0.88
FARSBQ9NSD9 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
FARSBQ9NSD9 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
FARSBQ9NSD9 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
FARSBQ9NSD9 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
FARSBQ9NSD9 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
FARSBQ9NSD9 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
FARSBQ9NSD9 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC20.55■□□□□ 0.88
FARSBQ9NSD9 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC20.55■□□□□ 0.88
FARSBQ9NSD9 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
FARSBQ9NSD9 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
FARSBQ9NSD9 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
FARSBQ9NSD9 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
FARSBQ9NSD9 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
FARSBQ9NSD9 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
FARSBQ9NSD9 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
FARSBQ9NSD9 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
FARSBQ9NSD9 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
FARSBQ9NSD9 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
FARSBQ9NSD9 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
FARSBQ9NSD9 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
FARSBQ9NSD9 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
FARSBQ9NSD9 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
FARSBQ9NSD9 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
FARSBQ9NSD9 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
FARSBQ9NSD9 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
FARSBQ9NSD9 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC20.54■□□□□ 0.88
FARSBQ9NSD9 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
FARSBQ9NSD9 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
FARSBQ9NSD9 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
FARSBQ9NSD9 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
FARSBQ9NSD9 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.4 ms